Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5487
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5487, 340 aa
1>>>pF1KE5487 340 - 340 aa - 340 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9554+/-0.000615; mu= 18.4093+/- 0.038
mean_var=91.2960+/-22.023, 0's: 0 Z-trim(106.0): 220 B-trim: 975 in 1/49
Lambda= 0.134230
statistics sampled from 13860 (14101) to 13860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.488), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16
Scan time: 5.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1088 221.7 1.6e-57
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1052 214.8 2e-55
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 974 199.7 7.1e-51
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 900 185.3 1.5e-46
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 883 182.0 1.4e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 881 181.7 1.9e-45
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 881 181.7 1.9e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 881 181.7 1.9e-45
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 879 181.3 2.4e-45
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 839 173.5 5.3e-43
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 828 171.4 2.3e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 822 170.2 5.2e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 820 169.8 6.6e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 813 168.5 1.7e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 796 165.2 1.7e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 795 165.0 1.9e-40
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 782 162.5 1.1e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 782 162.5 1.1e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 782 162.5 1.1e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 766 159.4 9.8e-39
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 514 110.6 4.7e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 446 97.4 4.3e-20
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 184 46.7 8.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 168 43.6 0.0007
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 166 43.3 0.001
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 166 43.3 0.001
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 162 42.4 0.0015
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 162 42.5 0.0016
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 162 42.5 0.0017
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 162 42.5 0.0017
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 162 42.5 0.0018
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 162 42.6 0.0019
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 158 41.8 0.0035
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 150 40.1 0.0078
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 149 39.9 0.009
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1134 init1: 1078 opt: 1088 Z-score: 1153.6 bits: 221.7 E(85289): 1.6e-57
Smith-Waterman score: 1088; 55.1% identity (78.5% similar) in 303 aa overlap (34-336:6-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TFTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFA
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLT
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSIS
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NP_006 LYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSIS
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGI
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NP_006 YYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGN
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pF1KE5 LHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILI
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NP_006 MSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFII
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pF1KE5 VLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDII
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NP_006 IIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKI
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310 320 330 340
pF1KE5 VSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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NP_006 ISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
280 290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1076 init1: 1052 opt: 1052 Z-score: 1116.0 bits: 214.8 E(85289): 2e-55
Smith-Waterman score: 1052; 49.7% identity (82.5% similar) in 302 aa overlap (34-335:4-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TFTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFA
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSIS
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NP_003 IYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTIS
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pF1KE5 FIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGI
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NP_003 FAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILI
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NP_003 LNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLV
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pF1KE5 VLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDII
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NP_003 ILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 VSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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NP_003 ASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
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>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 1033 init1: 970 opt: 974 Z-score: 1034.4 bits: 199.7 E(85289): 7.1e-51
Smith-Waterman score: 974; 48.3% identity (77.5% similar) in 302 aa overlap (35-336:6-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVI
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pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
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NP_001 YITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
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NP_001 VGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLT
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
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NP_001 ASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVI
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pF1KE5 LISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDIIV
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NP_001 MISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 SIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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NP_001 SVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 900; 46.3% identity (74.6% similar) in 307 aa overlap (35-338:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTD-DFELQVFLFLLFFA
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLT
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pF1KE5 IYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSIS
::: :: :: ...... : ::.:::.:: ::::. .. :..:::: ..::.. .::
NP_835 IYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTIS
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pF1KE5 FIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGI
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NP_835 FLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGF
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pF1KE5 LHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILI
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NP_835 PVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFE--IYAIVGTILVVMIPC
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pF1KE5 VLISCDF--ILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHD
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NP_835 LLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESK
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pF1KE5 IIVSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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NP_835 KLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 930 init1: 745 opt: 883 Z-score: 939.2 bits: 182.0 E(85289): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 883; 44.3% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (35-334:5-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
:.:.:: :.: :..: . . .::......
