FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5490, 343 aa
1>>>pF1KE5490 343 - 343 aa - 343 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7220+/-0.00124; mu= 14.2663+/- 0.073
mean_var=149.1886+/-50.287, 0's: 0 Z-trim(101.8): 373 B-trim: 782 in 2/48
Lambda= 0.105004
statistics sampled from 6223 (6680) to 6223 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 1067 174.3 1.2e-43
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CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 815 136.2 3.6e-32
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CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 799 133.7 1.9e-31
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 799 133.7 1.9e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 799 133.8 2e-31
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CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 783 131.3 1e-30
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CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 783 131.3 1e-30
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 781 131.0 1.3e-30
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 781 131.0 1.3e-30
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 781 131.0 1.3e-30
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 781 131.0 1.3e-30
>>CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 (343 aa)
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Smith-Waterman score: 2278; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKQYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFLFSMFPHAHRGGLLFFIPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FLLVLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVVIVDAIHAAEIVASFLV
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 IAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
310 320 330 340
>>CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 (315 aa)
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Smith-Waterman score: 1355; 65.0% identity (86.3% similar) in 306 aa overlap (31-336:3-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKQYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFLFSMFPHAHRGGLLFFIPLL
::::. ::::.:. ::. . :.::.:.:::
CCDS30 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
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CCDS30 FIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMYNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
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CCDS30 SMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAIDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFG
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pF1KE5 FLLVLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVVIVDAIHAAEIVASFLV
::..::::. :::::::: :::::::::..:::::::::: ...: :.:::. :. .::.
CCDS30 FLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFCDLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTIIITFLI
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDTA
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CCDS30 IALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFSTCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTA
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310 320 330 340
pF1KE5 IAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
::. :..::::::::::::.::::..:: .:: ::
CCDS30 IALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNNAIKKLFCLQKVLNKPGG
280 290 300 310
>>CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 (324 aa)
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Smith-Waterman score: 1300; 62.7% identity (85.1% similar) in 303 aa overlap (31-330:3-304)
10 20 30 40 50 60
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: :.: . ::.:: ::.. ... :.:::
CCDS30 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLL
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pF1KE5 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
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CCDS30 FIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMYTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSI
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pF1KE5 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
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CCDS30 SFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAFDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCG
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pF1KE5 FLLVLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVV---IVDAIHAAEIVAS
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CCDS30 FITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCDFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITA
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pF1KE5 FLVIALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFW
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CCDS30 VMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAFSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFW
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pF1KE5 DTAIAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
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CCDS30 DIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
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.:: ..:.::.. ::: . . .:. ::
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::: . . :::..:.:. . ::::.: :.:.::: :. ::..::::::. :.::.:.:
CCDS30 LIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTI
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pF1KE5 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
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CCDS30 SFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIG-CWLG
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pF1KE5 FLL-VLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVVIVD-AIHAAEIVASF
: . ::. :: ::::: :.:...:::: :::::::::: . :.:: .:.. .:.:.:
CCDS30 GLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCDFPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATF
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pF1KE5 LVIALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWD
:.: ::..:: ..: . :: :..::.::::.:..: :.:.::. ::.... .::. .:
CCDS30 LLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAISTCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYD
220 230 240 250 260 270
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pF1KE5 TAIAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
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CCDS30 QALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEAVRRQL---KRIGILA
280 290 300 310
>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1032; 51.8% identity (75.7% similar) in 313 aa overlap (33-341:5-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 QYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFLFSMFPHAH--RGGLLFFIPLL
:.. ..::.: : . :: : :. ::
CCDS30 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWL--FVLLL
10 20 30
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pF1KE5 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
: : : . ::...: ::.. :::::.: :.:::::::. ::.:::::::: ..::.:.:
CCDS30 LAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMYHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTI
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: :::::: ::::::: .: .::::: :::.::: ::.:: :: :: ..... ::
CCDS30 SFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCG
100 110 120 130 140 150
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:: . :. : ::::. :.:..::::: :.::::: :: ..:: ::.: :. .:.
CCDS30 FLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCDFPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFF
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 VIALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDT
: .:: ::: ..: ...: :..:::::::.:::: :.::::. ::.:.. .::. :
CCDS30 FIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFSTCASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDR
220 230 240 250 260 270
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..:... .:.:. :::::::.::.. .:: : .:. .:. :
CCDS30 TLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKAIKRTIFQKGDKASLAHL
280 290 300 310
>>CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 870 init1: 627 opt: 871 Z-score: 736.9 bits: 144.6 E(32554): 1e-34
Smith-Waterman score: 871; 44.6% identity (73.6% similar) in 314 aa overlap (28-337:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKQYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFL---FSMFPHAHRGGLLFFI
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CCDS31 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIK--VLFTI
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PLLLIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQ
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CCDS31 -FLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQ
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KSISVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSC
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CCDS31 QTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAY
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
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CCDS31 MTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIA
160 170 180 190 200 210
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CCDS31 SALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSS
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300 310 320 330 340
pF1KE5 WDTAIAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
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CCDS31 FDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKDALKRL---QKRKCC
280 290 300 310
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10 20 30 40 50 60
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: : .:::.. . . . ...:. .:.:
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVI
10 20 30
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CCDS31 YTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISF
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130 140 150 160 170 180
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CCDS31 AGCFLQMYFFISLATTE-CILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGL
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190 200 210 220 230 240
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CCDS31 LNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLV
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pF1KE5 IALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDTA
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CCDS31 ILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKV
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310 320 330 340
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CCDS31 ASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
280 290 300 310
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30 40 50 60 70 80
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CCDS35 TPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKIISYVGCLIQMYFFMAFGNTDSYLLA
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CCDS35 SMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPWHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKH
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CCDS35 FFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETL--AVIVTPFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAAGK
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CCDS35 WKAFSTCGSHLTVVVLFYGSVIYVYFRPLSMYSVMKGRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRN
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330 340
pF1KE5 KDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
::::... .: :
CCDS35 KDMKRGLKKLRHRIYS
300 310
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CCDS35 MEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPQLQKPLFAIFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLH
10 20 30 40 50
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CCDS35 TPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLA
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CCDS35 SMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKH
120 130 140 150 160 170
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CCDS35 FFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETL--AVIVTPFLCIIFSYLRIMVTVLRIPSAAGK
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CCDS35 WKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRN
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CCDS35 KDMKRGLKKLQDRIYR
300 310
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CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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CCDS30 LGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGYDRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]