Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5613
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5613, 485 aa
1>>>pF1KE5613 485 - 485 aa - 485 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0398+/-0.000957; mu= 6.7916+/- 0.058
mean_var=190.1360+/-38.107, 0's: 0 Z-trim(113.0): 129 B-trim: 853 in 1/50
Lambda= 0.093013
statistics sampled from 13558 (13700) to 13558 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.421), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 485) 3280 452.5 4.7e-127
CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 409) 2046 286.8 2.9e-77
CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 481) 2033 285.1 1.1e-76
CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 1870 263.3 4.3e-70
CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 1851 260.7 2.5e-69
CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 448) 1688 238.8 9e-63
CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 465) 1544 219.5 6.1e-57
CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 486) 1333 191.2 2.1e-48
CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 485) 1316 188.9 1e-47
CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 485) 754 113.5 5.1e-25
CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 512) 754 113.5 5.4e-25
CCDS53955.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 344) 686 104.3 2.2e-22
CCDS53367.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 415) 661 101.0 2.6e-21
CCDS53956.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 454) 589 91.4 2.3e-18
CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 488) 587 91.1 2.9e-18
CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 490) 586 91.0 3.2e-18
CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 521) 586 91.0 3.3e-18
CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 508) 584 90.7 3.9e-18
CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 483) 560 87.5 3.5e-17
CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 514) 560 87.5 3.7e-17
CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 482) 558 87.2 4.2e-17
CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 486) 558 87.2 4.3e-17
>>CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 (485 aa)
initn: 3280 init1: 3280 opt: 3280 Z-score: 2394.5 bits: 452.5 E(32554): 4.7e-127
Smith-Waterman score: 3280; 100.0% identity (100.0% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSPYSAYAQALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSPYSAYAQALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SPPLLGTTAVPGLVAPITNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTVAETLHPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPPLLGTTAVPGLVAPITNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTVAETLHPAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 SGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTELTQMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTELTQMF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 LPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKD
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PGHPY
:::::
CCDS12 PGHPY
>>CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 (409 aa)
initn: 2020 init1: 1993 opt: 2046 Z-score: 1500.6 bits: 286.8 E(32554): 2.9e-77
Smith-Waterman score: 2434; 93.7% identity (93.7% similar) in 396 aa overlap (1-396:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSPYSAYAQALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FSPYSAYAQALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASG--
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SPPLLGTTAVPGLVAPITNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTVAETLHPAF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -----------------------VVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTVAETLHPAF
300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 SGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTELTQMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGVWRHGADADVPTLRQYHFLQGVYG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 LPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKD
CCDS54 SSYQPEQVFRLREL
400
>>CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 (481 aa)
initn: 1200 init1: 675 opt: 2033 Z-score: 1490.2 bits: 285.1 E(32554): 1.1e-76
Smith-Waterman score: 2033; 67.4% identity (85.2% similar) in 466 aa overlap (22-485:25-481)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLD
: :: :: .: . : ::: :::::::::::: ::
CCDS10 MAAAPGGSAQPAGPGPRLGFSTADSGVGMSGLNPGPAVP--MKDHDAIKLFVGQIPRGLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMAR
:.:::::::.:::::::::::: ::.:::::::::::::::.:::.::::::::::: :
CCDS10 EQDLKPLFEEFGRIYELTVLKDRLTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PIQVKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCA
::::::: ::.:: .:::::::::.:::.:::: ::::::: :.::::::.:::.:::::
CCDS10 PIQVKPAASEGRG-EDRKLFVGMLGKQQGEEDVRRLFQPFGHIEECTVLRSPDGTSKGCA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSL
::::.:. ::::::..::::.:: :::::::::.::::.::.:::::::.:.:: . :.
CCDS10 FVKFGSQGEAQAAIRGLHGSRTMAGASSSLVVKLADTDRERALRRMQQMAGHLGAFHPA-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLSTS-GSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPA
::.. .::. :..:.:...:... : :.: :: ..:...: :: :.:. ::
CCDS10 PLPLGACGAYTTAILQHQAALLAAAQGPGLGP-VAAVAAQMQHVAAFSLV---AAPLLPA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTVAET
.. .::: : ..::: ::: .:::. ..: .:.:. .:.: ::: ::::::: ::.
CCDS10 AAANSPPGSGPGTLPGLPAPIGVNGFGPLTPQTNGQPGSDTLYNNGLSPYPAQSPGVADP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LHPAFSGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTE
:. :..:...:.: ::.: .:.. . :: : : :::::::::::::::::::::::.:
CCDS10 LQQAYAGMHHYAAAYPSA-YAPVSTAFPQQPSALPQQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDAE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQL
: : ::::: ..:.:::.::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::
CCDS10 LIQTFLPFGAVVSAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPTSAQTAIQAMNGFQIGMKRLKVQL
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE5 KRPKDPGHPY
::::: ..::
CCDS10 KRPKDANRPY
480
>>CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (484 aa)
initn: 1869 init1: 584 opt: 1870 Z-score: 1371.9 bits: 263.3 E(32554): 4.3e-70
Smith-Waterman score: 2067; 66.7% identity (83.9% similar) in 471 aa overlap (26-485:37-484)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH
: .: :. : ::: ::::::.:::::.
