Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5611, 492 aa
1>>>pF1KE5611 492 - 492 aa - 492 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5644+/-0.000841; mu= 16.1163+/- 0.050
mean_var=63.3739+/-13.072, 0's: 0 Z-trim(107.1): 18 B-trim: 308 in 1/48
Lambda= 0.161109
statistics sampled from 9356 (9367) to 9356 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7030.1 DPP7 gene_id:29952|Hs108|chr9 ( 492) 3381 794.6 0
CCDS8262.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 ( 496) 1267 303.2 4.1e-82
CCDS41695.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 ( 517) 1218 291.9 1.1e-78
CCDS4623.1 PRSS16 gene_id:10279|Hs108|chr6 ( 514) 632 155.7 1.1e-37
>>CCDS7030.1 DPP7 gene_id:29952|Hs108|chr9 (492 aa)
initn: 3381 init1: 3381 opt: 3381 Z-score: 4243.2 bits: 794.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3381; 99.8% identity (100.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSAPWAPVLLLALGLRGLQAGARRAPDPGFQERFFQQRLDHFNFERFGNKTFPQRFLVS
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CCDS70 MGSAPWAPVLLLALGLRGLQAGARRAPDPGFQERFFQQRLDHFNFERFGNKTFPQRFLVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DRFWVRGEGPIFFYTGNEGDVWAFANNSGFVAELAAERGALLVFAEHRYYGKSLPFGAQS
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DRFWVRGEGPIFFYTGNEGDVWAFANNSAFVAELAAERGALLVFAEHRYYGKSLPFGAQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TQRGHTELLTVEQALADFAELLRALRRDLGAQDAPAIAFGGSYGGMLSAYLRMKYPHLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TQRGHTELLTVEQALADFAELLRALRRDLGAQDAPAIAFGGSYGGMLSAYLRMKYPHLVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GALAASAPVLAVAGLGDSNQFFRDVTADFEGQSPKCTQGVREAFRQIKDLFLQGAYDTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GALAASAPVLAVAGLGDSNQFFRDVTADFEGQSPKCTQGVREAFRQIKDLFLQGAYDTVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 WEFGTCQPLSDEKDLTQLFMFARNAFTVLAMMDYPYPTDFLGPLPANPVKVGCDRLLSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 WEFGTCQPLSDEKDLTQLFMFARNAFTVLAMMDYPYPTDFLGPLPANPVKVGCDRLLSEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 QRITGLRALAGLVYNASGSEHCYDIYRLYHSCADPTGCGTGPDARAWDYQACTEINLTFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QRITGLRALAGLVYNASGSEHCYDIYRLYHSCADPTGCGTGPDARAWDYQACTEINLTFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 SNNVTDMFPDLPFTDELRQRYCLDTWGVWPRPDWLLTSFWGGDLRAASNIIFSNGNLDPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SNNVTDMFPDLPFTDELRQRYCLDTWGVWPRPDWLLTSFWGGDLRAASNIIFSNGNLDPW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 AGGGIRRNLSASVIAVTIQGGAHHLDLRASHPEDPASVVEARKLEATIIGEWVKAARREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 AGGGIRRNLSASVIAVTIQGGAHHLDLRASHPEDPASVVEARKLEATIIGEWVKAARREQ
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 QPALRGGPRLSL
::::::::::::
CCDS70 QPALRGGPRLSL
490
>>CCDS8262.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 (496 aa)
initn: 1210 init1: 425 opt: 1267 Z-score: 1587.6 bits: 303.2 E(32554): 4.1e-82
Smith-Waterman score: 1294; 42.6% identity (69.9% similar) in 488 aa overlap (4-474:15-486)
10 20 30 40
pF1KE5 MGSAPWAPVLLL----ALGLRGLQAGARRAPD--PGFQERFFQQRLDHF
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CCDS82 MGRRALLLLLLSFLAPWATIALRPALRALGSLHLPTNPTSLPAVAKNYSVLYFQQKVDHF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 NFERFGNKTFPQRFLVSDRFWVRGEGPIFFYTGNEGDVWAFANNSGFVAELAAERGALLV
.:. ::: ::.::.:..: .. : :.::::::::. : ::.::. ..: : :.::
CCDS82 GFNTV--KTFNQRYLVADKYWKKNGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLV
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FAEHRYYGKSLPFGAQSTQRG-HTELLTVEQALADFAELLRALRRDL-GAQDAPAIAFGG
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CCDS82 FAEHRYYGESLPFGDNSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKRTIPGAENQPVIAIGG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SYGGMLSAYLRMKYPHLVAGALAASAPVLAVAGLGDSNQFFRDVTADFEGQSPKCTQGVR
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CCDS82 SYGGMLAAWFRMKYPHMVVGALAASAPIWQFEDLVPCGVFMKIVTTDFRKSGPHCSESIH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE5 EAFRQIKDLFLQGAYDTVRWEFGT---CQPLSDEKDLTQLFMFARNAFTVLAMMDYPYPT
... :. : :. ..: :. :.::... :. .: . .... :::.:::: .
