FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5491, 344 aa
1>>>pF1KE5491 344 - 344 aa - 344 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4492+/-0.00134; mu= 15.3997+/- 0.078
mean_var=176.4709+/-58.858, 0's: 0 Z-trim(101.4): 448 B-trim: 368 in 1/47
Lambda= 0.096547
statistics sampled from 5937 (6485) to 5937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1277 191.4 1e-48
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CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1223 183.7 1.7e-46
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1179 177.6 1.2e-44
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1155 174.2 1.2e-43
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1130 170.8 1.4e-42
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CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1087 164.8 8.8e-41
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1078 163.5 2.1e-40
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CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1027 156.4 2.9e-38
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1005 153.3 2.4e-37
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CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1002 152.9 3.2e-37
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1002 152.9 3.2e-37
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 999 152.5 4.2e-37
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 998 152.4 4.7e-37
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 995 152.0 6.4e-37
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 989 151.1 1.1e-36
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 988 151.0 1.2e-36
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 982 150.1 2.2e-36
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 974 149.0 4.8e-36
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 945 145.0 7.9e-35
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 945 145.0 7.9e-35
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 945 145.0 7.9e-35
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 942 144.6 1.1e-34
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 941 144.4 1.2e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 928 142.6 4.1e-34
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 919 141.4 9.6e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 900 138.7 6e-33
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 2255 init1: 2255 opt: 2255 Z-score: 1724.5 bits: 327.5 E(32554): 9.8e-90
Smith-Waterman score: 2255; 100.0% identity (100.0% similar) in 344 aa overlap (1-344:1-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1380; 62.9% identity (89.4% similar) in 302 aa overlap (31-332:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
:. ..:::.:.:::.::::. :::::: ::
CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
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CCDS31 LFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSI
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
:::.::::::..:.:.:.::.::.::::: :.::::::: :. : . :::..:...:.::
CCDS31 SFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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CCDS31 FLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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CCDS31 LLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
: : ::::::::::::.:.:: :::.::: .
CCDS31 VFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLWRRDLISSST
280 290 300
>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1330 init1: 727 opt: 1331 Z-score: 1029.3 bits: 198.8 E(32554): 5.2e-51
Smith-Waterman score: 1331; 64.4% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (31-336:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
:...::.:::.:::..:.: ::.::: ::
CCDS73 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
: :.::..:::::.: :.:: ::::::::::: :::::..:::...::.:: :. .::::
CCDS73 LTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTI
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pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
::::::.:::.::.:.::::.:::::: :::.::::::: : :::.:: :.:..: :::
CCDS73 SFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGG
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pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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CCDS73 FVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFN
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pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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CCDS73 LLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMT
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pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
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CCDS73 VFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
270 280 290 300 310
>>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1314 init1: 1314 opt: 1314 Z-score: 1016.6 bits: 196.4 E(32554): 2.6e-50
Smith-Waterman score: 1314; 60.5% identity (86.7% similar) in 309 aa overlap (31-339:1-309)
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:.:.::::::::::::.: : :.. ..::
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..:..:.. ::::.:::..:::: :::::::. ::..:...:.. :::.::: ::.. ::
CCDS31 VMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
:..::..:::..:.:.:. .:::.:::::::.::::::: : :. ::: ::. .::.::
CCDS31 SLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
:.:...:.::.::.::::::.::.:.:::. :: ::::.:.. :: . :.: .:.. :.
CCDS31 FMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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CCDS31 ILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
: ..::::::::::::.:::.::::.::: : .::::
CCDS31 VSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLWMKWEALAGK
280 290 300
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1277 init1: 1277 opt: 1286 Z-score: 995.5 bits: 192.5 E(32554): 3.9e-49
Smith-Waterman score: 1286; 61.4% identity (87.5% similar) in 303 aa overlap (31-333:1-303)
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pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
:.:.::.:::.:::::.::. ::..::.:.
CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
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CCDS73 VIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAI
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pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
:.:::.:.: .:.:.::: :::.:::::.:.::::::: . ::. ::.:.. ..:.::
CCDS73 LFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGG
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pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
:::. .:.:::.:::::::::::.:.::: :::.::::.:.. : . ::.: :: ..:
CCDS73 FLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
.:.:: ::: ::.:.:::...::. ::.::.::::::::::::.: :: .:.::::...
CCDS73 LLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
. :.:::::::::::::::.::.:.::: :.:
CCDS73 IFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
280 290 300
>>CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 (328 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 LIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFFLAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
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CCDS31 SLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDRYVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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CCDS31 FVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMYPLLELLCLDTYFIGLTVVANGGIICMVIFT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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CCDS31 FLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCISHIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
: ..:: :::::::.:...:::.::..:: .:.:.. :
CCDS31 VFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLWCEKLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
280 290 300 310 320
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1281; 59.7% identity (86.2% similar) in 305 aa overlap (31-335:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
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CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
..::.:. :::::.::: .::.:.:::::::. ::.::::::.. :::.::: ..::: :
CCDS31 VLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFFLTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKII
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
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CCDS31 SFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDCYVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGG
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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CCDS31 FLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLYPLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFL
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
...:: .::.:::..::::. ::. :: ::. ::.::::::::.: : .:.::::...
CCDS31 ILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCISHIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
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CCDS31 VFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLWRKKVTSDND
280 290 300
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
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10 20 30 40
pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTP----SEEHMKNKNNVTEFIL
::: .. :. : .:.:.. ::::.:
CCDS31 ALNNFALGCTNLLMTMIPQIDLKQIFLCPNCRL-YMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 LGLTQNPEGQKVLFVTFLLIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLG-SPMYFFLASLSFIDTVY
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CCDS31 LGLSQNPNVQEIVFVVFLFVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 STAFAPKMIVDLLSEKKTISFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHEL
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CCDS31 SSVITPKMIVDSLYVTKTISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ITMNRRVCVLMLLAAWIGGFLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTY
::::.: ... .:: ::.:::..:.:: .::::::::::..:.:::::::.::::.:.
CCDS31 SIMNRRLCGILMGVAWTGGLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VTGLSMIANGGAICAVTFFTILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVP
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CCDS31 IFGLMVVINSGFICIINFSLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 CIFLYARPNSTFPIDKSMTVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWL
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CCDS31 CIFVYTRPPSAFSLDKMAAIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKE
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 YHS
CCDS31 NIKL
370
>>CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 (329 aa)
initn: 1310 init1: 1253 opt: 1271 Z-score: 984.0 bits: 190.4 E(32554): 1.7e-48
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pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
: : .:.:::..:::.:: : :.::::.::
CCDS31 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
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CCDS31 LIYVVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTI
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
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CCDS31 SYECCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGG
120 130 140 150 160 170
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CCDS31 FLHSLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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CCDS31 MLAASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
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CCDS31 LFYGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
300 310 320
>>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1261 init1: 1261 opt: 1270 Z-score: 983.5 bits: 190.3 E(32554): 1.8e-48
Smith-Waterman score: 1270; 61.7% identity (86.8% similar) in 303 aa overlap (31-333:1-303)
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pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
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CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
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CCDS31 VIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
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CCDS31 LFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDHYVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGG
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pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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CCDS31 FLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCL
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
.:.: :::.::::.:::....:. ::.::.::::: :.::::.: :: .:.::::...
CCDS31 LLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVA
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344 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]