FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5621, 512 aa
1>>>pF1KE5621 512 - 512 aa - 512 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5528+/-0.000991; mu= 16.4655+/- 0.059
mean_var=68.5675+/-13.473, 0's: 0 Z-trim(104.8): 31 B-trim: 136 in 1/50
Lambda= 0.154887
statistics sampled from 8051 (8070) to 8051 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 512) 3441 778.3 0
CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 563) 2572 584.2 1.3e-166
CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 528) 2356 535.9 4.2e-152
CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 574) 2169 494.1 1.7e-139
CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 562) 1757 402.1 8.7e-112
CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 531) 1027 238.9 1.1e-62
CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 1027 238.9 1.1e-62
CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 1027 238.9 1.1e-62
CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 ( 505) 791 186.2 7.6e-47
CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 ( 647) 787 185.3 1.7e-46
CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 669) 269 69.6 1.3e-11
CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 692) 269 69.6 1.3e-11
CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 728) 269 69.6 1.4e-11
>>CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (512 aa)
initn: 3441 init1: 3441 opt: 3441 Z-score: 4154.7 bits: 778.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3441; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 EAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFFP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDENVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDENVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 TCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
490 500 510
>>CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (563 aa)
initn: 2597 init1: 2341 opt: 2572 Z-score: 3104.6 bits: 584.2 E(32554): 1.3e-166
Smith-Waterman score: 2592; 79.0% identity (88.6% similar) in 499 aa overlap (26-512:66-563)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFV----YGPLTIRRVLWAVAFVG
:::.::. . : ::.::..::
CCDS11 GQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSLSRAKLHGLRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCT
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAG
:.:::: ::.:. :..:. :.: . ...: :::::.:: : .:: ::. .:::.::
CCDS11 SFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFPAVTVCNNNPLRFPRLSKGDLYYAG
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160
pF1KE5 ELLALLDVNLQIPDPHLA-----DPSVLEALRQKANFKHY-KPKQFSMLE--FLHRVGHD
. :.:: : . : .. : . .:. :.:. . :..: . :. :.::.
CCDS11 HWLGLLLPN-RTARPLVSELLRGDEPRRQWFRKLADFRLFLPPRHFEGISAAFMDRLGHQ
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDI
:.::.: ::..:. :: ..:..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDI
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 QQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLP
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 PPWGECRSSEMGLDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PPWGECRSSEMGLDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECA
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 EPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENIL
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 VLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510
pF1KE5 DLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
520 530 540 550 560
>>CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (528 aa)
initn: 1378 init1: 1378 opt: 2356 Z-score: 2844.2 bits: 535.9 E(32554): 4.2e-152
Smith-Waterman score: 2387; 66.1% identity (84.8% similar) in 528 aa overlap (1-512:1-528)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:.:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
CCDS44 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
CCDS44 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
CCDS44 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
.:: .:::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::::::::::::.::::.::.
CCDS44 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LD
::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: ::::: ::::::: :.. : ::
CCDS44 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNY
:: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.::::.::: .:.:::..:
CCDS44 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETI
:.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::::::.::::::
CCDS44 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 EQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSH
:::::::.:.:::::::::::::::::::.:::::: ::.::.:: :: ..:
CCDS44 EQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KE5 DENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
:..:. :... .: .....:. : . . ::.:...:
CCDS44 DKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
490 500 510 520
>>CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (574 aa)
initn: 2165 init1: 1378 opt: 2169 Z-score: 2617.8 bits: 494.1 E(32554): 1.7e-139
Smith-Waterman score: 2254; 63.4% identity (79.3% similar) in 541 aa overlap (1-489:1-541)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:.:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
CCDS87 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
CCDS87 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
CCDS87 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
.:: .:::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::::::::::::.::::.::.