CCDS82 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM
:::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.:::::::::::
CCDS82 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGGRD--------RKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLR
::::::::::::::: . ::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.::
CCDS82 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSHRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 GPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMV
::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS82 GPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSL
::.:...: ...::. :.::::::::::...... .:.::.: .::. ..::..:...
CCDS82 GQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 NGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVP
::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. :
CCDS82 NGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYTAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFI
:::::::.:. :. :..:::::.: :: :... :::::.. ::::::::::::::
CCDS82 YPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAAAAYPAAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCNLFI
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 YHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGF
:::::::::.:: ::::::: :::::::::::.::::::::
CCDS82 YHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAMNGF
430 440 450 460
470 480
pF1KE5 QIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY
:::::::::::::::: ..::
CCDS82 QIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
470 480
>>CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (484 aa)
initn: 1725 init1: 728 opt: 1851 Z-score: 1358.2 bits: 260.7 E(32554): 2.5e-69
Smith-Waterman score: 2048; 66.6% identity (83.7% similar) in 473 aa overlap (26-485:37-484)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH
: .: :. : ::: ::::::.:::::.
CCDS45 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM
:::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.:::::::::::
CCDS45 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGGRD--------RKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLR
::::::::::::::: . ::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.::
CCDS45 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSHRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 GPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMV
::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS45 GPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSL
::.:...: ...::. :.::::: ::::...... .:.::.: .::. ..::..:...
CCDS45 GQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQA-MQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 NGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVP
::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. :
CCDS45 NGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNL
:::::::.:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. ::::::::::::
CCDS45 YPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCNL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 FIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMN
:::::::::::.:: ::::::: :::::::::::.::::::
CCDS45 FIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAMN
430 440 450 460
470 480
pF1KE5 GFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY
:::::::::::::::::: ..::
CCDS45 GFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
470 480
>>CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (448 aa)
initn: 1079 init1: 637 opt: 1688 Z-score: 1240.4 bits: 238.8 E(32554): 9e-63
Smith-Waterman score: 1829; 62.4% identity (79.6% similar) in 465 aa overlap (26-485:37-448)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH
: .: :. : ::: ::::::.:::::.
CCDS45 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM
:::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.:::::::::::
CCDS45 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKG
:::::::::::::: .:::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.::::::.:::
CCDS45 NRPIQVKPADSESRG-EDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILRGPDGNSKG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTP
:::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::.::.:...:
CCDS45 CAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMAGQMGMFNP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPI
...::. :.::::::::::...... .:.::.: .::. ..::..:...::: :.:.
CCDS45 -MAIPFGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNMNGLAAAPM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 APASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTV
.:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::. ::::::::.
CCDS45 TPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHPYPAQSPTA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 AETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCNLFIYHLPQE
:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. ::::::
CCDS45 ADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREG--------------
370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 FGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKR
:::::::::::.::::::::::::::
CCDS45 ----------------------------------FVSFDNPASAQTAIQAMNGFQIGMKR
410 420 430
480
pF1KE5 LKVQLKRPKDPGHPY
:::::::::: ..::
CCDS45 LKVQLKRPKDANRPY
440
>>CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 (465 aa)
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Smith-Waterman score: 2067; 66.0% identity (86.3% similar) in 468 aa overlap (39-485:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 ARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKDLKPLFEQF
::. ::::::::::::::.::::::.::::
CCDS10 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQVKPADSES
:::.::::.:: :::.:::::::::::::::.:::.::::::::::: ::::::::::::
CCDS10 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQ
:: .:::::::::.:::..::: ..:.:::.::::::::::::.:::::::::..:.:::
CCDS10 RG-EDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQ
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLPFSPYSAYA
:::..::.:.:.::::::::::::::.::: ::::::.. :::...: ..: :. ::::.
CCDS10 AAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSP-IALQFGAYSAYT
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTT
:::::::...... ..:::: .... ..:...:.. ::: ::::.:.:: .:: ...:
CCDS10 QALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAAT
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 AVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTV-AETLHPAFSGVQQY
: .. : . .::.. : : :.:: ...: ::. :::::::.. .. :. :..:.:.:
CCDS10 PVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHY
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400
pF1KE5 TAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLL-------------------QQQQREGPEGCNLFIYHL
:: :: :: . .: . :::: :. ::::::::.:::.:::::
CCDS10 TAAYP-AAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHL
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 PQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIG
:::: :.:. :::.:::..::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIG
390 400 410 420 430 440
470 480
pF1KE5 MKRLKVQLKRPKDPGHPY
::::::::::::: ..::
CCDS10 MKRLKVQLKRPKDANRPY
450 460
>>CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (486 aa)
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Smith-Waterman score: 2073; 66.9% identity (84.0% similar) in 474 aa overlap (26-485:37-486)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH
: .: :. : ::: ::::::.:::::.
