Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5515
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5515, 360 aa
1>>>pF1KE5515 360 - 360 aa - 360 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0683+/-0.000404; mu= 17.4947+/- 0.025
mean_var=67.2158+/-13.779, 0's: 0 Z-trim(110.7): 72 B-trim: 167 in 1/54
Lambda= 0.156437
statistics sampled from 19047 (19119) to 19047 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 5.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002233 (OMIM: 193230,603208,614186) inward rect ( 360) 2380 546.4 3.5e-155
NP_001165888 (OMIM: 193230,603208,614186) inward r ( 280) 1823 420.7 2e-117
NP_002232 (OMIM: 274600,600791,602208,612780) ATP- ( 379) 857 202.7 1.1e-51
NP_001263367 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_006724065 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_733932 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_001263365 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_011527863 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_016883832 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_016883834 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_733933 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_005261032 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_001263368 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_011527862 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_001263364 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_001263366 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 785 186.5 8.5e-47
XP_016883833 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_002234 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 785 186.5 8.5e-47
NP_722451 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 733 174.7 2.9e-43
NP_722448 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 733 174.7 2.9e-43
NP_722450 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 733 174.7 2.9e-43
NP_722449 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 389) 733 174.7 3e-43
NP_000211 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 391) 733 174.7 3e-43
NP_000882 (OMIM: 170390,600681,609622,613980) inwa ( 427) 676 161.9 2.4e-39
NP_037480 (OMIM: 603953) ATP-sensitive inward rect ( 436) 675 161.7 2.8e-39
XP_011522133 (OMIM: 602323) PREDICTED: ATP-sensiti ( 433) 643 154.5 4.2e-37
XP_005256682 (OMIM: 602323) PREDICTED: ATP-sensiti ( 433) 643 154.5 4.2e-37
NP_066292 (OMIM: 602323) ATP-sensitive inward rect ( 433) 643 154.5 4.2e-37
NP_001181887 (OMIM: 613236,613239) inward rectifie ( 433) 634 152.4 1.7e-36
XP_005276976 (OMIM: 613236,613239) PREDICTED: inwa ( 535) 634 152.5 2e-36
NP_004974 (OMIM: 600932) G protein-activated inwar ( 393) 630 151.5 3e-36
XP_016856736 (OMIM: 600932) PREDICTED: G protein-a ( 450) 630 151.5 3.3e-36
NP_002231 (OMIM: 600877,614098) G protein-activate ( 423) 628 151.1 4.3e-36
NP_000881 (OMIM: 600734,613485,613677) G protein-a ( 419) 626 150.6 5.9e-36
XP_011541112 (OMIM: 600734,613485,613677) PREDICTE ( 419) 626 150.6 5.9e-36
XP_011541111 (OMIM: 600734,613485,613677) PREDICTE ( 419) 626 150.6 5.9e-36
NP_002230 (OMIM: 601534) G protein-activated inwar ( 501) 620 149.3 1.7e-35
NP_001278554 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418) 558 135.3 2.4e-31
XP_011523083 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 418) 558 135.3 2.4e-31
XP_016880102 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 418) 558 135.3 2.4e-31
NP_001257351 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418) 558 135.3 2.4e-31
NP_001278553 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418) 558 135.3 2.4e-31
XP_016880099 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 558 135.3 2.6e-31
NP_001278551 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 453) 558 135.3 2.6e-31
XP_016880098 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 558 135.3 2.6e-31
XP_016880101 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 558 135.3 2.6e-31
NP_733938 (OMIM: 605722) inward rectifier potassiu ( 453) 558 135.3 2.6e-31
XP_016880100 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 558 135.3 2.6e-31
XP_005257394 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 558 135.3 2.6e-31
NP_061128 (OMIM: 605722) inward rectifier potassiu ( 453) 558 135.3 2.6e-31
>>NP_002233 (OMIM: 193230,603208,614186) inward rectifie (360 aa)
initn: 2380 init1: 2380 opt: 2380 Z-score: 2906.9 bits: 546.4 E(85289): 3.5e-155
Smith-Waterman score: 2380; 99.2% identity (99.2% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRGLAYLRDAWGILMDMRWRWMMLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRGLAYLRDAWGILMDMRWRWMMLVF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAFSFSLETQLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAFSFSLETQLTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSIRFTDIAVVAH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_002 GYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSIRFTDTAVVAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQERENGKLYQTSVDFHLDGISSDECPFFIFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQERENGKLYQTSVDFHLDGISSDECPFFIFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRRTSYLQSEIMLHHCFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_002 LTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRRTSYLPSEIMLHHCFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHINGQSIDNFQISETGLTE
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SLLTRGSKGEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHINGQSIDNFQISETGLTE
310 320 330 340 350 360
>>NP_001165888 (OMIM: 193230,603208,614186) inward recti (280 aa)
initn: 1823 init1: 1823 opt: 1823 Z-score: 2229.1 bits: 420.7 E(85289): 2e-117
Smith-Waterman score: 1823; 98.9% identity (98.9% similar) in 280 aa overlap (81-360:1-280)
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAF
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAAF
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFSI
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQERENGKLYQTSVDFHLDGIS
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFTDTAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQERENGKLYQTSVDFHLDGIS
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRRTSYLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQRRTSYLP
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHINGQSIDN
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEIMLHHCFASLLTRGSKGEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHINGQSIDN
220 230 240 250 260 270
360
pF1KE5 FQISETGLTE
::::::::::
NP_001 FQISETGLTE
280
>>NP_002232 (OMIM: 274600,600791,602208,612780) ATP-sens (379 aa)
initn: 812 init1: 403 opt: 857 Z-score: 1048.9 bits: 202.7 E(85289): 1.1e-51
Smith-Waterman score: 857; 44.9% identity (72.0% similar) in 321 aa overlap (11-322:19-334)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQ--RYRRMVTKDGHSTLQMDG-AQRGLAYLRDAWGILM
::.. : ::..::::.:...:. :.. . ::.: : ..
