Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5661
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5661, 515 aa
1>>>pF1KE5661 515 - 515 aa - 515 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6458+/-0.000849; mu= 16.5541+/- 0.051
mean_var=70.5492+/-14.119, 0's: 0 Z-trim(107.4): 25 B-trim: 494 in 1/49
Lambda= 0.152696
statistics sampled from 9541 (9563) to 9541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 515) 3583 798.5 0
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 641) 3583 798.6 0
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 652) 3583 798.6 0
CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 ( 476) 1366 310.1 3.5e-84
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 1351 306.9 5.1e-83
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 ( 458) 1319 299.7 4.5e-81
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 1265 288.0 2.6e-77
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 676 158.3 4.4e-38
CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133) 664 155.6 2.7e-37
CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380) 664 155.7 3.2e-37
CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 ( 443) 593 139.8 6.1e-33
>>CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (515 aa)
initn: 3583 init1: 3583 opt: 3583 Z-score: 4263.7 bits: 798.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3583; 99.6% identity (99.6% similar) in 515 aa overlap (1-515:1-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWPYFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAWPYFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RRMASRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREM
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RRTASRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 NLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS43 LKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 FVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 YAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 PLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
490 500 510
>>CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (641 aa)
initn: 3583 init1: 3583 opt: 3583 Z-score: 4262.2 bits: 798.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3583; 99.6% identity (99.6% similar) in 515 aa overlap (1-515:127-641)
10 20 30
pF1KE5 MAWPYFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RCEGGWVRRPCRHICEGLREVCQPAFDAIDMAWPYFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGG
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEF
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEF
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 SSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHL
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIP
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 IPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPD
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 EKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKG
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKG
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 IRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMG
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 PKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPR
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 WLLKY
:::::
CCDS34 WLLKY
640
>>CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (652 aa)
initn: 3583 init1: 3583 opt: 3583 Z-score: 4262.1 bits: 798.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3583; 99.6% identity (99.6% similar) in 515 aa overlap (1-515:138-652)
10 20 30
pF1KE5 MAWPYFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RCEGGWVRRPCRHICEGLREVCQPAFDAIDMAWPYFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGG
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEF
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEF
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 SSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHL
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIP
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 IPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPD
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 EKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCF
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKG
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKG
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 IRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMG
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 PKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPR
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 WLLKY
:::::
CCDS33 WLLKY
650
>>CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 (476 aa)
initn: 1334 init1: 558 opt: 1366 Z-score: 1624.7 bits: 310.1 E(32554): 3.5e-84
Smith-Waterman score: 1366; 50.1% identity (74.1% similar) in 409 aa overlap (46-445:49-450)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASRCAHVARTYS
: : .: : .. ..: . .:. ..: :.
CCDS38 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
.::::.::::::::.:. :: :: ::: : :::.::::..:::.::.::::::.:: :
CCDS38 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
: : :...::::..::.::::.: ::.. . . : ::.:::..:::::::::
CCDS38 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KE5 YRLAETRGARSDHI------PIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVV
: . : .:. ..:. . :. :.::::::...:.. :::::::.:::::::.
CCDS38 Y-VNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNT---KLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVA
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSI---
.::.: .. . .. .: .::. .:. :.:::.. .: : : .. : : . .
CCDS38 NYPYDETRSGSAHE-YSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDGT
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 INGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLNFVETVH
::. ::: :::.::::: .:::::::::.: ::::::.: : :. ::.::....: .:
CCDS38 TNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQIH
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIK
::.:: : : :.:. :: :::.:: ::.:.: :::::::: :: . . :.:::: . :
CCDS38 RGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAITK
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARR
:: .: .. :. ::: :.
CCDS38 KVAVP--YSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
440 450 460 470
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 1282 init1: 570 opt: 1351 Z-score: 1603.9 bits: 306.9 E(32554): 5.1e-83
Smith-Waterman score: 1359; 46.7% identity (69.7% similar) in 469 aa overlap (35-494:285-733)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 YFLDCHRYFTREDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMA
:: :: . :.::.: : ......
CCDS13 LPQTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDP-LDFQHHNYKAMRKLMKQVQ
260 270 280 290 300 310
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SRCAHVARTYSIGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYL
.: ...: ::::.:..: .: :.:.:..::.::: ::::. ....::::. :::.:. :
CCDS13 EQCPNITRIYSIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGNEALGRELLLLL
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDL
:.:: :.: ::::. :::. ::::::::::::::.: .:. ::. :: : :..::
CCDS13 MQFLCHEFLRGNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWAEGRWNNQSIDL
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230
pF1KE5 NRNFPDLTSEYYRLAETRG-----ARSDHIPIPQHYWW--GKVAPETKAIMKWMQTIPFV
:.:: ::.. .. :. : . . :.:.: .: . :::::.:..:::. ::::
CCDS13 NHNFADLNTPLWE-AQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAVIKWMKRIPFV
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCG
:::.::::.::::::::... : . ..::::. .:. :: .:: . :.: :. :
CCDS13 LSANLHGGELVVSYPFDMTRTPWAARELTPTPDDAVFRWLSTVYAGSNLAMQDTSRRPCH
500 510 520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 G-NFLKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKE
. .: .:.:::::::.. :.:.::.::::::::.::::.: ::: :. : :..::.