CCDS32 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM
:::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.:::::::::::
CCDS32 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGG---------RDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVL
::::::::::::::: .:::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.:
CCDS32 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSQDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTIL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQM
:::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 RGPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VGQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVS
.::.:...: ...::. :.::::::::::...... .:.::.: .::. ..::..:..
CCDS32 AGQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 LNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLV
.::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::.
CCDS32 MNGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 PYPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCN
::::::::.:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. :::::::::::
CCDS32 PYPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 LFIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAM
::::::::::::.:: ::::::: :::::::::::.:::::
CCDS32 LFIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAM
430 440 450 460
470 480
pF1KE5 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY
::::::::::::::::::: ..::
CCDS32 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
470 480
>>CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (485 aa)
initn: 1734 init1: 737 opt: 1316 Z-score: 970.2 bits: 188.9 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 2056; 66.7% identity (83.8% similar) in 474 aa overlap (26-485:37-485)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MARLTESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRH
: .: :. : ::: ::::::.:::::.
CCDS45 TLANGQADNASLSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIP--MKDHDAIKLFIGQIPRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LDEKDLKPLFEQFGRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGM
:::::::::::.::.::::::::: .::::::::::::: :.::.:::.:::::::::::
CCDS45 LDEKDLKPLFEEFGKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 ARPIQVKPADSESRGG---------RDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVL
::::::::::::::: .:::::::::::::::.:: :::. :: :.:::.:
CCDS45 NRPIQVKPADSESRGGSSCLRQPPSQDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTIL
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 RGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQM
:::::.::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS45 RGPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VGQLGILTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLST--SGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVS
.::.:...: ...::. :.::::: ::::...... .:.::.: .::. ..::..:..
CCDS45 AGQMGMFNP-MAIPFGAYGAYAQA-MQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 LNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLV
.::: :.:..:.:: .:: . . :::.. .:: .:::.:. : .:.:: :.:.:::.
CCDS45 MNGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 PYPAQSPTVAETLHPAFSGVQQYT--AMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGPEGCN
::::::::.:. :. :..:::::. : :: :: :... :::::.. :::::::::::
CCDS45 PYPAQSPTAADPLQQAYAGVQQYAGPAAYP-AAYGQISQAFPQPPPMIPQQQREGPEGCN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 LFIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAM
::::::::::::.:: ::::::: :::::::::::.:::::
CCDS45 LFIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAIQAM
430 440 450 460
470 480
pF1KE5 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY
::::::::::::::::::: ..::
CCDS45 NGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
470 480
>>CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (485 aa)
initn: 1274 init1: 561 opt: 754 Z-score: 562.6 bits: 113.5 E(32554): 5.1e-25
Smith-Waterman score: 1259; 44.9% identity (69.7% similar) in 485 aa overlap (35-485:7-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TESEARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKDLKPL
.:: . ::::::.::::.:: .::::. :
CCDS53 MNGTLDHPD-QPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLREL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FEQFGRIYELTVLKDPYTG--MHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQVK
:::.: .::..::.: . . ::: :.:. .: .:..::.:::..:.:::: .:::.:
CCDS53 FEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 PADSESRGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVKFS
:::::. . .:::::.::..:. .:.:. .:. :: :.:: .:::::: :.::::: :.
CCDS53 PADSEKNNVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFT
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 SHTEAQAAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRM-QQMVGQL---------GI
... ::.::.:.: .::: : :: .:::::::.:.. .:: ::. :. :
CCDS53 TRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LTPSLTLPFSPYSAYAQALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPA--
:. :: . . : : :.: .. .. : : : ... ..:...:.. . :
CCDS53 LAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQN
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 TPI---------APASGLHSPPLLGTTAVPGLVAPITNGFAGVVPFPGGHPALETVYANG
:: .: : : : ... . : ::.. .... . :. .:.. :
CCDS53 TPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIAS-LGALQTLAGATAGLNVGSLAG
280 290 300 310 320 330
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pF1KE5 LVPYPAQ---------SPTVAETLHPAFSGVQQYTAMYPTAAITPIAHS--VPQPPPLLQ
.. . . .. :.: :.::.:::.: ::. . .. . :
CCDS53 MAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAA----AALPTLYNQNLLTQQSIGAA
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 QQQREGPEGCNLFIYHLPQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDN
.:.::::: ::::::::::::: .: :::.::::..:.:::.:. :: ::::::::.::
CCDS53 GSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDN
400 410 420 430 440 450
460 470 480
pF1KE5 PASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDPGHPY
:.:::::::.::::::::::::::::: :. ..::
CCDS53 PVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
460 470 480
485 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:09:31 2016 done: Tue Nov 8 05:09:32 2016
Total Scan time: 3.010 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]