Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5496
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5496, 350 aa
1>>>pF1KE5496 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3714+/-0.00125; mu= 16.0937+/- 0.074
mean_var=128.6659+/-40.916, 0's: 0 Z-trim(102.2): 388 B-trim: 819 in 2/47
Lambda= 0.113069
statistics sampled from 6338 (6829) to 6338 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 2299 387.3 1.1e-107
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 2044 345.6 3.4e-95
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 978 171.7 7.3e-43
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 969 170.2 2e-42
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 952 167.5 1.4e-41
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 948 166.8 2.2e-41
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 941 165.7 4.8e-41
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 923 162.8 3.8e-40
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 916 161.6 8.2e-40
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 914 161.3 1e-39
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 913 161.1 1.2e-39
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 895 158.2 8.7e-39
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 895 158.2 8.7e-39
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 893 157.8 1.1e-38
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 891 157.5 1.4e-38
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 882 156.0 3.8e-38
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 882 156.1 4e-38
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 864 153.1 2.9e-37
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 863 153.0 3.3e-37
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 852 151.2 1.2e-36
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 848 150.5 1.8e-36
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 844 149.9 2.8e-36
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 842 149.5 3.5e-36
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 824 146.6 2.7e-35
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 815 145.1 7.4e-35
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 810 144.3 1.3e-34
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 791 141.2 1.1e-33
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 789 140.9 1.4e-33
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 783 139.9 2.8e-33
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 763 136.6 2.6e-32
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 760 136.2 3.9e-32
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 754 135.2 7.9e-32
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 748 134.2 1.4e-31
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 734 131.9 7e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 731 131.4 1e-30
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 726 130.6 1.8e-30
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 713 128.6 8.3e-30
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 704 127.0 2.1e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 701 126.5 2.9e-29
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 694 125.4 6.5e-29
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 692 125.1 8.3e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 682 123.4 2.5e-28
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 679 122.9 3.5e-28
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 676 122.5 5.1e-28
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 669 121.3 1.1e-27
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 658 119.5 3.8e-27
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 655 119.0 5.3e-27
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 634 115.6 5.8e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 622 113.6 2.2e-25
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 612 112.0 6.9e-25
>>CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 (350 aa)
initn: 2299 init1: 2299 opt: 2299 Z-score: 2047.0 bits: 387.3 E(32554): 1.1e-107
Smith-Waterman score: 2299; 99.7% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSAMYIIALLGNTIIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RAIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RAIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE5 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
310 320 330 340 350
>>CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2044 init1: 2044 opt: 2044 Z-score: 1822.6 bits: 345.6 E(32554): 3.4e-95
Smith-Waterman score: 2044; 95.4% identity (97.8% similar) in 324 aa overlap (27-350:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS59 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RAIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
::. .::::::..:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVHSYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS59 VAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE5 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
:::::::::::::::::::::::::::::: : ::::::: :::::::::
CCDS59 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
280 290 300 310 320
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 886 init1: 605 opt: 978 Z-score: 883.0 bits: 171.7 E(32554): 7.3e-43
Smith-Waterman score: 978; 44.6% identity (81.5% similar) in 303 aa overlap (32-334:4-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 CQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISL
.:... :..:.:.:::::.. :.:.. .
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSS
..:..:::::. :. .: ...: .:::. :: .:...:...... ::.:..::
CCDS31 CSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREPMFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITIR
:...:: .:::..: :..:. .::.::::::::.: :::: ::: ::..:.:: :.::
CCDS31 INYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAMAFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDV
.. :. ... .:::: .....::::::...:.:.:.. ...:.:. :..: ..
CCDS31 PVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSYCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV-LNL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVPL
..:. ::. ::.::: : :. ::::::::::.::::. ..:.:.. :. . .:... :
CCDS31 VLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQI-PG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE5 HTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
. ..:.:.::.::: .:::::::.::::.:::.
CCDS31 YIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQIRERVLYVFTKK
280 290 300 310
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 965 init1: 942 opt: 969 Z-score: 875.0 bits: 170.2 E(32554): 2e-42
Smith-Waterman score: 969; 45.5% identity (79.5% similar) in 303 aa overlap (39-341:12-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 CILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYIIA
: .:.:.:::::...:.:.:: . :::..:
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSISFSACF
:.::. .. .: ::.. : ::: :::.:. .:....:..::::..:. . :::..:.
CCDS31 LVGNAALILVIAMDNALHAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITIRAIIAITP
.::: :: :.:...::.::::::::::.::.: ::. :. .... .:.. ..:
CCDS31 AQMFCVHSIYALESSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVAFIAASY
. ... .::.:: :..:.::::...::::::. . . .:.: . : .: : .:: ::
CCDS31 FIFLLRRLPYCGHRVMTHTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVPLHTQVLLA
.::.::: : :. :: :::::::::.:.. ..:.:.. :. . .:. :: :....::
CCDS31 GFILHAVFHLPSHDAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLA
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE5 DLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
.:::..: .::::.:: :::..: :. . :.:.
