FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5494, 348 aa
1>>>pF1KE5494 348 - 348 aa - 348 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3205+/-0.00153; mu= 10.5171+/- 0.088
mean_var=196.3128+/-75.220, 0's: 0 Z-trim(99.8): 422 B-trim: 366 in 1/46
Lambda= 0.091538
statistics sampled from 5364 (5880) to 5364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1361 193.6 1.9e-49
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1358 193.2 2.4e-49
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CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1220 175.0 7.6e-44
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CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1168 168.1 8.9e-42
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1139 164.3 1.3e-40
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1124 162.3 5e-40
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CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1038 150.9 1.3e-36
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1037 150.8 1.4e-36
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1033 150.3 2e-36
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1033 150.3 2e-36
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1030 149.9 2.7e-36
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1027 149.5 3.6e-36
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1026 149.3 3.9e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1019 148.4 7.3e-36
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CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 985 143.9 1.6e-34
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CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 954 139.8 2.9e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 916 134.8 9.4e-32
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 893 131.8 7.7e-31
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 890 131.4 1e-30
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 885 130.7 1.6e-30
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 2166 init1: 2166 opt: 2166 Z-score: 1575.3 bits: 300.0 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 2166; 98.3% identity (99.1% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.:::
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 IFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
::: :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 1467 init1: 1443 opt: 1475 Z-score: 1082.5 bits: 208.7 E(32554): 5.6e-54
Smith-Waterman score: 1475; 67.7% identity (89.7% similar) in 319 aa overlap (25-340:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
:...: : :.::::::: ::..:: : : ::.::
CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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CCDS32 VIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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CCDS32 CIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
:::.::::::::::: ::::::::: ::::::.:.:.. .:::..::.::::.: :::
CCDS32 LSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
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CCDS32 SYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTLASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 IFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKP---SQVSVVIRNVLFLETK
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CCDS32 VFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
280 290 300 310 320
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 1382; 66.6% identity (88.5% similar) in 305 aa overlap (25-328:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYV
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHT-PMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFD
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CCDS32 AIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPMYFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ACLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIH
.:.:::::.:. :.::::::::::::::::::::::::.:: ..:. ::: :: :::.:
CCDS32 GCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVH
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TTSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLV
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CCDS32 SISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFCDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLL
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pF1KE5 VSYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFY
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CCDS32 ISYTVILLAIRQRAAGSTSKALSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFY
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 TIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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CCDS32 TIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMKKLQNRRVTFQ
280 290 300 310
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1381 init1: 1355 opt: 1361 Z-score: 1001.3 bits: 193.6 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 1361; 62.7% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (25-330:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
: .::.: :.::::::::.: :: :.: ::..:.
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
. .::: :::. .. ::.:..::::::..:::::.: ..::::::..::.. ::::.:..
CCDS32 TSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMYFLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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CCDS32 CMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAYDRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
.:.:::::.:::::::.::::::::::: .:::.::: . .. ...::..::: :: :..
CCDS32 VSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCDLPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALII
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
:::.::. :: ::: . .:: :::::::::: :::::::..:.:::: ::: :.::::
CCDS32 SYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTLTAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 IFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
. ::.:::..:.:::..::::: ::..:..
CCDS32 VCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWKLRNRHVNSWKN
280 290 300 310
>>CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 (304 aa)
initn: 1377 init1: 1351 opt: 1358 Z-score: 999.3 bits: 193.2 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 1358; 67.0% identity (89.3% similar) in 300 aa overlap (25-324:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
:...::: :.::.:::::.:..:: ..:: ::....
CCDS32 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
.:.:::.::..::: :: :::::::::..:: ::. .:::::::::.::: ::::.. .
CCDS32 GIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMYFLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
: .:.::.::. ::::.:::.:: ::::::::::::::.:: :: . :.: :. :::.:.
CCDS32 CYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAIDRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
.::.:: ..::::::: .:::::::::: :::: :::...::..::::.::: ::::.:
CCDS32 SSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCDLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
:: ::. .:: :.. .:: :::.::::::::::.::.:::::::: :::::.:.::::
CCDS32 SYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 IFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
::::.:::..:::::.:::::..:
CCDS32 IFTPLLNPIIYTLRNQEVKAAIKKRLCI
280 290 300
>>CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 (343 aa)
initn: 1329 init1: 1329 opt: 1338 Z-score: 984.5 bits: 190.6 E(32554): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 1338; 59.7% identity (87.1% similar) in 325 aa overlap (1-325:8-332)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFL
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CCDS32 MALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TFSLLYLAILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVR
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CCDS32 LFSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KTIAFDACLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISW
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CCDS32 KVISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FVGFIHTTSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLS
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CCDS32 LLGLLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SFLLLVVSYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDK
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CCDS32 CFIILLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE5 VLAVFYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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CCDS32 FLAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
310 320 330 340
>>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa)
initn: 1315 init1: 1315 opt: 1333 Z-score: 981.3 bits: 189.9 E(32554): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 1333; 61.4% identity (89.2% similar) in 306 aa overlap (25-330:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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CCDS32 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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CCDS32 ATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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CCDS32 CLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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CCDS32 MSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SYTVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
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CCDS32 SYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 IFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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CCDS32 IFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRKLKNRFLNFNKAMPS
280 290 300 310
>>CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 (305 aa)
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Smith-Waterman score: 1265; 58.8% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (33-326:2-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYLAI
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CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDACL
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CCDS32 VFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHTTS
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CCDS32 VQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVVSY
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CCDS32 QLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYTIF
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CCDS32 TIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 TPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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CCDS32 TPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAHSSVKF
280 290 300
>>CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 (305 aa)
initn: 1288 init1: 1264 opt: 1264 Z-score: 932.2 bits: 180.8 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1264; 58.8% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (33-326:2-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYLAI
::::..::::.:.::: :::. : ..: .:
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDACL
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CCDS32 VFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHTTS
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CCDS32 VQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVVSY
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CCDS32 QLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYTIF
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CCDS32 TIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 TPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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CCDS32 TPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAHSSVKF
280 290 300
>>CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 (305 aa)
initn: 1285 init1: 1261 opt: 1261 Z-score: 930.0 bits: 180.4 E(32554): 1.8e-45
Smith-Waterman score: 1261; 58.8% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (33-326:2-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYLAI
::::..::::.:.::: :::. : ..: .:
CCDS30 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDACL
..::.::..::.:::.::.:::::::.::.::. ..: ..::::.::. ::.:.: .::
CCDS30 VFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHTTS
.:::..:.: :::::.:..:..:::.:::::::: :.: .:: .. ..: .::.:..:
CCDS30 VQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVTWGIGFLHSVS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVVSY
::::.:.: :::::.::::.:::: : :::: ::: ......:.:: :.. ::.::..::
CCDS30 QLAFAVHLLFCGPNEVDSFYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVILVTVRNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYTIF
:.::.:...: .. .:: :::::::::: ::::::.:::.::: :.:: :::::...
CCDS30 TIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 TPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]