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGV
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pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
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NP_003 YLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAF
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pF1KE5 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
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NP_003 TLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGIL
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NP_003 VSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLI
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pF1KE5 LISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDIIV
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NP_003 LVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--V
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 SIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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NP_003 SVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
280 290 300
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 882 init1: 842 opt: 881 Z-score: 937.0 bits: 181.7 E(85289): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 881; 43.1% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (35-339:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSM
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pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
:: :..::: ... : :: ::.:::.::: :::.: :.: ...::::.: . ....:::
NP_036 YLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISF
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pF1KE5 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
:: ::: . : . ::::.:::::.::. .:: :...:. .. . :... .:.. :
NP_036 CGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANL
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pF1KE5 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
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NP_036 NVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCI
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pF1KE5 LISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDIIV
: : : ..::. :.::: ::::::::::. : ....::.. :. : ::.....: ..
NP_036 LASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMA
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pF1KE5 SIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKML-KLVYK
...::.: : :::.::::::. .: :.::.. ..:.
NP_036 TVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 882 init1: 842 opt: 881 Z-score: 937.0 bits: 181.7 E(85289): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 881; 43.1% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (35-339:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
:.. :. :.: :.. . . : .::..:...
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
:: :..::: ... : :: ::.:::.::: :::.: :.: ...::::.: . ....:::
XP_011 YLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
:: ::: . : . ::::.:::::.::. .:: :...:. .. . :... .:.. :
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.. .: . ::::..: : : :::. ::: .:::::: :..... . . :. .: .
XP_011 NVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCI
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pF1KE5 LISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDIIV
: : : ..::. :.::: ::::::::::. : ....::.. :. : ::.....: ..
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220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 SIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKML-KLVYK
...::.: : :::.::::::. .: :.::.. ..:.
XP_011 TVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 882 init1: 842 opt: 881 Z-score: 936.9 bits: 181.7 E(85289): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 881; 43.1% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (35-339:15-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
:.. :. :.: :.. . . : .::..:...
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSM
10 20 30 40
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pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
:: :..::: ... : :: ::.:::.::: :::.: :.: ...::::.: . ....:::
XP_011 YLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
:: ::: . : . ::::.:::::.::. .:: :...:. .. . :... .:.. :
XP_011 CGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
.. .: . ::::..: : : :::. ::: .:::::: :..... . . :. .: .
XP_011 NVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDIIV
: : : ..::. :.::: ::::::::::. : ....::.. :. : ::.....: ..
XP_011 LASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMA
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310 320 330 340
pF1KE5 SIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKML-KLVYK
...::.: : :::.::::::. .: :.::.. ..:.
XP_011 TVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310 320
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 897 init1: 877 opt: 879 Z-score: 934.9 bits: 181.3 E(85289): 2.4e-45
Smith-Waterman score: 879; 42.5% identity (74.1% similar) in 301 aa overlap (35-335:8-308)
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pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
: . .:::.::.. .:.: .:.. . .
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
::.:::::: ...: :: ::.:::.::: ::::: ::.: :..:::. . .:.::.
NP_001 YLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISY
40 50 60 70 80 90
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pF1KE5 IGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGIL
:: :. . ...::::: ::..:.::.:.:. :: :.: : :: : .::.:.:.
NP_001 AGCMIQLYFVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFT
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
....: :: . .:: .. : ::..: :: .:: :::.:.: :. . . .. ....
NP_001 NSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILI
160 170 180 190 200 210
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: : :. .::.:.:. : ::.:.:::.:: .:... . :..: :. ..:. ..
NP_001 LTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFI
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NP_001 ALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
280 290 300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 838 init1: 819 opt: 839 Z-score: 893.1 bits: 173.5 E(85289): 5.3e-43
Smith-Waterman score: 839; 39.2% identity (75.4% similar) in 301 aa overlap (35-335:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 FTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFAI
:.. . :.: ::.. :. ::.. ..
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISF
::.::.:: ...: : ::.:::.::: ::::: :..: .:.::::. . .:.:::
NP_009 YLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISF
40 50 60 70 80 90
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. :..:...:...:::::.::..::.:.:::. .:: :.. . ::. : ....: :..
NP_009 LDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLV
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 HATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILIV
..... .:. : :: . .. :..: :. .:: :: :.. . : .: . ..
NP_009 ESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLI
160 170 180 190 200 210
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:.: : ..:...:::::.:::.::.:::: ::........ :..:.. ::... .
NP_009 LVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFF
220 230 240 250 260 270
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]