FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5480, 331 aa
1>>>pF1KE5480 331 - 331 aa - 331 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5610+/-0.000471; mu= 20.3467+/- 0.030
mean_var=103.4751+/-27.951, 0's: 0 Z-trim(108.8): 420 B-trim: 1092 in 1/52
Lambda= 0.126083
statistics sampled from 16336 (16881) to 16336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 6.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 936 181.6 1.9e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 848 165.6 1.2e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 847 165.4 1.4e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 822 160.9 3.3e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 807 158.2 2.2e-38
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 805 157.8 2.8e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 802 157.3 4.1e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 802 157.3 4.1e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 802 157.3 4.1e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 792 155.4 1.4e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 784 154.0 4e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 776 152.5 1.1e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 759 149.4 9.2e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 728 143.8 4.6e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 719 142.1 1.4e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 717 141.8 1.8e-33
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 713 141.0 3e-33
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 691 137.0 4.8e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 562 113.6 5.7e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 540 109.6 9.2e-24
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 219 51.2 3.5e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 211 49.8 9.5e-06
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 208 49.3 1.5e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 208 49.4 1.6e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 206 49.0 2.1e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 204 48.5 2.4e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 202 48.2 3.2e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 202 48.2 3.2e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 202 48.2 3.2e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 202 48.2 3.2e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 202 48.2 3.3e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 202 48.2 3.3e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 202 48.2 3.3e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 202 48.3 3.4e-05
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 199 47.7 4.8e-05
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 199 47.7 4.8e-05
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 199 47.8 5.2e-05
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 199 47.9 5.7e-05
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 197 47.3 6.2e-05
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 197 47.3 6.2e-05
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NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 197 47.3 6.3e-05
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NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 197 47.4 6.4e-05
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 197 47.4 6.4e-05
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 197 47.4 6.5e-05
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 197 47.4 6.5e-05
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 197 47.4 6.7e-05
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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Smith-Waterman score: 936; 47.5% identity (76.9% similar) in 303 aa overlap (6-304:5-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
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70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFL-SRQ---HTISFAACITQFYFYFFLGASEFLL
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NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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pF1KE5 LAVMSADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAV
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NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPN-I
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NP_003 INHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
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pF1KE5 HQKAFSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALR
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NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
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300 310 320 330
pF1KE5 NEQVKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 848; 45.4% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (9-313:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSA-RVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQT
.. .::.: .. .: . . :: .:: .::..: :: ::. :. :: :..
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS
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pF1KE5 PMYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAV
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NP_835 PMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLAT
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pF1KE5 MSADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQH
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NP_835 MAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKV-NH
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pF1KE5 FFCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQK
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NP_835 FFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQ
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NP_835 AFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSE
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300 310 320 330
pF1KE5 VKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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NP_835 VKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 847; 42.2% identity (78.1% similar) in 306 aa overlap (12-316:10-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTP
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pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
:::::.::: ... ...: ::::...::...:::::.:. :.::.. :...: .:...:
NP_003 MYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLM
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pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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NP_003 AYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFC-DSNVIHHF
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pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
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NP_003 FCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRA
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pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
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NP_003 KKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 822; 42.9% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (12-312:12-311)
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pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
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pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKN-VINHF
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
::::.::: ::.. :. .:.: ::: : .:. ..:. :. :.:::.::.:::..:
NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 807; 40.2% identity (73.5% similar) in 306 aa overlap (5-310:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
:.. .. : :.: :. .. ::..::..:. .:. :. .. ..: :..:.::
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pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
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NP_001 MYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAM
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pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSN-VIRHF
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NP_001 FCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKA
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:.::.::: .:.::: :.::.:. :..:: . . ..:. : : :.:::.::.:::...
NP_001 FNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEI
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pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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NP_001 KDALKRLQKRKCC
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 805; 43.1% identity (71.4% similar) in 311 aa overlap (5-315:3-312)
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pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
:...:. .::.: :: . . :: :: .:: .. ::.::. : :. :.::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP
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pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
:::::.::: ..: .. . .::::.: . . .:::: .:.::.:: :.. . .:::::
XP_011 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
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pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
. :...:.::::.: :. .: .. . :: . . :: :. .: : :: ..:.. ::
XP_011 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAIT-HF
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190 200 210 220 230 240
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::: :::.:.:..:. : . ..::... .: .:: :. .::..::..:. ::
XP_011 FCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKA
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pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
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310 320 330
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: ::: . .:: .:
XP_011 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
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:...:. .::.: :: . . :: :: .:: .. ::.::. : :. :.::
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:::::.::: ..: .. . .::::.: . . .:::: .:.::.:: :.. . .:::::
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NP_036 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAIT-HF
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pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
::: :::.:.:..:. : . ..::... .: .:: :. .::..::..:. ::
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NP_036 FSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYL
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: ::: . .:: .:
NP_036 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 805; 43.1% identity (71.4% similar) in 311 aa overlap (5-315:13-322)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVR
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 QGAVVQHFFCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIP
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XP_011 DNAIT-HFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
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pF1KE5 YALRNEQVKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
.::.: :: . ..:: :: .::..:.... :: ::: ..: :.::.::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTP
10 20 30 40 50
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XP_011 MYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVM
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pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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XP_011 AYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRN-KFIDHI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
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XP_011 SCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKA
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pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
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XP_011 FHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEV
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pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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XP_011 KGAWQKLLWKF-SGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 802; 40.3% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (12-319:10-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
.::.: :: . ..:: :: .::..:.... :: ::: ..: :.::.::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
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XP_011 MYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVM
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pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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XP_011 AYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRN-KFIDHI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
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XP_011 SCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKA
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pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
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XP_011 FHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEV
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