Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5493
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5493, 347 aa
1>>>pF1KE5493 347 - 347 aa - 347 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7381+/-0.00142; mu= 13.6047+/- 0.081
mean_var=196.2566+/-72.593, 0's: 0 Z-trim(101.2): 431 B-trim: 407 in 1/46
Lambda= 0.091551
statistics sampled from 5892 (6423) to 5892 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 2297 317.2 1.3e-86
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1905 265.4 4.6e-71
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1903 265.1 5.6e-71
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1894 263.9 1.3e-70
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1553 218.9 4.6e-57
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1261 180.3 1.9e-45
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1247 178.5 6.8e-45
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1214 174.1 1.4e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1196 171.7 7.2e-43
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1182 169.9 2.6e-42
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1171 168.4 7.1e-42
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1168 168.0 9.5e-42
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1163 167.5 1.6e-41
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1147 165.2 6.4e-41
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1147 165.3 6.7e-41
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1144 164.9 8.4e-41
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1138 164.1 1.5e-40
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1138 164.1 1.5e-40
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1099 158.9 5.2e-39
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1093 158.2 9.3e-39
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1087 157.3 1.6e-38
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1086 157.2 1.7e-38
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1077 156.0 3.8e-38
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1071 155.2 6.8e-38
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1065 154.4 1.2e-37
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1045 151.8 7.2e-37
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1044 151.6 8e-37
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1041 151.2 1e-36
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1031 149.9 2.6e-36
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1017 148.1 9.4e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 968 141.6 8.6e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 967 141.6 9.8e-34
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 954 139.8 3e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 951 139.4 3.9e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 951 139.4 3.9e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 951 139.4 3.9e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 945 138.6 6.9e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 939 137.8 1.2e-32
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 939 137.8 1.2e-32
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 937 137.5 1.4e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 935 137.3 1.7e-32
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 934 137.1 1.9e-32
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 932 136.8 2.2e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 928 136.3 3.2e-32
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 926 136.0 3.9e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 925 135.9 4.3e-32
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 923 135.7 5.1e-32
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 920 135.3 6.8e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 919 135.1 7.5e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 917 135.0 9.6e-32
>>CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 2297 init1: 2297 opt: 2297 Z-score: 1668.6 bits: 317.2 E(32554): 1.3e-86
Smith-Waterman score: 2297; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
310 320 330 340
>>CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1905 init1: 1905 opt: 1905 Z-score: 1389.2 bits: 265.4 E(32554): 4.6e-71
Smith-Waterman score: 1905; 92.3% identity (96.8% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::.::::::::: :::::::::.:: :::::::.::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
::: :::::::::::: :::::::..:::::::::::::::::::::.::::::::: :.
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: :::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::.::: :.::: ::: :::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
.:::::::::
CCDS31 LMKILGKGKSGD
310
>>CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1903 init1: 1903 opt: 1903 Z-score: 1387.8 bits: 265.1 E(32554): 5.6e-71
Smith-Waterman score: 1903; 92.3% identity (97.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ::.:::::::::::::::: :::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: :: ::::::::::::
CCDS31 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
::: ::::::::::::.:::::::..:::::::::::::.:::::::.:::::::::::.
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
:::::::::.::::::...:::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
::::::::::
CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1894 init1: 1894 opt: 1894 Z-score: 1381.4 bits: 263.9 E(32554): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 1894; 91.3% identity (97.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:::::::::::::::::::::: :::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
:::::: ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::.:: ::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
:::::::::::::::: :::::::..::::::: :.:::::::::::.:::::::::::.
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
::::::::::::::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::.::::::::::.:: :::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
. :.:::::
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
>>CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1569 init1: 1546 opt: 1553 Z-score: 1138.0 bits: 218.9 E(32554): 4.6e-57
Smith-Waterman score: 1553; 74.1% identity (89.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:.:::::::: ::::::::::: ::::: :::::: .:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
:::::::::::::::::.::: :.::::.::::.::: ::::::.:: :.::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
:::.::::::.:: :::::.: .:.. :: ::: :::: .:..:::.:.: :: ::::.
CCDS31 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
.:: :::..:: ::... :::.:::.:::..:: ::..:. :::::::::.: :::::
CCDS31 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::: :::.:::::.:::.::.: :.: ::::::.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
..:.: : :
CCDS31 LQKVLKKRKLI
310
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1288 init1: 1261 opt: 1261 Z-score: 929.5 bits: 180.3 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 1261; 58.2% identity (84.9% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ...: :::::.:::. : ::..::.: :....:::.:.:::. : .::::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHRPMY
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CCDS31 FLLSQLSLMDMMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
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CCDS31 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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CCDS31 LKRWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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