Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5537, 436 aa
1>>>pF1KE5537 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3858+/-0.000827; mu= 16.8617+/- 0.050
mean_var=64.1110+/-13.246, 0's: 0 Z-trim(106.8): 20 B-trim: 499 in 1/49
Lambda= 0.160180
statistics sampled from 9149 (9168) to 9149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 2907 680.5 8.6e-196
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 2314 543.5 1.4e-154
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 ( 419) 1762 415.9 3.7e-116
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 ( 419) 1583 374.5 1.1e-103
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 1493 353.7 1.9e-97
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 1185 282.6 4.8e-76
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 ( 437) 1004 240.8 2.1e-63
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 ( 417) 987 236.8 3e-62
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 971 233.1 4e-61
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 914 219.9 3.7e-57
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 ( 374) 737 179.0 6.8e-45
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 529 131.0 2.1e-30
>>CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (436 aa)
initn: 2907 init1: 2907 opt: 2907 Z-score: 3628.5 bits: 680.5 E(32554): 8.6e-196
Smith-Waterman score: 2907; 99.8% identity (99.8% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
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CCDS58 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS58 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEERQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE5 WMALRTIMEHTLNHPY
::::::::::::::::
CCDS58 WMALRTIMEHTLNHPY
430
>>CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (403 aa)
initn: 2314 init1: 2314 opt: 2314 Z-score: 2888.5 bits: 543.5 E(32554): 1.4e-154
Smith-Waterman score: 2314; 99.7% identity (99.7% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS47 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEERQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELMWPVGSPSTGPMTV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
CCDS47 ASSTPSALSSGTLGSMASCCRPHRSSPRPRRRGWRFGPSWSTP
370 380 390 400
>>CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1762 init1: 1762 opt: 1762 Z-score: 2198.8 bits: 415.9 E(32554): 3.7e-116
Smith-Waterman score: 1762; 60.0% identity (83.7% similar) in 418 aa overlap (19-436:2-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
: :::.: .:.:..:. .:.: ::::. . :: :.. . .::
CCDS58 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQA
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CCDS58 DLEHLQLDFWRGPAHPGSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
: : :::..:.:..::::::::...: .: :. .::::::::..:.. : :::::
CCDS58 MFAFRSRARSTDTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
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CCDS58 TGGSKRPAIWIDTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNP
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
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CCDS58 DGFAFTHSTNRMWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYHGKFANSE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYKV
:: .::.:. :::.::.::::::::.:::::: ::: .: :: .:.: :: :: ..
CCDS58 VEVKSIVDFVKDHGNIKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
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CCDS58 YGTKFNYGSIIKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKET
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE5 WMALRTIMEHTLNHPY
:.:: :::::::::::
CCDS58 WLALLTIMEHTLNHPY
410
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1387 init1: 1101 opt: 1583 Z-score: 1975.2 bits: 374.5 E(32554): 1.1e-103
Smith-Waterman score: 1583; 53.6% identity (82.3% similar) in 418 aa overlap (19-436:4-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
: .: :. ... .:.:::::... ..:.:.. : .::
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLETFVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQA
. . ..:::..:. :. . .:::: ... .:..:::.:.::::::.:.:::::. .
CCDS58 AQEHLQLDFWKSPTTPGETAHVRVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLDKENEE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
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CCDS58 MLFNRRRERSGN-FNFGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNVLKFS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
:::.. ::::.:.:::.:::.:.::..::::::::::::: .:.::.:.:::. ::::
CCDS58 TGGDK-PAIWLDAGIHAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLPVTNP
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
::..:... ::.:::..: : .:.::: :::: .:::: :..:::::..::::: .::
CCDS58 DGYVFSQTKNRMWRKTRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPSANSE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYKV
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CCDS58 VEVKSIVDFIKSHGKVKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSLRSL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
:: .: : : ...: ::: ..::.:: ::::.:.:::::::.::::::: ::.:::.::
CCDS58 HGTKYKVGPICSVIYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEET
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE5 WMALRTIMEHTLNHPY
:..:..::::. .:::
CCDS58 WLGLKAIMEHVRDHPY
410
>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 1492 init1: 1056 opt: 1493 Z-score: 1862.8 bits: 353.7 E(32554): 1.9e-97
Smith-Waterman score: 1493; 51.2% identity (80.7% similar) in 420 aa overlap (18-436:2-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
: :.. ..: .. :: .: ::::::. ... ..: :..:
CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQA
. . :..::..:. . :::. :: :. .:..:.:.:: :.. :.:.:.:::. .
CCDS58 NSNNLKLNFWKSPSSFNRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
: ... :::.:.:.:..::.:: :: .::.. . :.. ...::.::::. . :::::
CCDS58 MQHNEGQERSSNNFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE5 TG-GSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTN
:: : :.::.:...::::::::..::.:::: :::::: .: ..:.::. ::::. :.:
CCDS58 TGKGVRRPAVWLNAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVAN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQS
:::...:...::::::..: :: :::.: ::::...:.:.:...:::::.:::: .:
CCDS58 PDGYVYTQTQNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EPEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYK
: :: ..:.:: :::::..:..:::::.:::::: .. . . .:: .:. :..:: .
CCDS58 EVEVKSVVDFIQKHGNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALAS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQE
: : :: : ::.: ::: ..:::::.:::.::.::::::: :::::::.::::::.:
CCDS58 VSGTEYQVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEE
350 360 370 380 390 400
420 430
pF1KE5 TWMALRTIMEHTLNHPY
::..:.:::::. .. :
CCDS58 TWLGLKTIMEHVRDNLY
410 420
>>CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (388 aa)
initn: 1280 init1: 1056 opt: 1185 Z-score: 1478.7 bits: 282.6 E(32554): 4.8e-76
Smith-Waterman score: 1330; 47.9% identity (74.8% similar) in 420 aa overlap (18-436:2-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
: :.. ..: .. :: .: ::::::. ... ..: :..:
CCDS55 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQA
. . :..::..:. . :::. :: :. .:..:.:.:: :.. :.:.:.