NP_002 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDL-ELDHDAPPENHTICVKYITSFTA
::.::. .:.:::.:. :..:.:.::..: .::: ::: :: ::: :: . ..:.
NP_002 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELD---PPANHTPCVVQVHTLTG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 AFSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAF
:: ::::.: ::::: . : .:: ::.:: :..: .:: ::::.:.:::::::.::
NP_002 AFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SIRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGKLYQTSVD
.:::.. :::: .::: :...::: : : : . .:.. : : : :: .: :..:
NP_002 TIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 FHLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLLQHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQ
:..: .... ::.:.:::.:: . .::: : . . . ::::..::. :.:. ::
NP_002 FQVD--TASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 RRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHI
::::: ::. . :. .. ... .: . ::..:
NP_002 VRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKL
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KE5 NGQSIDNFQISETGLTE
NP_002 KLEESLREQAEKEGSALSVRISNV
360 370
>>NP_001263367 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward recti (375 aa)
initn: 714 init1: 359 opt: 785 Z-score: 961.2 bits: 186.5 E(85289): 8.5e-47
Smith-Waterman score: 785; 41.9% identity (71.9% similar) in 310 aa overlap (19-320:28-332)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRG--LAYLRDAWGILM
:...:.:::....: .. : : ::.: : ..
NP_001 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVD-GIYLLYLQDLWTTVI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAA
::.::. . .:.:.::. :..:.:..:..: ..:::: : ::: :. . :.:.:
NP_001 DMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLE--PGEPISNHTPCIMKVDSLTGA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFS
: ::::.: :::::. . .:: :: ::. :... ..: ::::.:.:::::::.:: .
NP_001 FLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRAET
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGKLYQTSVDF
:.:. ::.....:: :..:::: : : : . ..:. : : : : : :..: :
NP_001 IKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATVKF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 HLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLL-QHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQ
:.: ::.: ::.:.:.:.:: . .::: : :. . ..:::::.:.: :.:. .::
NP_001 HVD--SSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 RRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHI
::::. ::. :. ... ... .: . .:..
NP_001 SRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRKSPDCTFYCADSEKQQLEEKY
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KE5 NGQSIDNFQISETGLTE
NP_001 RQEDQRERELRTLLLQQSNV
360 370
>>XP_006724065 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensitive i (375 aa)
initn: 714 init1: 359 opt: 785 Z-score: 961.2 bits: 186.5 E(85289): 8.5e-47
Smith-Waterman score: 785; 41.9% identity (71.9% similar) in 310 aa overlap (19-320:28-332)
10 20 30 40
pF1KE5 MDSSNCKVIAPLLSQRYRRMVTKDGHSTLQMDGAQRG--LAYLRDAWGILM
:...:.:::....: .. : : ::.: : ..
XP_006 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVD-GIYLLYLQDLWTTVI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DMRWRWMMLVFSASFVVHWLVFAVLWYVLAEMNGDLELDHDAPPENHTICVKYITSFTAA
::.::. . .:.:.::. :..:.:..:..: ..:::: : ::: :. . :.:.:
XP_006 DMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLE--PGEPISNHTPCIMKVDSLTGA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FSFSLETQLTIGYGTMFPSGDCPSAIALLAIQMLLGLMLEAFITGAFVAKIARPKNRAFS
: ::::.: :::::. . .:: :: ::. :... ..: ::::.:.:::::::.:: .
XP_006 FLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRAET
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IRFTDIAVVAHMDGKPNLIFQVANTRPSPLTSVRVSAVLYQ-----ERENGKLYQTSVDF
:.:. ::.....:: :..:::: : : : . ..:. : : : : : :..: :
XP_006 IKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATVKF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 HLDGISSDECPFFIFPLTYYHSITPSSPLATLL-QHENPSHFELVVFLSAMQEGTGEICQ
:.: ::.: ::.:.:.:.:: . .::: : :. . ..:::::.:.: :.:. .::
XP_006 HVD--SSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 RRTSYLQSEIMLHHCFASLLTRGSKCEYQIKMENFDKTVPEFPTPLVSKSPNRTDLDIHI
::::. ::. :. ... ... .: . .:..
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360 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]