Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5593
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5593, 420 aa
1>>>pF1KE5593 420 - 420 aa - 420 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6746+/-0.00034; mu= 10.7241+/- 0.021
mean_var=114.1311+/-24.212, 0's: 0 Z-trim(117.9): 245 B-trim: 1339 in 1/51
Lambda= 0.120053
statistics sampled from 29952 (30293) to 29952 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 8.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001159864 (OMIM: 190920) trophoblast glycoprote ( 420) 2790 494.1 2.7e-139
XP_011534399 (OMIM: 190920) PREDICTED: trophoblast ( 420) 2790 494.1 2.7e-139
NP_006661 (OMIM: 190920) trophoblast glycoprotein ( 420) 2790 494.1 2.7e-139
NP_848665 (OMIM: 610462) reticulon-4 receptor-like ( 420) 405 81.1 6e-15
NP_075380 (OMIM: 181500,605566) reticulon-4 recept ( 473) 367 74.5 6.3e-13
NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leuc ( 811) 322 66.9 2.1e-10
NP_001094861 (OMIM: 609792) leucine-rich repeat an ( 592) 312 65.1 5.5e-10
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 306 64.0 1.1e-09
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545) 306 64.0 1.1e-09
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 306 64.0 1.1e-09
NP_001333075 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 306 64.0 1.2e-09
NP_001333073 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 306 64.0 1.2e-09
NP_001333072 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876624 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_011534913 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
NP_037363 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat trans ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876621 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876622 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876620 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
NP_001333074 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876618 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
XP_016876623 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 306 64.0 1.2e-09
NP_004479 (OMIM: 173511) platelet glycoprotein V p ( 560) 300 63.0 2.2e-09
XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 292 61.6 6.6e-09
NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 292 61.6 6.6e-09
NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 292 61.6 6.6e-09
XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 292 61.6 6.6e-09
XP_005260739 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 292 61.6 6.6e-09
XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 283 60.1 2e-08
NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat trans ( 674) 283 60.1 2e-08
XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 283 60.1 2e-08
NP_001010847 (OMIM: 615212) leucine-rich repeat-co ( 294) 273 58.1 3.4e-08
NP_001004432 (OMIM: 609794) leucine-rich repeat an ( 593) 271 58.0 7.6e-08
XP_016873563 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_011518542 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
NP_001245348 (OMIM: 608817) leucine-rich repeat-co ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_011518540 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_016873561 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_016873559 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_016873566 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_016873567 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_011518541 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_011518545 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
NP_065980 (OMIM: 608817) leucine-rich repeat-conta ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_011518544 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_016873565 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_011518543 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
XP_016873560 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 271 58.0 8.1e-08
>>NP_001159864 (OMIM: 190920) trophoblast glycoprotein p (420 aa)
initn: 2790 init1: 2790 opt: 2790 Z-score: 2621.9 bits: 494.1 E(85289): 2.7e-139
Smith-Waterman score: 2790; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
370 380 390 400 410 420
>>XP_011534399 (OMIM: 190920) PREDICTED: trophoblast gly (420 aa)
initn: 2790 init1: 2790 opt: 2790 Z-score: 2621.9 bits: 494.1 E(85289): 2.7e-139
Smith-Waterman score: 2790; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
370 380 390 400 410 420
>>NP_006661 (OMIM: 190920) trophoblast glycoprotein prec (420 aa)
initn: 2790 init1: 2790 opt: 2790 Z-score: 2621.9 bits: 494.1 E(85289): 2.7e-139
Smith-Waterman score: 2790; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
370 380 390 400 410 420
>>NP_848665 (OMIM: 610462) reticulon-4 receptor-like 2 p (420 aa)
initn: 285 init1: 138 opt: 405 Z-score: 389.4 bits: 81.1 E(85289): 6e-15
Smith-Waterman score: 407; 31.9% identity (54.7% similar) in 320 aa overlap (54-349:23-315)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 VLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTVKCVNRNLT
: : .:: :: : . ::.: :..
NP_848 MLPGLRRLLQAPASACLLLMLLALPLAAPSCPMLCTCYSSPPTVSCQANNFS
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 EVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPS
:: .:: .. ::: .: . .: :.:. ..: .: : .. :. . :.:.:: .