CCDS13 SQDFSVHGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPHENELPQEWENNKD
560 570 580 590 600 610
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SLLNFVETVHRGIKGVVTDKFGK-PVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVI
.::...: :. :: ::: :: . . .: :.: :: ::.::: ::::::: :: ..:
CCDS13 ALLTYLEQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGDYWRLLTPGDYMVT
620 630 640 650 660 670
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 AQAPGYAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGE
:.: :: .: : :: : :. : ::. : .: :.. : . :
CCDS13 ASAEGYHSVT----------RNCRVTFEEGPF---PCNFV--LTKT-PKQRLRELLAAGA
680 690 700 710
480 490 500 510
pF1KE5 ATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
. :: :: :: :.:
CCDS13 KVPPD-LR-RRLERLRGQKD
720 730
>>CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 (458 aa)
initn: 1183 init1: 608 opt: 1319 Z-score: 1569.0 bits: 299.7 E(32554): 4.5e-81
Smith-Waterman score: 1319; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (46-432:21-406)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASRCAHVARTYS
. : :: : ..::.: .. ..: ..:.::
CCDS74 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
:::: .::.: :.:::..:: :: .::::: .::.::::. :::... :...:: :.
CCDS74 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
: :: .:.. ::::.::::::::::::::.: . :. ::.::...:::::::::.. :
CCDS74 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
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CCDS74 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
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CCDS74 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
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CCDS74 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
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CCDS74 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
::
CCDS74 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
410 420 430 440 450
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20 30 40 50 60 70
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:.::.: .: .... . : ...: :.::
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pF1KE5 RIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYR
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CCDS76 RIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLLWE
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200 210 220 230 240
pF1KE5 LAETRGARSDHIP--IPQHY-----WW----GKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGD
:: : ...: .:.:: :. . :: ::.:.. ::. :::::...:.::.
CCDS76 -AEDR----QNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGE
470 480 490 500 510 520
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pF1KE5 LVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGG-NFLKRGS
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CCDS76 LVVAYPYDLVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARRRVCHTEDFQKEEG
530 540 550 560 570 580
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 IINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLNFVETV
.:::.:.. .:...::.::::::::... .:: :.: : : :..:.:::. :.: :
CCDS76 TVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEEWENNRESLIVFMEQV
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pF1KE5 HRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVI
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CCDS76 HRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGEYVVTAKAEGFTAST
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pF1KE5 KKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRAR
:. .. : : : :: :. .:
CCDS76 KNCMVGYDMG-ATRCDFTLSKTNMARIREIMEKFGKQPVSLPARRLKLRGQKRRQRG
710 720 730 740 750
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20 30 40 50 60 70
pF1KE5 EGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASRCAHVARTYSIG
: :::: .: .... . .: ..::::.:
CCDS54 CMRLEVLGCSVAPVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDMRQLMKVVNEECPTITRTYSLG
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CCDS54 KSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDGNP
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pF1KE5 RIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYR
:.. :.. :::::.::.::::::::: :. ...:. : . ...:. ..::::.: .
CCDS54 RVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVLWG
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pF1KE5 LAETRGAR----SDHIPIPQHYWW--GKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSY
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CCDS54 AEERKWVPYRVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLVSY
720 730 740 750 760 770
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pF1KE5 PFDFSKHPQEEKMFSP------------------TPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSE
:.:... : .:.... :::. .:. :. ..:..: . . .
CCDS54 PYDMARTPTQEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEPYR
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pF1KE5 NRCGGNFLKRG-SIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQ
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CCDS54 GGCQAQDYTGGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPREWE
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pF1KE5 HNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIH
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CCDS54 NNKEALLTFMEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPGEY
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pF1KE5 IVIAQAPGYAKVIKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASS
: :.: ::. : . . : . .:::
CCDS54 RVTAHAEGYTPSAKTCNVDYDIG-ATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSRP
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pF1KE5 LGEATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
CCDS54 MTPQQRRLQQRRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWGL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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: :: . .: :::.:.. ...: ::.:
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CCDS56 KSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DP
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CCDS56 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQ
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... : . ::: :.:.::.. ::::::.::::.:::.::::
CCDS56 ITD-----------PTQ-------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFD--D
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: .: .::. .:. .. .:. . .:.. .: .... .: : :::.::.
