Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5582, 359 aa
1>>>pF1KE5582 359 - 359 aa - 359 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1112+/-0.000582; mu= 17.8696+/- 0.036
mean_var=88.5168+/-23.015, 0's: 0 Z-trim(105.7): 297 B-trim: 1727 in 2/47
Lambda= 0.136321
statistics sampled from 13513 (13886) to 13513 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.481), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16
Scan time: 7.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1068 221.0 2.9e-57
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1009 209.4 9e-54
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 929 193.6 4.9e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 873 182.6 1e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 858 179.7 7.7e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 829 174.0 4.1e-43
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 823 172.8 9.4e-43
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 817 171.6 2.1e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 808 169.8 7e-42
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 797 167.7 3.2e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 793 166.9 5.3e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 793 166.9 5.5e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 778 163.9 4.2e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 761 160.6 4.4e-39
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 761 160.6 4.4e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 761 160.6 4.4e-39
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 760 160.4 4.9e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 736 155.7 1.3e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 498 108.9 1.6e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 463 102.0 1.9e-21
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 205 51.3 3.6e-06
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 191 48.6 3e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 187 47.7 4.3e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 183 47.0 7.6e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 181 46.7 0.00012
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 170 44.4 0.00045
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 169 44.2 0.00049
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 165 43.5 0.00096
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 165 43.5 0.00096
NP_114142 (OMIM: 606916) probable G-protein couple ( 451) 162 43.0 0.0016
XP_016857927 (OMIM: 606916) PREDICTED: probable G- ( 451) 162 43.0 0.0016
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 158 42.1 0.0024
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 158 42.1 0.0024
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 158 42.1 0.0025
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 154 41.3 0.0039
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 154 41.3 0.004
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 154 41.3 0.0041
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 154 41.3 0.0043
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 154 41.3 0.0043
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 154 41.3 0.0043
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 154 41.3 0.0045
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 154 41.4 0.0046
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 151 40.7 0.0065
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 150 40.5 0.0069
XP_016874705 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 150 40.6 0.0078
XP_011518927 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 150 40.6 0.0078
XP_011518926 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 150 40.6 0.0081
XP_016874704 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 150 40.6 0.0081
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1068; 52.1% identity (77.5% similar) in 307 aa overlap (38-344:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 STVNIPLSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFF
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLFLAIYLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTK
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NP_006 LMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSE
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NP_006 NTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
280 290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 PLSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLA
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLV
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pF1KE5 IYLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVIS
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pF1KE5 FLGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAGI
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NP_003 FAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGL
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pF1KE5 VLISYGLILLAILKMYSAEGRRKVFSTCGAHLTGVSIYYGTILFMYVRPSSSYASDHDMI
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pF1KE5 VSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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NP_003 ASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
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>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 929; 44.7% identity (77.7% similar) in 300 aa overlap (44-343:6-305)
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pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLAI
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pF1KE5 YLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVISF
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pF1KE5 SIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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NP_001 SVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLAI
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIF
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pF1KE5 YLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVISF
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NP_001 YLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISY
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pF1KE5 LGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAGIL
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....:. :: . .:: .. . ::..: :: .: :::.:.: .. . . :. ....
NP_001 NSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILI
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NP_001 LTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFI
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NP_001 ALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 858; 43.8% identity (75.0% similar) in 304 aa overlap (44-347:5-306)
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pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLAI
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGV
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pF1KE5 YLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVISF
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NP_003 YLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAF
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NP_003 TLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGIL
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... :. . : . :.: : . ::. : :: .. .:::.... .: . : :. ....
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NP_003 LVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--V
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pF1KE5 SIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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NP_003 SVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 870 init1: 767 opt: 829 Z-score: 895.0 bits: 174.0 E(85289): 4.1e-43
Smith-Waterman score: 829; 43.8% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (44-346:5-308)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTD-NLELQIIFFFLFLA
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLT
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80 90 100 110 120 130
pF1KE5 IYLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVIS
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NP_835 IYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTIS
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pF1KE5 FLGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAGI
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NP_835 FLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGF
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pF1KE5 LHATIHTVATFSLSFCGANEIRRVFCDIPPLLAISYSDTHTNQLLVFYFVGSIELVTI--
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NP_835 PVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCAD--TALFEIYAIVGTILVVMIPC
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pF1KE5 LIVLISYGLILLAILKMYSAEGRRKVFSTCGAHLTGVSIYYGTILFMYVRPSSSYASDHD
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NP_835 LLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESK
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pF1KE5 MIVSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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NP_835 KLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLAI
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XP_011 YLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISF
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pF1KE5 LGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAGIL
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pF1KE5 VSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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XP_011 ATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 840 init1: 784 opt: 823 Z-score: 888.7 bits: 172.8 E(85289): 9.2e-43
Smith-Waterman score: 823; 41.8% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (44-346:5-307)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLAI
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSM
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NP_036 YLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISF
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pF1KE5 LGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAGIL
::..:.... : . ::::.::::..::. .:: :...:. .. :. . .:.. :
NP_036 CGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANL
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pF1KE5 HATIHTVATFSLSFCGANEIRRVFCDIPPLLAISYSDTHTNQLLVFYFVGSIELVT-ILI
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NP_036 NVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSE-GALVMITPFLC
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pF1KE5 VLISYGLILLAILKMYSAEGRRKVFSTCGAHLTGVSIYYGTILFMYVRPSSSYASDHDMI
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NP_036 ILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTM
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pF1KE5 VSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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NP_036 ATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 840 init1: 784 opt: 823 Z-score: 888.5 bits: 172.8 E(85289): 9.4e-43
Smith-Waterman score: 823; 41.8% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (44-346:15-317)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 LSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFLAI
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSM
10 20 30 40
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pF1KE5 YLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVISF
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XP_011 YLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISF
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 LGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAGIL
::..:.... : . ::::.::::..::. .:: :...:. .. :. . .:.. :
XP_011 CGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 HATIHTVATFSLSFCGANEIRRVFCDIPPLLAISYSDTHTNQLLVFYFVGSIELVT-ILI
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XP_011 NVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSE-GALVMITPFLC
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 VLISYGLILLAILKMYSAEGRRKVFSTCGAHLTGVSIYYGTILFMYVRPSSSYASDHDMI
.: :: : ..::. :..:: :.:::::.::. : ..:.::. .: : ::.....: .
XP_011 ILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTM
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350
pF1KE5 VSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
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XP_011 ATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310 320
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 813 init1: 813 opt: 817 Z-score: 882.3 bits: 171.6 E(85289): 2.1e-42
Smith-Waterman score: 817; 39.7% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (42-346:1-305)
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pF1KE5 IPLSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNLELQIIFFFLFL
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVL
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pF1KE5 AIYLFTLMGNLGLILLVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTTKNKVI
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NP_009 TSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTI
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pF1KE5 SFLGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINASYVAG
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NP_009 SFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIG
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pF1KE5 ILHATIHTVATFSLSFCGANEIRRVFCDIPPLLAISYSDTHTNQLLVFYFVGSIELVTIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]