NP_848 SVPLSLPPSTQRLFLQNNLIRTLRPGTFG-----SNLLTLWLFSNNLSTIYPGTFRHLQA
60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 LRQLDLSHN-PLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAA
:..:::. : : .: : .:.: : .: :. . : :. : .
NP_848 LEELDLGDNRHLRSLEPDTFQG----------LERLQSLHLY----RCQLSSLPGNIF--
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 LLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLES
:.: .:. : : : .:.: :..:.: .: :: : .: : :: ::.: :.
NP_848 ----RGLVSLQYLYLQENSLLHLQDDLFADLANLSHLFLHGNRLRLLTEHVFRGLGSLDR
160 170 180 190 200
270 280 290 300
pF1KE5 LHLEDNALKVLH----------------NGTLAELQG-----LPHIRVF-LDNNPWVCDC
: :. : :. .: :..:: : : :: .. . :. :::.:::
NP_848 LLLHGNRLQGVHRAAFRGLSRLTILYLFNNSLASLPGEALADLPSLEFLRLNANPWACDC
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLD-CDPILPPSLQTSYVFL
. . .:.....: ... .::: : . ..: : : ::.. : : :
NP_848 RARPLWAWFQRARV--SSSDVTCATPPERQGRDLRALREADFQACPPAAPTRPGSRARGN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 GIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSD
NP_848 SSSNHLYGVAEAGAPPADPSTLYRDLPAEDSRGRQGGDAPTEDDYWGGYGGEDQRGEQMC
330 340 350 360 370 380
>>NP_075380 (OMIM: 181500,605566) reticulon-4 receptor p (473 aa)
initn: 257 init1: 99 opt: 367 Z-score: 353.1 bits: 74.5 E(85289): 6.3e-13
Smith-Waterman score: 367; 30.0% identity (59.6% similar) in 297 aa overlap (62-350:27-315)
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 SSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCEC-SEAARTVKCVNRNLTEVPTDLP
::. : : .: :..: ...: ::. .:
NP_075 MKRASAGGSRLLAWVLWLQAWQVAAPCPGACVCYNEPKVTTSCPQQGLQAVPVGIP
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140
pF1KE5 AYVRNLFLTGNQLAVLPAGAF-ARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDL
: . .:: ::... .::..: : : .:. : : .. : .. :.:: : :.::::
NP_075 AASQRIFLHGNRISHVPAASFRACR----NLTILWLHSNVLARIDAAAFTGLALLEQLDL
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 SHNP-LADLSPFAFSGSNA--SVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAG
: : : ...: .: : . .. .. . . : .. .. ::
NP_075 SDNAQLRSVDPATFHGLGRLHTLHLDRCGLQELGPGLFRGLAALQYLYLQDNALQALPDD
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 --RALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLH
: : .: .: : .:.. .:. .. : :: .: : .: .. . .::.: .: .:.
NP_075 TFRDLGNLTHLFLHGNRISSVPERAFRGLHSLDRLLLHQNRVAHVHPHAFRDLGRLMTLY
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 LEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCA
: : :..: . .:: :..: ..: :..:::::::. . .::.. . ..... :.
NP_075 LFANNLSALPTEALAPLRALQYLR--LNDNPWVCDCRARPLWAWLQKFR--GSSSEVPCS
240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 YPEKMRNRVLLELNSADLD-CDPILPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKK
:... .: : .: . ::. : :
NP_075 LPQRLAGRDLKRLAANDLQGCAVATGPYHPIWTGRATDEEPLGLPKCCQPDAADKASVLE
290 300 310 320 330 340
>>NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leucine (811 aa)
initn: 336 init1: 136 opt: 322 Z-score: 307.6 bits: 66.9 E(85289): 2.1e-10
Smith-Waterman score: 328; 33.7% identity (59.8% similar) in 276 aa overlap (96-355:160-422)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNL
: : :: :..:: ..:: ::..: :.:
NP_055 LRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFA---PLGNLLYLHL
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAP-SPLVELILN---
..:. . .:: .: .:: :.:: : .:.: : .:.. :: : :::.