CCDS82 RSWDAINRLSNTGS--GLQWLTGALHLCSPLTSQ-DIQHLKDWISETWVNLAMVDYPYAS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 DFLGPLPANPVKVGCDRL----LSEAQRITGLRALAGLVYNASGSEHCYDIYRLYHSCAD
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CCDS82 NFLQPLPAWPIKVVCQYLKNPNVSDSLLLQNIFQALNVYYNYSGQVKCLNISETATSSLG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 PTGCGTGPDARAWDYQACTEINLTFASNNVTDMFPDLPFTDELRQRY--CLDTWGVWPRP
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CCDS82 TLG---------WSYQACTEVVMPFCTNGVDDMFE--PHSWNLKELSDDCFQQWGVRPRP
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 DWLLTSFWGGDLRAASNIIFSNGNLDPWAGGGIRRNLSASVIAVTIQGGAHHLDLRASHP
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CCDS82 SWITTMYGGKNISSHTNIVFSNGELDPWSGGGVTKDITDTLVAVTISEGAHHLDLRTKNA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490
pF1KE5 EDPASVVEARKLEATIIGEWVKAARREQQPALRGGPRLSL
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CCDS82 LDPMSVLLARSLEVRHMKNWIRDFYDSAGKQH
470 480 490
>>CCDS41695.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 (517 aa)
initn: 1164 init1: 425 opt: 1218 Z-score: 1525.8 bits: 291.9 E(32554): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 1245; 43.7% identity (71.7% similar) in 446 aa overlap (40-474:78-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LLLALGLRGLQAGARRAPDPGFQERFFQQRLDHFNFERFGNKTFPQRFLVSDRFWVRGEG
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CCDS41 YSVLYFQQKALAAGQLHICIIQLNHYKTPLVDHFGFNTV--KTFNQRYLVADKYWKKNGG
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PIFFYTGNEGDVWAFANNSGFVAELAAERGALLVFAEHRYYGKSLPFGAQSTQRG-HTEL
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CCDS41 SILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGDNSFKDSRHLNF
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LTVEQALADFAELLRALRRDL-GAQDAPAIAFGGSYGGMLSAYLRMKYPHLVAGALAASA
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CCDS41 LTSEQALADFAELIKHLKRTIPGAENQPVIAIGGSYGGMLAAWFRMKYPHMVVGALAASA
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVLAVAGLGDSNQFFRDVTADFEGQSPKCTQGVREAFRQIKDLFLQGAYDTVRWEFGT--
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CCDS41 PIWQFEDLVPCGVFMKIVTTDFRKSGPHCSESIHRSWDAINRLSNTGS--GLQWLTGALH
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 -CQPLSDEKDLTQLFMFARNAFTVLAMMDYPYPTDFLGPLPANPVKVGCDRL----LSEA
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CCDS41 LCSPLTSQ-DIQHLKDWISETWVNLAMVDYPYASNFLQPLPAWPIKVVCQYLKNPNVSDS
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 QRITGLRALAGLVYNASGSEHCYDIYRLYHSCADPTGCGTGPDARAWDYQACTEINLTFA
. .. .. :: ::. .: .: . : : :.::::::. . :
CCDS41 LLLQNIFQALNVYYNYSGQVKCLNISETATSSLGTLG---------WSYQACTEVVMPFC
350 360 370 380 390
370 380 390 400 410
pF1KE5 SNNVTDMFPDLPFTDELRQRY--CLDTWGVWPRPDWLLTSFWGGDLRAASNIIFSNGNLD
