Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5626
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5626, 483 aa
1>>>pF1KE5626 483 - 483 aa - 483 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0738+/-0.000917; mu= 15.4973+/- 0.055
mean_var=100.8657+/-19.545, 0's: 0 Z-trim(107.7): 72 B-trim: 69 in 1/51
Lambda= 0.127703
statistics sampled from 9692 (9764) to 9692 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 3158 592.5 3.4e-169
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 1226 236.5 4.6e-62
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 879 172.7 1.3e-42
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 757 150.3 7.9e-36
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 757 150.3 7.9e-36
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 749 148.6 1.2e-35
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 739 147.0 8.9e-35
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 739 147.0 8.9e-35
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 701 140.0 1e-32
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 693 138.3 1.6e-32
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 691 138.1 3.1e-32
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 691 138.1 3.1e-32
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 687 137.4 6.3e-32
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 682 136.4 9.2e-32
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 673 134.6 2.1e-31
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 666 133.3 4.9e-31
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 650 130.5 5.1e-30
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 650 130.5 5.1e-30
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 635 127.7 3.3e-29
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 635 127.7 3.8e-29
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 635 127.7 3.9e-29
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 635 127.8 4e-29
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 629 126.5 5.5e-29
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 623 125.5 1.7e-28
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 605 122.0 1.2e-27
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 601 121.4 2.7e-27
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 591 119.6 9.8e-27
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 586 118.6 1.5e-26
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 560 113.9 5.1e-25
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 553 112.7 1.5e-24
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 535 109.3 1.2e-23
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 532 108.6 1.5e-23
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 527 107.7 2.8e-23
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 517 106.0 1.4e-22
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 506 103.8 3.4e-22
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 504 103.6 6.7e-22
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 504 103.6 6.8e-22
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 504 103.6 7.2e-22
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 504 103.6 7.8e-22
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 486 100.1 5e-21
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 485 100.1 7.7e-21
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 482 99.4 8.4e-21
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 482 99.4 8.4e-21
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 477 98.5 1.7e-20
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 460 95.3 1.2e-19
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 455 94.4 2.2e-19
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 423 88.6 2e-17
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 421 88.3 2.5e-17
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 403 84.9 2.2e-16
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 355 76.2 1.5e-13
>>CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 (483 aa)
initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158 Z-score: 3151.0 bits: 592.5 E(32554): 3.4e-169
Smith-Waterman score: 3158; 100.0% identity (100.0% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 PHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEAAHFDEKKEINKRKQLILEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEAAHFDEKKEINKRKQLILEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQ
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GLV
:::
CCDS12 GLV
>>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa)
initn: 1219 init1: 597 opt: 1226 Z-score: 1227.7 bits: 236.5 E(32554): 4.6e-62
Smith-Waterman score: 1232; 44.6% identity (75.6% similar) in 439 aa overlap (4-442:26-453)
10 20 30
pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILE
: .::... : : : ::: .:: .:. :: :.
CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 GRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLG
::: .: :.::::::.::.::::. : : : .: ::::::::::.::.:::..::. .:
CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 LKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLL
... .::::.: ..:.: :..:::..::::::: :::.... :... ...::::::::.:
CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 EQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQ
.. :: .... :: ..: :.:.:::::.: ...:: : ..: ... .:::.
CCDS86 NM---DFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEK
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVAL
:.: :...: : ::.:::...... . :..:: .::.. : ..::...: .. :
CCDS86 LQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGN----SFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 HSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGR
:..:.:..:...: :::.. ::.:::::::::::: :.::.: . : : :::::::
CCDS86 HGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 TARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIK
::::::.:.:::.:::::..: . ::. : ::: : ... ::... .: ..: ...
CCDS86 TARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARME
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 LEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGR
:. : ..:: . .. .. : . . ..: :.:.:.
CCDS86 LRE-HGEKKK---RSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
420 430 440 450
460 470 480
pF1KE5 AGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV
>>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa)
initn: 739 init1: 286 opt: 879 Z-score: 878.8 bits: 172.7 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 879; 33.0% identity (65.6% similar) in 488 aa overlap (4-480:220-697)
10 20 30
pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCI
: ...:: :.. .:.:::::.: .::
CCDS13 KVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQKACI
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 PAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGI---FCLVLTPTRELAYQIAEQF
:. : :.: .:: ::.::::::.::.:..: : :::.:::::. :.
CCDS13 PVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVTRVLVLVPTRELGIQVHSVT
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 RVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLV
: :.. .. :. :::.:. .: : : ..::::::: :::.. .: ...:. :.
CCDS13 RQLAQFCNITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSSIEVLI
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQ
.:::::.:.. : ... :. .:::.:::::.:: ...: ... ..: ..
CCDS13 LDEADRMLDEY---FEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIFVN
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260
pF1KE5 APVSTVEQLDQRYLLV-PEKVKD--AYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMM
. .... : :... . :.. : : .. :. : .: ...::.: : . . ..
CCDS13 SNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDH----VMLFTQTKKQAHRMHIL
430 440 450 460 470 480
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 LRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPG
: ... . ::. ..: .:. :: .::. ::.:::::.::::: :..::: . :.
CCDS13 LGLMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPN
490 500 510 520 530 540
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 LPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQ
: :.::::::::::: :....:: . . .... : . : .. . . .:.. .
CCDS13 TIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDK
550 560 570 580 590 600
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 VNVVRRECE--IKLEAAHFDEKK---EINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRR
.. .... ..::: . . .. .:: :.:. .::. .. . : . .. :..:
CCDS13 IEKMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINTAKRLLEKGKEAVVQ---EPERSWFQTKEER
610 620 630 640 650
450 460 470 480
pF1KE5 FKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV
:::. ..:.. . :.: : .....: . ..