NP_055 ESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSAN---ELQP---SLRHAATFAPLRSLSSLILSANN
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KE5 --HIVPPEDERQNR----SFEGMVVAALL--AGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQL
:. : .. : :..: .. : : .:..::.:.: .:.. :: .: :
NP_055 LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDN
::. ::::.: : .: ..: .: .:. : :..:::..: . .: .: :. ::.
NP_055 HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPAL--YRLDLDG
310 320 330 340 350
300 310 320 330 340
pF1KE5 NPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLT----CAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILP
: :.:::.. . :. . . ::. :: : .: .:.. : :.. .:.
NP_055 NGWTCDCRLRGLKRWMGDWHS-QGR-LLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCAD
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 PSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADP
:: ..:
NP_055 PSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELV
420 430 440 450 460 470
>>NP_001094861 (OMIM: 609792) leucine-rich repeat and im (592 aa)
initn: 501 init1: 186 opt: 312 Z-score: 300.2 bits: 65.1 E(85289): 5.5e-10
Smith-Waterman score: 348; 30.4% identity (55.7% similar) in 332 aa overlap (44-373:9-309)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 GRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAAR
: :.: . : :: ::: :::. .:
NP_001 MTCWLCVLSLPLL--LLPAAPPPAGGCPARCECTVQTR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 TVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEV
.: :. : :: :: .:: .: : :. :.. : : .: : : : :.:: . . .:
NP_001 AVACTRRRLTAVPDGIPAETRLLELSRNRIRCLNPGDLAALPALEE---LDLSENAIAHV
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 RAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNR
. ::: .:: :: : : : : . : .:. . . :..: :..: :
NP_001 EPGAFANLPRLRVLRLRGNQLKLIPPGVFTRLDNLT-----LLDLSENKLVILLD----Y
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 SFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVS
.:. :..:::::...: .... : ..: : .:..: : .:..:. :
NP_001 TFQD-----------LHSLRRLEVGDNDLVFVSRRAFAGLLALEELTLERCNLTALSGES
150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 FRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETE
. .: : .:.:. :. :.. .. .: :: :... :: : . . : . :. :
NP_001 LGHLRSLGALRLRHLAIASLEDQNFRRLPGLLHLEI--DNWPLLEEV-AAGSLRGLNLTS
200 210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 VVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPI--LPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFL
. . .: . .:... .:. .:. .:: .: . . : : : : ::..
NP_001 LSVTHTNITAVPAAALRHQA--HLTCLNLSHNPISTVPRGSFRDLVRLR-ELHLAGALLA
260 270 280 290 300
380 390 400 410 420
pF1KE5 LVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
.:
NP_001 VVEPQAFLGLRQIRLLNLSNNLLSTLEESTFHSVNTLETLRVDGNPLACDCRLLWIVQRR
310 320 330 340 350 360
>>NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N subunit (545 aa)
initn: 293 init1: 136 opt: 306 Z-score: 295.1 bits: 64.0 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 306; 28.9% identity (58.2% similar) in 287 aa overlap (73-347:172-447)
50 60 70 80 90
pF1KE5 SSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDL--P-AYVRNLFLT
.:.. .. :...: .: : . ...: :.
NP_001 QHLAALESLHLQGNQLQALPRRLFQPLTHLKTLNLAQNLLAQLPEELFHPLTSLQTLKLS
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 GNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADL--
.: :. :: :.:.. :. : : :... ..:. .: .: :..: :..: .. :
NP_001 NNALSGLPQGVFGK---LGSLQELFLDSNNISELPPQVFSQLFCLERLWLQRNAITHLPL
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGR--ALQGLRRL
: :: :. . .: ..... . . :. . .. : :..:: :
NP_001 SIFASLGNLTFLSLQWNMLRVLPAGLFAHTPCLVGLSLTHNQLETVAEGTFAHLSNLRSL
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHN
:. : . .:: .. .: : .: :..:.:..: . :.::..:: : : : : .: .
NP_001 MLSYNAITHLPAGIFRDLEELVKLYLGSNNLTALHPALFQNLSKLELLSLSKNQLTTLPE
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLT-----CAYPEKMR
: . .: . . : .::: ::::.: . .::. : ::: :: : ..
