Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5489
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5489, 343 aa
1>>>pF1KE5489 343 - 343 aa - 343 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4973+/-0.000556; mu= 15.2212+/- 0.034
mean_var=99.5364+/-26.062, 0's: 0 Z-trim(107.0): 402 B-trim: 1884 in 2/47
Lambda= 0.128553
statistics sampled from 14529 (15123) to 14529 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 4.660
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1038 203.9 3.9e-52
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 857 170.3 5e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 857 170.3 5e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 857 170.3 5e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 833 165.8 1.1e-40
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 812 162.0 1.6e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 808 161.2 2.7e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 803 160.3 5.1e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 796 159.0 1.3e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 794 158.6 1.6e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 794 158.6 1.6e-38
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 792 158.2 2.1e-38
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 792 158.2 2.1e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 789 157.7 3.1e-38
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 781 156.2 8.8e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 777 155.5 1.5e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 770 154.2 3.6e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 768 153.8 4.5e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 741 148.8 1.5e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 702 141.6 2.3e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 554 114.1 4.1e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 506 105.2 2e-22
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 234 54.8 3.2e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 230 54.0 5.3e-07
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 228 53.7 7e-07
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 223 52.8 1.4e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 223 52.8 1.4e-06
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 223 52.9 1.6e-06
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 223 52.9 1.8e-06
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 222 52.7 1.9e-06
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 222 52.8 2e-06
NP_001304021 (OMIM: 602001) neuropeptide Y recepto ( 445) 220 52.3 2.3e-06
NP_001304020 (OMIM: 602001) neuropeptide Y recepto ( 445) 220 52.3 2.3e-06
XP_011530319 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 445) 220 52.3 2.3e-06
NP_006165 (OMIM: 602001) neuropeptide Y receptor t ( 445) 220 52.3 2.3e-06
XP_005263095 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 445) 220 52.3 2.3e-06
XP_011530317 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 220 52.3 2.4e-06
XP_016863745 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 220 52.3 2.4e-06
XP_016863744 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 220 52.3 2.4e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 218 51.8 2.5e-06
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 211 50.6 7.2e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 208 50.0 9.5e-06
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 207 49.8 1.1e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 206 49.6 1.2e-05
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 204 49.2 1.4e-05
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 204 49.2 1.4e-05
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 204 49.2 1.4e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 200 48.5 2.7e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 200 48.6 2.9e-05
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 199 48.3 2.9e-05
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1038 init1: 1038 opt: 1038 Z-score: 1057.1 bits: 203.9 E(85289): 3.9e-52
Smith-Waterman score: 1038; 50.5% identity (80.1% similar) in 297 aa overlap (36-332:3-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVISF
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NP_001 YIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGLL
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NP_001 NGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFL
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NP_001 HATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALL
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pF1KE5 LISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKFLAVF
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NP_001 LVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIF
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310 320 330 340
pF1KE5 YTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
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NP_001 YTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
280 290 300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 857; 45.5% identity (75.2% similar) in 303 aa overlap (36-334:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVISF
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XP_011 YVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPF
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pF1KE5 AGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGLL
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XP_011 QSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFI
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFIIL
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XP_011 SSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLV
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pF1KE5 LISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSV--DKFL
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XP_011 LLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLF
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310 320 330 340
pF1KE5 AVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKL-WRAFVNSREDT
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XP_011 SVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 759 init1: 631 opt: 857 Z-score: 875.5 bits: 170.3 E(85289): 5e-42
Smith-Waterman score: 857; 45.5% identity (75.2% similar) in 303 aa overlap (36-334:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVM
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70 80 90 100 110 120
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XP_011 YVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPF
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pF1KE5 AGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGLL
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XP_011 QSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFI
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pF1KE5 HSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFIIL
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XP_011 SSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLV
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pF1KE5 LISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSV--DKFL
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XP_011 LLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLF
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pF1KE5 AVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKL-WRAFVNSREDT
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XP_011 SVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 759 init1: 631 opt: 857 Z-score: 875.5 bits: 170.3 E(85289): 5e-42
Smith-Waterman score: 857; 45.5% identity (75.2% similar) in 303 aa overlap (36-334:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVM
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pF1KE5 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVISF
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NP_036 YVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPF
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pF1KE5 AGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGLL
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NP_036 QSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFI
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pF1KE5 HSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFIIL
: : .. .::.: . .: : :.: :..:::.: .:.:...: .. .. : ..
NP_036 SSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLV
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pF1KE5 LISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSV--DKFL
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NP_036 LLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLF
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310 320 330 340
pF1KE5 AVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKL-WRAFVNSREDT
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NP_036 SVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
280 290 300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 807 init1: 598 opt: 833 Z-score: 851.5 bits: 165.8 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 833; 41.7% identity (73.2% similar) in 302 aa overlap (36-334:6-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVI
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pF1KE5 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVISF
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NP_001 YITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITF
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NP_001 VGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLT
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NP_001 ASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVI
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pF1KE5 LISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPF--GNHSVDKFL
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NP_001 MISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFA
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pF1KE5 AVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
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NP_001 SVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 860 init1: 594 opt: 812 Z-score: 830.5 bits: 162.0 E(85289): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 812; 39.8% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (35-333:7-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSV
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVIS
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NP_001 FYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTIS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGL
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NP_001 YAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFII
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NP_001 TNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLIL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVD--KF
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NP_001 ILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKL--WRAFVNSREDT
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NP_001 IALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
280 290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 729 init1: 591 opt: 808 Z-score: 826.4 bits: 161.2 E(85289): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 808; 39.4% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (36-339:7-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVISF
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NP_006 YAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGLL
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NP_006 YGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNM
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFIIL
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NP_006 SSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIII
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWP--FGNHSVDKFL
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NP_006 IISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKII
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 AVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
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NP_006 SVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
280 290 300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 792 init1: 574 opt: 803 Z-score: 821.5 bits: 160.3 E(85289): 5.1e-39
Smith-Waterman score: 803; 38.6% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (35-337:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSV
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVIS
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NP_001 VYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTIS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGL
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NP_001 YAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFII
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NP_001 TNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFIL
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 LLISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSV--DKF
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NP_001 TCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
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NP_001 VAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVF-AFLKH
280 290 300
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 781 init1: 581 opt: 796 Z-score: 814.3 bits: 159.0 E(85289): 1.3e-38
Smith-Waterman score: 796; 40.4% identity (74.0% similar) in 319 aa overlap (21-332:2-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFA
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XP_011 MGDRRADPR--PMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQ
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XP_011 FFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILET
40 50 60 70 80 90
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pF1KE5 KVISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSW
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XP_011 QTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLW
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 LLG----LLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGI
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XP_011 VVANLNVLLHTLLMAP----LSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGAL
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 ISLSCFIILLISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGN
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XP_011 VMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 HSVDK--FLAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
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XP_011 HSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 817 init1: 564 opt: 794 Z-score: 812.5 bits: 158.6 E(85289): 1.6e-38
Smith-Waterman score: 794; 41.4% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (32-332:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 ALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFAL
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQK
. .:.::::::::.: : .:.:::::.: :::..:. ... .:.....::...:
NP_003 LLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWL
::.:. : ...... ..: .. .::. :..:::::::.::.: .::. :::: :.. ::
NP_003 VIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LGLLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSC
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NP_003 SGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FIILLISYSLILITI-KNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDK
...:.::. :..:. : .: .:. :: :: .:. :::::.: :. :. : .... .:
NP_003 VFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 FLAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]