CCDS13 KKEKIAKALQEFDLALRGKKKRKKFMKDAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFAERLAKRNR
660 670 680 690 700 710
CCDS13 RAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKSVFDEELTNTSKKALKQYRAGPSFEERKQLGLPH
720 730 740 750 760 770
>>CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (881 aa)
initn: 717 init1: 214 opt: 757 Z-score: 756.7 bits: 150.3 E(32554): 7.9e-36
Smith-Waterman score: 757; 37.8% identity (63.3% similar) in 384 aa overlap (3-375:97-471)
10 20 30
pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGC
:: .::: . . . : : :::.:
CCDS31 TFPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKT
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 IPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPY--GIFCLVLTPTRELAYQIAEQF
::.::.:.: .. :.::::::: :.::....:. : :.:.:::::: : .
CCDS31 IPVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFERLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLKFT
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 RVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLV
. ::: ::: .:.:: : : : ..: ..:::::::. :. ..........:
CCDS31 KELGKFTGLKTALILGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLV-HVAVEMSLKLQSVEYVV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQ
.::::::.:.: :. .:. :.: .:. .::.:::::: : :. . ..: . . .
CCDS31 FDEADRLFEMG---FAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLD
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260
pF1KE5 APVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQ---RFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMM
. .. ::: ..:: : .: : :.::.. : ::. ..:. : . . : .
CCDS31 VDTKLNEQLKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQ-----TVVFVATKHHAEYLTEL
310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 LRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPG
: . ..: . : :::: . ::.::.:.:::::: .. :::.. :.
CCDS31 LTTQRVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPA
360 370 380 390 400 410
330 340 350 360 370 380
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:...:::::.:::::.: : .::. :.:: . . . :.: :
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10 20 30
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CCDS44 FDEADRLFEMG---FAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLD
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. .. ::: ..:: : .: : :.::.. : ::. ..:. : . . : .
CCDS44 VDTKLNEQLKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQ-----TVVFVATKHHAEYLTEL
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: . ..: . : :::: . ::.::.:.:::::: .. :::.. :.
CCDS44 LTTQRVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPA
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330 340 350 360 370 380
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:...:::::.:::::.: : .::. :.:: . . . :.: :
CCDS44 KGKLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVD
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CCDS44 GMLGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEM
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10 20 30
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CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG
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... .::::.: ..:.: :..:::..::::::: :::.... :... ...::::::::.:
CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL
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160 170 180 190 200 210
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.. :: .... :: ..: :.:.:::::.: ...:: : ..: ... .:::.
CCDS86 NM---DFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEK
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:.: :...: : :.
CCDS86 LQQYYIFIPSKFKS----------------------------------------------
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.:...: :::.. ::.:::::::::::: :.::.: . : : :::::::
CCDS86 -------KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGR
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::::::.:.:::.:::::..: . ::. : ::: : ... ::... .: ..: ...
CCDS86 TARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARME
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CCDS86 LRE-HGEKKK---RSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR
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10 20 30
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CCDS34 ELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQT
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:. .. . . ...:. ... :. : :..:. ..: :. :.:::.. . .
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: : . :.: ..::. . : .: . . ::.. ..:.::.::.::::. . .:.:.
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. :. . :.::.:::.::: .: : :..:. : ...:.: . ::..
CCDS34 SCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWS
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. . : .. ..... .. .. .::: .. :.::.: . .. : : .
CCDS34 DFKD--QQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVD
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.. .. ....: :. . . : ::.
CCDS34 IDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQDV
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CCDS34 MQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKRY
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CCDS75 ELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQT
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CCDS75 PIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQ---ESGSVIIFVDKQEHADG
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. :. . :.::.:::.::: .: : :..:. : ...:.: . ::..
CCDS75 SCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWS
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. . : .. ..... .. .. .::: .. :.::.: . .. : : .
CCDS75 DFKD--QQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVD
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CCDS75 IDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVD
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CCDS75 VMQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKR
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CCDS83 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI
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CCDS83 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGV--LIISPTRELAYQTF
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CCDS83 EVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQ
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CCDS83 MLVLDEADRILDMGFAD---TMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYV
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CCDS83 WVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQK----ISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY
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CCDS83 RVFCRLR-PGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQ
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CCDS83 FDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLL-QKKVPVKEIKINPEKLI
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
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.. .. ... .. ..: .: . . .. . : :... .: : : . ::
CCDS83 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP
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pF1KE5 QKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV
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CCDS83 R--VRFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRL
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CCDS83 EGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTSEAQKIKEVPTQFLDR
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CCDS12 DEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHE
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 CIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFR
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CCDS12 CIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYE
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pF1KE5 VLGKPL-GLKDCIIVGGMDMVAQALELSRK--PHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRF
..: . ..: .. ::.. . . :. .: ::::..::::. .:. .::.:...
CCDS12 RFSKYMPSVKVSVFFGGLS-IKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNR-SFSLKNVKH
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 LVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPF--F
.:.:: :..::: :. :.. :. .: ..: ..:::::. .: . ..:. :
CCDS12 FVLDECDKMLEQ--LDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVF
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 WEAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCM
. .. . :.. :.: :. . .. :. : :. : : ..:::... . :. : .
CCDS12 VDDETKL-TLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLL----DVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQ
250 260 270 280 290 300
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pF1KE5 MLRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTP
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CCDS12 LLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMP
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:
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