NP_001 GIFDTNYNL--FNLALHGNPWQCDCHLAYLFNWLQ-----QYTDRLLNIQTYCAGPAYLK
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 NRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRD
..:. :: .: : :.
NP_001 GQVVPALNEKQLVC-PVTRDHLGFQVTWPDESKAGGSWDLAVQERAARSQCTYSNPEGTV
440 450 460 470 480 490
>>XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypeptidas (545 aa)
initn: 293 init1: 136 opt: 306 Z-score: 295.1 bits: 64.0 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 306; 28.9% identity (58.2% similar) in 287 aa overlap (73-347:172-447)
50 60 70 80 90
pF1KE5 SSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDL--P-AYVRNLFLT
.:.. .. :...: .: : . ...: :.
XP_005 QHLAALESLHLQGNQLQALPRRLFQPLTHLKTLNLAQNLLAQLPEELFHPLTSLQTLKLS
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pF1KE5 GNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADL--
.: :. :: :.:.. :. : : :... ..:. .: .: :..: :..: .. :
XP_005 NNALSGLPQGVFGK---LGSLQELFLDSNNISELPPQVFSQLFCLERLWLQRNAITHLPL
210 220 230 240 250
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pF1KE5 SPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGR--ALQGLRRL
: :: :. . .: ..... . . :. . .. : :..:: :
XP_005 SIFASLGNLTFLSLQWNMLRVLPAGLFAHTPCLVGLSLTHNQLETVAEGTFAHLSNLRSL
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pF1KE5 ELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHN
:. : . .:: .. .: : .: :..:.:..: . :.::..:: : : : : .: .
XP_005 MLSYNAITHLPAGIFRDLEELVKLYLGSNNLTALHPALFQNLSKLELLSLSKNQLTTLPE
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pF1KE5 GTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLT-----CAYPEKMR
: . .: . . : .::: ::::.: . .::. : ::: :: : ..
XP_005 GIFDTNYNL--FNLALHGNPWQCDCHLAYLFNWLQ-----QYTDRLLNIQTYCAGPAYLK
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 NRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRD
..:. :: .: : :.
XP_005 GQVVPALNEKQLVC-PVTRDHLGFQVTWPDESKAGGSWDLAVQERAARSQCTYSNPEGTV
440 450 460 470 480 490
>>NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N subunit (545 aa)
initn: 293 init1: 136 opt: 306 Z-score: 295.1 bits: 64.0 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 306; 28.9% identity (58.2% similar) in 287 aa overlap (73-347:172-447)
50 60 70 80 90
pF1KE5 SSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDL--P-AYVRNLFLT
.:.. .. :...: .: : . ...: :.
NP_001 QHLAALESLHLQGNQLQALPRRLFQPLTHLKTLNLAQNLLAQLPEELFHPLTSLQTLKLS
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 GNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADL--
.: :. :: :.:.. :. : : :... ..:. .: .: :..: :..: .. :
NP_001 NNALSGLPQGVFGK---LGSLQELFLDSNNISELPPQVFSQLFCLERLWLQRNAITHLPL
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGR--ALQGLRRL
: :: :. . .: ..... . . :. . .. : :..:: :
NP_001 SIFASLGNLTFLSLQWNMLRVLPAGLFAHTPCLVGLSLTHNQLETVAEGTFAHLSNLRSL
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pF1KE5 ELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHN
:. : . .:: .. .: : .: :..:.:..: . :.::..:: : : : : .: .
NP_001 MLSYNAITHLPAGIFRDLEELVKLYLGSNNLTALHPALFQNLSKLELLSLSKNQLTTLPE
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLT-----CAYPEKMR
: . .: . . : .::: ::::.: . .::. : ::: :: : ..
NP_001 GIFDTNYNL--FNLALHGNPWQCDCHLAYLFNWLQ-----QYTDRLLNIQTYCAGPAYLK
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 NRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRD
..:. :: .: : :.
NP_001 GQVVPALNEKQLVC-PVTRDHLGFQVTWPDESKAGGSWDLAVQERAARSQCTYSNPEGTV
440 450 460 470 480 490
420 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]