CCDS87 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LD
::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: ::::: ::::::: :.. : ::
CCDS87 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNY
:: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.::::.::: .:.:::..:
CCDS87 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETI
:.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::::::.::::::
CCDS87 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KE5 EQKKAYEVAALLG----------------------------------------------D
:::::::.:.::: :
CCDS87 EQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKAGCSLLSHEGPPPQRPFPKPCCLGD
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480
pF1KE5 IGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVS-TCDTMPNH
:::::::::::::::.:::::: ::.::.:: :: ..: :..:. . : . :
CCDS87 IGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRH
490 500 510 520 530 540
490 500 510
pF1KE5 SETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
.
CCDS87 NPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
550 560 570
>>CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (562 aa)
initn: 1291 init1: 979 opt: 1757 Z-score: 2120.4 bits: 402.1 E(32554): 8.7e-112
Smith-Waterman score: 2088; 60.6% identity (79.8% similar) in 525 aa overlap (3-512:51-562)
10 20 30
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHI
... ::: .: .. :::. :::: ::
CCDS58 LGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGH-SPMDLVAFANSCTLHGTNHI
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 FVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLC
:: : :.:::::::: .:: .: . ..::.::.:: ::: ..::.. :.:::::::
CCDS58 FVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 NLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVNLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFS
: :. :.:.:. :: . . .:.: . . : :: :. :: .. . :.
CCDS58 NTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDD--PGVPLAPPGP-EA---------FSGEPFN
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGG
. .: .: : :.::.:::...: :: ..:..:::.::::: ::::.::.: : :.:::
CCDS58 LHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFV
::::::::::::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::::::
CCDS58 TGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 ATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGD
: ::::: ::::::: :.. : :::: ::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS58 ACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 APFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKK
::.:::::.::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.::::: ::
CCDS58 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 FNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILEL
:::::.::.:::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:::
CCDS58 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490
pF1KE5 FDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV
::: ::.::.:: :: ..: :..:. :... .: .....:.
CCDS58 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
490 500 510 520 530 540
500 510
pF1KE5 -PLQTTLGTLEEIAC
: . . ::.:...:
CCDS58 LPHHPARGTFEDFTC
550 560
>>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 1727 init1: 707 opt: 1027 Z-score: 1239.2 bits: 238.9 E(32554): 1.1e-62
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10 20 30 40 50 60
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>>CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (543 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS59 YFWNRQHSQRHSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPS
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CCDS59 LHVAFPSSPQIKS
540
>>CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (549 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
: :. :.:..::.. ..::. :.: : :..:: .::.: : :.. .: .
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
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CCDS59 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD--
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pF1KE5 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQ-FSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
: : : :.:: . . :. :.: .. :.::.: ::.: :.:.:: ::
CCDS59 ---PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCG
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pF1KE5 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
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CCDS59 PENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETP
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CCDS59 FEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYE
240 250 260 270 280 290
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CCDS59 YFWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVPHLSLGPSTLLCSEDLPPLPVPSPRLSPPPTA
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>>CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 (505 aa)
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CCDS37 LGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLN-----RFQTDAVAK
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CCDS37 LDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGET---LQAKRKVSVSGRGLSLLFNVNQEA
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:::: . .. :. : :: ..: .:....: ..:.: .:: . : ... :. :
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CCDS37 VLDHIEFKDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRE
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:.. ..: . :::. .:.:: :. ::.:.:::.::: :::..::.:...:..
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>>CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 (647 aa)
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: .. ::.::::::. . :: .::.
CCDS24 IKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGLRRT
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.: ::. :.:.:..:. ..:..:.:.::::: ::. : . : . :: :.:::::::
CCDS24 QLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLD
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CCDS24 IQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYL
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CCDS24 PQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGGGPEG
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CCDS24 ------P------------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYI
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pF1KE5 SENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELI
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CCDS24 RENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVS
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..:
CCDS24 WDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSRGRVEGGGVSSLLPNHHHPHGP
580 590 600 610 620 630
512 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:14:27 2016 done: Tue Nov 8 05:14:28 2016
Total Scan time: 2.720 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]