CCDS55 NSNNLKLNFWKSPSSFNRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQI--------
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
:: . ::.. . :.. ...::.::::. . :::::
CCDS55 ------------------YHEM-------DNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFS
100 110 120 130
190 200 210 220 230
pF1KE5 TG-GSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTN
:: : :.::.:...::::::::..::.:::: :::::: .: ..:.::. ::::. :.:
CCDS55 TGKGVRRPAVWLNAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVAN
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQS
:::...:...::::::..: :: :::.: ::::...:.:.:...:::::.:::: .:
CCDS55 PDGYVYTQTQNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANS
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EPEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYK
: :: ..:.:: :::::..:..:::::.:::::: .. . . .:: .:. :..:: .
CCDS55 EVEVKSVVDFIQKHGNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALAS
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQE
: : :: : ::.: ::: ..:::::.:::.::.::::::: :::::::.::::::.:
CCDS55 VSGTEYQVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEE
320 330 340 350 360 370
420 430
pF1KE5 TWMALRTIMEHTLNHPY
::..:.:::::. .. :
CCDS55 TWLGLKTIMEHVRDNLY
380
>>CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 (437 aa)
initn: 862 init1: 522 opt: 1004 Z-score: 1251.8 bits: 240.8 E(32554): 2.1e-63
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 GGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLEGLKPQK
..::.:.: . : :.. : . :
CCDS62 RRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKIS--YQLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS62 VDLWQ-PSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGSSL-
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFST
...: .:: ....: ::.:::: .:. .. :: .. ..:: :.:..:...::..
CCDS62 -HTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILKLGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNPD
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CCDS62 RSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSEP
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CCDS62 GYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESEP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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CCDS62 EVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
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CCDS62 YGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTET
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE5 WMALRTIMEHTLNHPY
.:...: : :
CCDS62 MLAVKNITMHLLKKCP
430
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
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Smith-Waterman score: 987; 37.4% identity (69.9% similar) in 422 aa overlap (21-436:5-417)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAAL-GQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDL
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CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIREL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EGLKPQKVDFWRGPA----RPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLD
. ..:::. . .: ::.:: . .. :... : :...:.... ...
CCDS33 ASTT--QIDFWKPDSVTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 EGRQAMAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSIL
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CCDS33 ----AQFDSR--VRATGH-SYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIY
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VLKFSTGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIE
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CCDS33 LLKVGKAGQNKPAIFMDCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LVTNPDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGP
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CCDS33 PVLNIDGYIYTWTKSRFWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SPQSEPEVAAIVNFITAH-GNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAV
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CCDS33 AAESEKETKALADFIRNKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATV
280 290 300 310 320 330
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pF1KE5 EALYKVHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQII
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CCDS33 KELASLHGTKYTYGPGATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIR
340 350 360 370 380 390
420 430
pF1KE5 PTAQETWMALRTIMEHTLNHPY
: .::..:.. . ..:.: :
CCDS33 ATCEETFLAIKYVASYVLEHLY
400 410
>>CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 (417 aa)
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Smith-Waterman score: 971; 36.5% identity (70.9% similar) in 422 aa overlap (19-434:2-415)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAA-ALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDL
: .: ..: .. :.. . : ..:.:: .:::: ... ::
CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EGLKPQKVDFWRGPAR----PSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLD
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CCDS31 A--KTNELDFWYPGATHHVAANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 EGRQAMAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSIL
.: .: : . ::..:.. :.: .: .... .. ..::.:.::.. :.. .
CCDS31 --KQFDVK----EDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLY
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VLKFSTGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIE
:::.. . :. ::. : :::.:::.. : : . . .. ::.....: .:. :...:
CCDS31 VLKIGEKNERRKAIFTDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYIL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
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: : ::. .. . ::.::::.: . :::.:::::....... ....::...:.:
CCDS31 PVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SPQSEPEVAAIVNFITAHGN-FKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAV
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CCDS31 APESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGT
280 290 300 310 320 330
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..: . .::.: : .:.: :: ..::::: :::..:.::::: :..::::: ..:
CCDS31 DVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIK
340 350 360 370 380 390
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:: .:: .:.. : .. :.:
CCDS31 PTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
400 410
>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (423 aa)
initn: 822 init1: 279 opt: 914 Z-score: 1139.7 bits: 219.9 E(32554): 3.7e-57
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 GGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLEGLKPQK
: . ::: .: . .:...: .: .
CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLT--TTYE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VDFWRGPARPSLPVDMR-VPF----SELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEGRQAM
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CCDS94 IVLWQ-PVTADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLI---QQQI
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFST
... :.. :. : .::.:.::::::. .. .: :...::.::.:::. . ::: :
CCDS94 SNDTVSPRASASY-YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 G-GSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
. . ::::: :::.::::. : .: ..:.. :: :..: .:... :.:
CCDS94 KEQAAKNAIWIDCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSG-FGGNGSNSNPCSETYHGPSPQS
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CCDS94 DGYDYSWKKNRMWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPES
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 EPEVAAIVNFITAHGN-FKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALY
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CCDS94 EPEVKAVASFLRRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIE
290 300 310 320 330 340
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CCDS94 KISKNTRYTHGHGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTC
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CCDS94 REAFAAVSKIAWHVIRNV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]