CCDS56 DEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHG-ITNGASWYNV
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:::.:.:::.:::::.:.::::::.: :. : ..:..:..::..:.. ::.:..: : :
CCDS56 PGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLD
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:. . :: ::: : : .:: ::::::: :: . . :.: :: : :.: . .
CCDS56 ATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTV--KS
560 570 580 590 600 610
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pF1KE5 KRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSK
. : .:.: : . .: . : :..:: ..:..:
CCDS56 EGAIQVNFTLVRSSTDSNNE----SKKGK----GASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
620 630 640 650 660
500 510
pF1KE5 PWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
CCDS56 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
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>--
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pF1KE5 SDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMF
::::..::::..:.::::: : . . ..
CCDS56 MRFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIY
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 SPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGN---FLKRGSIINGADWYSFTGGMSDF
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CCDS56 SKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIM-KTGEPHCPGDEDETFKDG-ITNGAHWYDVEGGMQDY
40 50 60 70 80 90
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pF1KE5 NYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYTLWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKF-GKPV
::. .::::::.::.: :.:: : :..:.:::....: :: :.:: : :.. :. .
CCDS56 NYVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGL
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.:: ::: :: :.:::. ::..::: :: . . . :: . . .:.. . : .:
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pF1KE5 DFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSKPWWWSY
:: :.:
CCDS56 DFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRR
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>--
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pF1KE5 EGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASRCAHVARTYSIG
. .::: .. . :: .. :.. ..:
CCDS56 EFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLG
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.: . :.. .:.:..:. : ::.......:::: .: :.:. ::..:: .: ::
CCDS56 QSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNYK-KNP
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. .:.. ::: ..::.:::: : : . . :. ::.. ::. .: . .:.
CCDS56 AVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSK---IGQTNARGKDLDTDFTNNASQ---
780 790 800 810 820
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::::::.. .: : ::..: ::...:.::.:
CCDS56 ------------------------PETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYD--
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pF1KE5 KHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHP-MMMDRSE--NRCGGNFLKRGSIINGADWY
: . . ... .: :. ::. :: : : . :. :. :... ::.:.
CCDS56 ------KPVQTVENKETLKHLASLYANNHPSMHMGQPSCPNKSDENI--PGGVMRGAEWH
870 880 890 900 910
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: :.:.:.. . .: :::: .: :: : .:: ::.:::... ::.:..: :
CCDS56 SHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPSAARLPSLWADNKRSLLSMLVEVHKGVHGFV
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pF1KE5 TDKFGKPVKNARISV-KGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPA
:: :::...: : . .::. . : : . :: ::.: .:: : :: . ..:..
CCDS56 KDKTGKPISKAVIVLNEGIK--VQTKEGGYFHVLLAPGVHNIIAIADGYQQQHSQVFVHH
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pF1KE5 RMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADG
CCDS56 DAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFHRL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
>>CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380 aa)
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pF1KE5 REDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRMASR-CAHVART
: :. :. .. .::. :. .::
CCDS11 LGSSARAAHIKKAEATTTTTSAGAEAAEGQFDRYYHE--EELESALREAAAAGLPGLARL
30 40 50 60 70 80
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pF1KE5 YSIGRSFDGRELLVIEFSSRPGQ-----------------HELM--EPEVKLIGNIHGNE
.::::: .:: : :..... :. :. .:.:::.::.::.:
CCDS11 FSIGRSVEGRPLWVLRLTAGLGSLIPEGDAGPDAAGPDAAGPLLPGRPQVKLVGNMHGDE
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVA----AAEGAGYN
...:..:::::. : . : :.::. :::::: ..::::.::::.: : . : :
CCDS11 TVSRQVLIYLARELAAGYRRGDPRLVRLLNTTDVYLLPSLNPDGFERAREGDCGFGDGGP
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKW
. .:::.:... ::::.::: : . . : .. .::..:...:
CCDS11 SGASGRDNSRGRDLNRSFPDQFS------------TGEPPALDE------VPEVRALIEW
210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMD
.. ::::..::::..:.::::: : . . ..: : :...:: :..:::. ::.:
CCDS11 IRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIYSKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIM-K
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE5 RSENRCGGN---FLKRGSIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEAL
.: .: :. .: : : ::: ::. :::.:.::. .::::::.::.: :.:: :
CCDS11 TGEPHCPGDEDETFKDG-ITNGAHWYDVEGGMQDYNYVWANCFEITLELSCCKYPPASQL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YTLWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTDKF-GKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRL
:..:.:::....: :: :.:: : :.. :. ..:: ::: :: :.:::. ::..::
CCDS11 RQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGLENATISVAGINHNITTGRFGDFYRL
370 380 390 400 410 420
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CCDS11 AIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELYV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]