FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5491, 344 aa
1>>>pF1KE5491 344 - 344 aa - 344 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8205+/-0.000527; mu= 18.7823+/- 0.032
mean_var=87.1056+/-21.008, 0's: 0 Z-trim(107.2): 425 B-trim: 1788 in 2/48
Lambda= 0.137420
statistics sampled from 14711 (15292) to 14711 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.514), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 5.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1286 265.8 9e-71
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 874 184.1 3.5e-46
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 872 183.7 4.6e-46
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 858 180.9 3.2e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 856 180.5 4.3e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 853 179.9 6.3e-45
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 853 179.9 6.3e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 834 176.2 8.7e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 176.2 8.7e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 176.2 8.7e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 832 175.8 1.1e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 827 174.8 2.2e-43
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 825 174.4 3e-43
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 802 169.8 7e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 792 167.8 2.7e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 790 167.4 3.6e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 785 166.5 7.4e-41
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 781 165.6 1.2e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 777 164.9 2.2e-40
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 160.9 3.3e-39
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 569 123.6 5.7e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 515 112.9 9.5e-25
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 240 58.5 2.7e-08
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 233 57.0 6.4e-08
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 233 57.2 8.4e-08
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 233 57.3 9e-08
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 221 54.7 3.8e-07
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 217 53.9 6.3e-07
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 217 53.9 6.5e-07
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 217 53.9 6.6e-07
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 217 53.9 6.6e-07
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 217 54.0 6.8e-07
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 217 54.0 7e-07
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 216 53.8 7.7e-07
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
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XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1277 init1: 1277 opt: 1286 Z-score: 1391.6 bits: 265.8 E(85289): 9e-71
Smith-Waterman score: 1286; 61.4% identity (87.5% similar) in 303 aa overlap (31-333:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
:.:.::.:::.:::::.::. ::..::.:.
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
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NP_001 VIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAI
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pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
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NP_001 LFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGG
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pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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NP_001 FLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFA
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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NP_001 LLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
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NP_001 IFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
280 290 300
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 876 init1: 615 opt: 874 Z-score: 950.2 bits: 184.1 E(85289): 3.5e-46
Smith-Waterman score: 874; 42.1% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (33-331:2-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLI
:.. :::::.::::..:: : ..:. ::..
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTISF
:.:...::.:::.. . ...: .::: :: .:. .: . .:.. :::. .:. ..:::.
NP_001 YLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISY
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pF1KE5 QGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGFL
:::.:::. :::..:...::::::.::: ::: ::...:: .: . .
NP_001 AGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVT
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pF1KE5 HSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFFTI
.: :. .:..: :::::.::.:.:.. ::: :.:. . .. . . . .. :.
NP_001 NSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE5 LLSYG-VILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNS--TFPIDKSM
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NP_001 CISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 TVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
... :..:: :::..:...: ::....::...
NP_001 AALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
280 290 300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 872; 46.1% identity (75.5% similar) in 306 aa overlap (32-333:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 ELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLL
:: ...:::.::::... : : .::. ::.
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLV
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pF1KE5 IYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTIS
:: .:..::: .:. : ...: .:::::::.:::.:. ::...:::..::::::::::
NP_003 IYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTIS
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pF1KE5 FQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGF
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pF1KE5 LHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVT-GLSMIANGGAICAVTFF
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NP_003 LNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVG-TLL
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pF1KE5 TILLSYGVILHSL-KTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPI--DK
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NP_003 VILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDK
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pF1KE5 SMTVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
.: : . ::::::::.:.. :.:.:. .. :.:
NP_003 VASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 858; 42.8% identity (73.2% similar) in 306 aa overlap (32-334:6-311)
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pF1KE5 ELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLL
.: . ::::::::. :: : :::. ::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLT
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pF1KE5 IYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTIS
.: . ..::. ... : . : .::::::..:::.: : . ..:::.:..:::.:.::
NP_006 LYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSIS
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pF1KE5 FQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGF
. :: :... :: .: ..:..::::::.:::.:: ..:.: .:. ... ...::
NP_006 YYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGN
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. :::. : . : .: :::..:.::: :::::.::.: .. . . :... . :.
NP_006 MSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFII
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NP_006 IIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKI
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pF1KE5 MTVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
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NP_006 ISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 856; 40.3% identity (74.8% similar) in 318 aa overlap (20-334:4-319)
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pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
:. .: : :...:.::.::::...:. :..::: ::
XP_011 MGDRRADPRPMS--GTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFL
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pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
.:..:..::::::... .. : .::::::..:::.: .: . .:::... . : .::
XP_011 SMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTI
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pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
:: ::..:... .:. . .::.:::::...:.:.::: :....:.:.. . :. .
XP_011 SFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVA
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:. :.. :.. : ::. :.: .:.::. :::::.:..:... . ....:. . . :.
XP_011 NLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFL
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 TILLSYGVILHS-LKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSM
:: :: : . ::. : .:. ::: ::.::..::.::. : .: : :. .:.
XP_011 CILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDT
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 --TVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
::. : .::::::.::.:.: .:.:..:. .. :
XP_011 MATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310 320
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 853; 41.3% identity (77.0% similar) in 305 aa overlap (33-334:5-309)
10 20 30 40 50 60
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:..:..::::::... .. : .::::::..:::.: .: . .:::... . : .::::
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 853; 41.3% identity (77.0% similar) in 305 aa overlap (33-334:5-309)
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XP_011 TVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 LLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLI
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 830 init1: 591 opt: 834 Z-score: 907.1 bits: 176.2 E(85289): 8.7e-44
Smith-Waterman score: 834; 41.6% identity (75.2% similar) in 310 aa overlap (33-339:5-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLI
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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XP_011 YVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPF
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XP_011 LLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLF
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 LLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLI
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVM
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XP_011 QSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFI
100 110 120 130 140 150
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XP_011 SSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLV
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pF1KE5 LLSYGVILHS-LKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPI--DKSM
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XP_011 LLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 TVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]