Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5580
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5580, 357 aa
1>>>pF1KE5580 357 - 357 aa - 357 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7850+/-0.000432; mu= 19.5751+/- 0.027
mean_var=96.8453+/-25.342, 0's: 0 Z-trim(111.1): 292 B-trim: 1202 in 1/50
Lambda= 0.130327
statistics sampled from 19176 (19629) to 19176 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 7.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1269 249.5 7.6e-66
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1204 237.2 3.6e-62
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1166 230.1 5e-60
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1165 229.9 5.9e-60
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 1034 205.3 1.5e-52
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1002 199.3 9.9e-51
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1002 199.3 9.9e-51
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1002 199.3 9.9e-51
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 946 188.7 1.5e-47
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 887 177.7 3.3e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 883 176.9 5.3e-44
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 881 176.5 6.9e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 881 176.5 6.9e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 881 176.5 6.9e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 881 176.5 7.1e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 875 175.4 1.5e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 873 175.0 2e-43
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 843 169.4 9.8e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 829 166.7 6e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 731 148.3 2.1e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 504 105.6 1.5e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 470 99.3 1.3e-20
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 207 49.8 1e-05
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 203 49.1 1.9e-05
NP_006134 (OMIM: 602927) probable G-protein couple ( 415) 201 48.8 2.5e-05
XP_016874705 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 200 48.6 2.9e-05
XP_011518927 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 200 48.6 2.9e-05
XP_016874701 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 200 48.7 3e-05
XP_011518925 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 200 48.7 3e-05
XP_016874702 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 200 48.7 3e-05
XP_016874703 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 200 48.7 3e-05
XP_016874704 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 200 48.7 3e-05
XP_011518926 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 200 48.7 3e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 193 47.3 7.4e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 188 46.4 0.00014
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 186 45.9 0.00016
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 183 45.4 0.00025
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 183 45.4 0.00025
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 182 45.2 0.00028
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 181 44.9 0.0003
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 180 44.8 0.00036
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 179 44.6 0.00042
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 178 44.3 0.00043
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 178 44.4 0.00044
XP_011543933 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 178 44.4 0.00047
XP_011544481 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 178 44.4 0.00047
XP_005274486 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 178 44.4 0.00047
XP_011543934 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 178 44.4 0.00047
XP_011544480 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 178 44.4 0.00047
XP_005274835 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 178 44.4 0.00047
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1269 init1: 1269 opt: 1269 Z-score: 1303.2 bits: 249.5 E(85289): 7.6e-66
Smith-Waterman score: 1269; 59.9% identity (85.8% similar) in 302 aa overlap (4-305:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MCFDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEVPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FGTCGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 KEAFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
. : :::.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 1204 init1: 1204 opt: 1204 Z-score: 1237.1 bits: 237.2 E(85289): 3.6e-62
Smith-Waterman score: 1204; 57.5% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (4-309:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
::.::.:.::::. :.: :::.:::...:. :. .::.:. ::..:.: ..:: : ::
NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE5 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
:.::..: .
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 1166 init1: 1166 opt: 1166 Z-score: 1198.7 bits: 230.1 E(85289): 5e-60
Smith-Waterman score: 1166; 58.0% identity (83.4% similar) in 295 aa overlap (4-298:2-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
::.::.:.::::. :.: :::.:::...:. :. .::.:. ::..:.: ..:: : ::
XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
::::..::: ::. :: .. ::..:..:..:::.::. :. :::::.::.:.::::::
XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE5 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
XP_011 GS
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 1169 init1: 1148 opt: 1165 Z-score: 1197.4 bits: 229.9 E(85289): 5.9e-60
Smith-Waterman score: 1165; 56.4% identity (83.1% similar) in 314 aa overlap (1-313:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
:::..::.::: .:::..::.: :. . :.::: ::. :::.::.::..:::::::: .
NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
:: ::::.:::: .::. ::: :....: : .::. .: ::..: :::.:::::. :
NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE5 FKRLV-AKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
. ::. .: :..:
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 1032 init1: 889 opt: 1034 Z-score: 1064.4 bits: 205.3 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 1034; 50.5% identity (78.6% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
::: :::: :::..:. ::: ::.. . .:::.. :.:.:..:: .: :.: ::::: .
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
::.:::: ::.: :: ..: :::..:: ::. ::...:. :..: : . . :::::
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPK--SSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
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pF1KE5 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
.........
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50
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:...:. :
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 1057 init1: 997 opt: 1002 Z-score: 1031.8 bits: 199.3 E(85289): 9.9e-51
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10 20 30 40 50
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:...:. :
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 1057 init1: 997 opt: 1002 Z-score: 1031.8 bits: 199.3 E(85289): 9.9e-51
Smith-Waterman score: 1002; 49.3% identity (79.6% similar) in 304 aa overlap (5-307:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPW-LEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSD-WDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 934 init1: 902 opt: 946 Z-score: 974.8 bits: 188.7 E(85289): 1.5e-47
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pF1KE5 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPP--FVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKL
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NP_835 MAIGNWTEIS---EFILMSFSSLP-TEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPML
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NP_835 HSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLL
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NP_835 HFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKH
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NP_835 KAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNS
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pF1KE5 EVKEAFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRK
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NP_835 EVKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 877 init1: 694 opt: 887 Z-score: 914.7 bits: 177.7 E(85289): 3.3e-44
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]