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CCDS41 TNGVDDMFE--PHSWNLKELSDDCFQQWGVRPRPSWITTMYGGKNISSHTNIVFSNGELD
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 PWAGGGIRRNLSASVIAVTIQGGAHHLDLRASHPEDPASVVEARKLEATIIGEWVKAARR
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CCDS41 PWSGGGVTKDITDTLVAVTISEGAHHLDLRTKNALDPMSVLLARSLEVRHMKNWIRDFYD
460 470 480 490 500 510
480 490
pF1KE5 EQQPALRGGPRLSL
CCDS41 SAGKQH
>>CCDS4623.1 PRSS16 gene_id:10279|Hs108|chr6 (514 aa)
initn: 507 init1: 192 opt: 632 Z-score: 789.7 bits: 155.7 E(32554): 1.1e-37
Smith-Waterman score: 632; 30.7% identity (57.3% similar) in 485 aa overlap (14-480:45-509)
10 20 30 40
pF1KE5 MGSAPWAPVLLLALGLRGLQAGARRAPDPGFQERFFQQRLDHF
::: .: :: : :. : : :: :
CCDS46 VSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGL-SLGPGAAALPKVGWLE----QLLDPF
20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 NFERFGNKTFPQRFLVSDRFWVRGEGPIFFYTGNEGDVWAFANNSGFVAELAAERGALLV
: ..: ::. :.:. :: .::::.. :.::.. . : : :: :::..
CCDS46 NVS--DRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAPAWGALVI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FAEHRYYGKSLPFGAQSTQRGHTELLTVEQALADFAELLRALRRDLG-AQDAPAIAFGGS
:::.:: :.: : . . .. ..:. . :::: . :: : .. ....: : ::::
CCDS46 SLEHRFYGLSIPAG--GLEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWICFGGS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 YGGMLSAYLRMKYPHLVAGALAASAPVLAVAGLGDSNQFF-RDVTADFEGQSPKCTQGVR
:.: :.:. :.:.:::. ...:.:::: :: ... :. :.. . : : .: .:
CCDS46 YAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLECRAAVS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE5 EAFRQIKDLFLQG--AYDTVRWEFGTCQPLSDEKDLTQLFMFARNAFTVLAMMDYPYPTD
:: ... . .: : ..: :...: ::. .. ..:. .:. .:. : .
CCDS46 VAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELL----GALQALVGGVVQYDGQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FLGPLPANPVKVGCDRLL------SEAQRITGLRALAGLVYNASGSEHCYDIYRLYH---
.:: :. : :: :.. ::: . .: .. : ..: .. :
CCDS46 TGAPLS---VRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLG-QKCLSFSRAETVAQ
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE5 -SCADPTGCGTGPDARAWDYQACTEINLTFASNNVTDMFPDLPFT----DELRQRYCLDT
..: :.: : : ::.:::... . .: : .:: : .: . :..
CCDS46 LRSTEPQLSGVGD--RQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 WGVWPRPDWLLTSFWGGDLRAASNIIFSNGNLDPWAGGGIRRNLSASVIAVTIQGGAHHL
.: . .:..::. .:....: ::. ::: .. . :..: .. :. :.: :
CCDS46 LSV-AQAVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE5 DLRASHPEDPASVVEARKLEATIIGEWVKAARREQQPALRGGPRLSL
:. .: : :. .:. . :.: :.. :
CCDS46 DMAPERPSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV
480 490 500 510
492 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:08:13 2016 done: Tue Nov 8 05:08:13 2016
Total Scan time: 2.790 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]