FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5481, 331 aa
1>>>pF1KE5481 331 - 331 aa - 331 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5846+/-0.000412; mu= 20.3732+/- 0.026
mean_var=88.3379+/-20.643, 0's: 0 Z-trim(111.6): 242 B-trim: 1271 in 1/51
Lambda= 0.136459
statistics sampled from 19921 (20238) to 19921 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 7.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 871 181.8 1.6e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 863 180.3 4.8e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 854 178.5 1.6e-44
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NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 854 178.5 1.6e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 854 178.5 1.7e-44
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NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 839 175.5 1.3e-43
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 824 172.6 9.8e-43
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 816 171.0 2.9e-42
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NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 809 169.7 7.8e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 797 167.3 3.9e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 787 165.3 1.5e-40
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 786 165.1 1.7e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 777 163.3 6e-40
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 757 159.4 9.2e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 757 159.4 9.2e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 757 159.4 9.2e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 753 158.6 1.6e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 508 110.4 5.3e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 480 104.9 2.4e-22
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 202 50.2 7.4e-06
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 192 47.6 1.5e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 182 46.2 0.00011
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 182 46.3 0.00012
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 178 45.5 0.00022
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 178 45.6 0.00022
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 169 44.0 0.00094
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 165 43.0 0.0014
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NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 165 43.1 0.0014
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 162 42.3 0.0018
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 162 42.3 0.0018
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 162 42.4 0.0018
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 162 42.4 0.0018
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 162 42.4 0.0018
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 160 42.0 0.0025
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 160 42.0 0.0027
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 160 42.0 0.0027
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 160 42.0 0.0027
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 159 41.8 0.0028
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 159 41.8 0.0028
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 158 41.5 0.003
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 158 41.5 0.003
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 159 41.9 0.0031
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 158 41.6 0.0032
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 158 41.6 0.0033
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 157 41.3 0.0033
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 158 41.6 0.0034
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 871; 43.4% identity (72.8% similar) in 302 aa overlap (18-317:8-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIII
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pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCAVQLYCFHF
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NP_001 LGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWV
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NP_001 RMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLN
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NP_001 PLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 863; 45.7% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (18-315:5-304)
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pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKH-SSLFFLLFLLIYSITVAGNLLIL
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pF1KE5 FLASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFR
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NP_835 FPFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCL-LILCSYTRIAAA
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pF1KE5 VLRIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAGAP--AVFYTIVTPM
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pF1KE5 LNPFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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NP_835 LNPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
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>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
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... . :: .:::::...:.:.:::: . :....:: ... :... .. .:: : :
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pF1KE5 RIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAG--APAVFYTIVTPMLN
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pF1KE5 PFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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NP_036 PFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 854; 42.1% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (18-317:5-305)
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pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCAVQLYCFHF
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XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHI-LETQTISFCGCLTQMYFVFM
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pF1KE5 LASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFRL
... . :: .:::::...:.:.:::: . :....:: ... :... .. .:: : :
XP_011 FVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPL
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pF1KE5 LYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAVL
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XP_011 SFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVL
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pF1KE5 RIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAG--APAVFYTIVTPMLN
.. ...:: .::: : ..:. :::.: . .:..: ::... .:.::.::::::
XP_011 KVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLN
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pF1KE5 PFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
::::.:::. .: ::....
XP_011 PFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 849 init1: 536 opt: 854 Z-score: 920.1 bits: 178.5 E(85289): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 854; 42.9% identity (71.1% similar) in 315 aa overlap (12-324:1-314)
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pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
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NP_006 KYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVL
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NP_006 PLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 854; 42.1% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (18-317:15-315)
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pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCAVQLYCFHF
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XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHI-LETQTISFCGCLTQMYFVFM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFRL
... . :: .:::::...:.:.:::: . :....:: ... :... .. .:: : :
XP_011 FVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAVL
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XP_011 SFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 RIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAG--APAVFYTIVTPMLN
.. ...:: .::: : ..:. :::.: . .:..: ::... .:.::.::::::
XP_011 KVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE5 PFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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XP_011 PFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 624 init1: 501 opt: 845 Z-score: 910.5 bits: 176.7 E(85289): 5.6e-44
Smith-Waterman score: 845; 43.2% identity (72.6% similar) in 310 aa overlap (18-325:5-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
: : ...: : :: : . . ..::.::.::..:: ::: ..:
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCAVQLYCFHF
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NP_003 LIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLS-EKKTISFAGCFLQMYFFIS
50 60 70 80 90 100
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pF1KE5 LASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFRL
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NP_003 LATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAVL
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NP_003 SFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIF
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250 260 270 280 290
pF1KE5 RIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEA--GAGAPAVFYTIVTPMLN
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NP_003 SMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLN
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300 310 320 330
pF1KE5 PFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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NP_003 PLIYSLRSKEVKKALANVI-SRKRTSSFL
290 300 310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 727 init1: 402 opt: 839 Z-score: 904.2 bits: 175.5 E(85289): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 839; 41.5% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (18-327:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVV
10 20 30 40
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pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGK-VISFEGCAVQLYCFH
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NP_001 TITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITH--SLYGKKAILFNGCMTQVFGEH
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pF1KE5 FLASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFR
:....: .: ::::::.:.:::.:::: . ::. .:: . :..: : ::.:. . :.
NP_001 FFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQ
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pF1KE5 LLYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAV
: .::: : .:.::. :.:.:::::: . :: . :. :.. . :...::. :. .
NP_001 LPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 LRIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAGAPAVFYTIVTPMLNP
:: .. ..:..:.: :....: :.:..:: . .:..: .. : :.:::..::::::
NP_001 LRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNP
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 FIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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NP_001 LIYTLKNAQMKNAI-RKLCS--RKDISGDK
290 300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 827 init1: 490 opt: 824 Z-score: 888.2 bits: 172.6 E(85289): 9.8e-43
Smith-Waterman score: 824; 42.8% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (15-317:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
.. : .. .::.: :. . ..:...:. : .:..:: :.:
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCAVQLYCFHF
. : :: ::: ::.:::::: ..: ..:... .: : :.::. :::.::. :
NP_001 VSRLDPHLHTPMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCD-KTISYMGCAIQLFLFLG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFRL
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NP_001 LGGVECLLLAVMAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRL
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 LYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINE-LVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAV
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NP_001 PRCGHHEVDHFLREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSP-LVFILLSYSYIVRAV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 LRIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQP-RSSEAGAGAP-AVFYTIVTPML
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NP_001 LQIRSASGRQKAFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLL
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pF1KE5 NPFIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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NP_001 NPLIYTLRNREVKGALGRLLLGKRELGKE
290 300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 656 init1: 573 opt: 816 Z-score: 879.8 bits: 171.0 E(85289): 2.9e-42
Smith-Waterman score: 816; 40.4% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (18-317:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
:..::..:.. :: . ....::.::..: .. ::.::..
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIII
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TVGSDSHLSLPMYHFLGHLSFLDACLSTVTVPKVMAGLLTLDGKVISFEGCAVQLYCFHF
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NP_001 AKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSEN-TISYAGCMSQLFLFTW
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFRL
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NP_001 SLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAVL
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NP_001 TFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAIL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE5 RIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGA--GAPAVFYTIVTPMLN
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NP_001 RIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLN
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