CCDS31 NLYVLVPPVLNPILYGARTKEIRSRLLK-LLHLGKTSI
290 300 310
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 928 init1: 790 opt: 952 Z-score: 859.9 bits: 167.5 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 952; 46.5% identity (75.6% similar) in 312 aa overlap (33-344:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 QQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLS
: :. :: :.: :::::.. :.::.: :
CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSI
.:: :.:::......: :. . : ::: :: .::..::......::: ..:: .:
CCDS53 LIYITAVLGNSILIVVIVMERNLHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITIRA
.:.:: :: ::::. . :...::.:::::.:::: ::.: .:: :. ...:. :.
CCDS53 AFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVA
. : :. .....:::: .:.: :::::::..::::::: . . :.. .:: ::
CCDS53 FCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVPLH
.::.:: :::.::: : :. :. :::::::::. :. ..:.:.. .. . .:... : :
CCDS53 LIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNI-PQH
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE5 TQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
...:::.::: .: ::::.::..:::.:: . : .::
CCDS53 VHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQIREGV----AHRFFDIKTWCCTSPLGS
280 290 300 310 320
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 936 init1: 641 opt: 948 Z-score: 856.5 bits: 166.8 E(32554): 2.2e-41
Smith-Waterman score: 948; 44.4% identity (78.5% similar) in 302 aa overlap (33-334:9-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 QQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLS
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSI
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CCDS31 FVYLVALLGNTALLFVIQTEQSLHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITIRA
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CCDS31 SFGGCLSHMFFIHFFTAMESIVLVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVA
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CCDS31 LYMVVPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLL-LDVI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVPLH
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CCDS31 LIILSYVRILYAVFCLPSWEARLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNI-PQY
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE5 TQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
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CCDS31 IHIILANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQIRERVLRIFLKTNH
280 290 300 310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 941; 44.9% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (30-334:2-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
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CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
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CCDS31 FCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQPMFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
:::..:. ::::.:. :..:: ::..::.::.::::.::.: ::: ... .. ...
CCDS31 EISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVMAYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RAIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
: .. .::. ... .::::: :.: :.:::: .:: :::: . .:.:. : .. :
CCDS31 RNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTYCEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYII-VD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
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CCDS31 VILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNI-P
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE5 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
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CCDS31 HYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQIREQIVKIFVQKE
280 290 300 310
>>CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 (329 aa)
initn: 917 init1: 786 opt: 923 Z-score: 834.3 bits: 162.8 E(32554): 3.8e-40
Smith-Waterman score: 923; 42.3% identity (76.5% similar) in 310 aa overlap (25-334:14-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
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CCDS44 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQP-SFLLVGIPGLEESQHWIALP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
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CCDS44 LGILYLLALVGNVTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAIDLVLASSTAPKALAVLLVHAH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
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CCDS44 EIGYIVCLIQMFFIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RAIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
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CCDS44 RGLLLLIPFPILLGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLD
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
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CCDS44 VLAIGVSYAHILQAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHV-P
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE5 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
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CCDS44 HHVHVLLATRYLLMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
290 300 310 320
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 902 init1: 797 opt: 916 Z-score: 828.2 bits: 161.6 E(32554): 8.2e-40
Smith-Waterman score: 916; 43.2% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (32-334:10-311)
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pF1KE5 CQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISL
.: . .:. :.:::::::.. :.:..: .
CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSS
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CCDS31 CIIYIVAVVGNCILLYLIVVEHSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGARE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITIR
:.: .:.:::::.: ......:..::::.:::::.::.: ::::.... .:.:..:
CCDS31 ITFPGCLTQMFFLHYNFVLDSAILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDV
.. : : .... :::: . .. :.:::::..:.::::: . :.. . : :::
CCDS31 SFCIILPDVFLLTCLPFCRTRIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDV
160 170 180 190 200 210
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.::.:: :: ::::: :. : :::.:::::: :. ..: :.. :: : .:..:
CCDS31 ILIAVSYAHILCAVFGLPSQDACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRT
220 230 240 250 260 270
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pF1KE5 HTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
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CCDS31 F-HIMFANLYIVIPPALNPMVYGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
280 290 300 310 320
>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 897 init1: 767 opt: 914 Z-score: 826.5 bits: 161.3 E(32554): 1e-39
Smith-Waterman score: 914; 44.1% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (31-334:3-305)
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pF1KE5 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
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CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSAMYIIALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
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CCDS31 FCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
:.: ::..::::.: . .:...::.::::::::::::::: ..:: ... ..:: .
CCDS31 EINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVA
100 110 120 130 140 150
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CCDS31 RAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLD
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
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CCDS31 LLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAP
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pF1KE5 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]