Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5480, 331 aa
1>>>pF1KE5480 331 - 331 aa - 331 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5567+/-0.00125; mu= 14.7803+/- 0.074
mean_var=189.0853+/-65.791, 0's: 0 Z-trim(102.8): 423 B-trim: 456 in 1/48
Lambda= 0.093271
statistics sampled from 6562 (7095) to 6562 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 2124 299.3 2.9e-81
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 1072 157.7 1.2e-38
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 972 144.2 1.3e-34
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 965 143.3 2.5e-34
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 965 143.3 2.6e-34
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 956 142.0 5.8e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 954 141.8 7e-34
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 949 141.1 1.1e-33
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 936 139.4 3.9e-33
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 933 138.9 5e-33
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 931 138.7 6e-33
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 929 138.4 7.3e-33
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 928 138.3 8e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 920 137.2 1.7e-32
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 919 137.1 1.9e-32
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 918 136.9 2e-32
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 907 135.5 5.6e-32
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 907 135.5 5.7e-32
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 900 134.5 1.1e-31
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 900 134.5 1.1e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 897 134.1 1.4e-31
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 895 133.9 1.8e-31
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 890 133.2 2.8e-31
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 888 133.0 3.5e-31
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 887 132.8 3.6e-31
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 887 132.8 3.6e-31
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 886 132.7 4.1e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 886 132.7 4.2e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 884 132.3 4.8e-31
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 884 132.4 4.9e-31
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 883 132.2 5.4e-31
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 877 131.4 9.3e-31
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 872 130.8 1.5e-30
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 869 130.3 2e-30
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 869 130.3 2e-30
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 868 130.2 2.2e-30
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 866 130.0 2.6e-30
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 866 130.0 2.6e-30
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 865 129.8 2.9e-30
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 864 129.7 3.2e-30
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 864 129.7 3.2e-30
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 861 129.3 4.1e-30
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 860 129.1 4.5e-30
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 854 128.3 8e-30
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 852 128.0 9.5e-30
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 849 127.7 1.3e-29
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 849 127.7 1.3e-29
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 848 127.5 1.4e-29
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 848 127.5 1.4e-29
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 848 127.5 1.4e-29
>>CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 (331 aa)
initn: 2124 init1: 2124 opt: 2124 Z-score: 1572.3 bits: 299.3 E(32554): 2.9e-81
Smith-Waterman score: 2124; 99.7% identity (100.0% similar) in 331 aa overlap (1-331:1-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGRQKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
310 320 330
>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1068 init1: 596 opt: 1072 Z-score: 807.5 bits: 157.7 E(32554): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 1072; 51.6% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (5-312:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
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CCDS31 MGNWST-VTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
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CCDS31 MYFFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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CCDS31 SFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE--INHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
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CCDS31 FCDIAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
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CCDS31 FSTCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
.:.:.. ...
CCDS31 QEVLRETVNRIMTLIQRKT
300 310
>>CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 (313 aa)
initn: 1012 init1: 512 opt: 972 Z-score: 734.8 bits: 144.2 E(32554): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 972; 47.9% identity (80.5% similar) in 303 aa overlap (9-311:5-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
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CCDS47 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTP
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
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CCDS47 MYFFLGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDM
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
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CCDS47 ALDRFVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYC-HGDVINHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
:::. :::.:.:..:. :: ::..: ..::.:.: .::: :: .:: :::::. :::
CCDS47 FCDNEPLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
:::: ::: .: . :.:.:::::::... ::.. .:...:. .::.::::: .. :. :
CCDS47 FSTCGSHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
: .:. .....
CCDS47 KTVLQGQMQRLKGLCKAQ
300 310
>>CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1023 init1: 522 opt: 965 Z-score: 729.7 bits: 143.3 E(32554): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 965; 48.3% identity (80.3% similar) in 294 aa overlap (12-305:8-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
:::.: :.: ... .. :: ...:.:.:.:.:: ::...: :. ::: :
CCDS31 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
::::: ::: ::: :...:::.:..:. . .: .. :. : .:.::.:..:::.:..:
CCDS31 MYFFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
: ::::.::.::..: .:.. .:...::. :: :.. :. :. . :::: .. :..::
CCDS31 SFDRYLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNN-VISHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
.:: :: :. :: .:. :: . . ::: .:::.. .:: :. :.: ::::.::::.
CCDS31 YCDVGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
::::.::: ::.:.::...:.:.::. .: : .:.:..:..:::::::::..::..:
CCDS31 FSTCASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
: ::.
CCDS31 KGALRKAMTCPKTGHAK
300 310
>>CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 965 init1: 552 opt: 965 Z-score: 729.6 bits: 143.3 E(32554): 2.6e-34
Smith-Waterman score: 965; 49.0% identity (80.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
:.:. . .. : ::: :.:. . . .: ....:... ::..::. . : ::.
CCDS31 MNPE--NWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
::::: :.: ::.::..:..:::: .:. .:::::..:: : :.:::::...:.:::::
CCDS31 MYFFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
: :::::::.:::: ::.: :: ...:: :..:.. :: ::: .: :::: ... .::
CCDS31 SLDRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGI-DHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA
: :: :::::.: .:. :. . :.:..::...:: .:.:::. :. .:: :.:. ..::
CCDS31 FRDSWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
::::.::: ::...:::.::::.: :.. : : ...:.. ..::::::::..:::..:
CCDS31 FSTCASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
..::..
CCDS31 QQALREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
300 310 320
>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 959 init1: 509 opt: 956 Z-score: 723.2 bits: 142.0 E(32554): 5.8e-34
Smith-Waterman score: 956; 49.5% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
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CCDS31 MYFFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAM
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CCDS31 FCDIAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKA
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CCDS31 FSTCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEV
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CCDS31 RETLLKKWKGK
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CCDS30 MYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAM
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CCDS30 AYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLA---GPVVEISLISRLPFCGPNRI-
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CCDS30 RKAISTCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRN
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CCDS30 KEIKEAVRRQLKRI--GILA
300 310
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CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTP
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CCDS31 MYFFLRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASM
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CCDS31 SYDRYVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSN-ILNHY
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CCDS31 YCDYGPLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKA
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CCDS31 FSTCSSHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQV
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CCDS31 KQAFKDSVKKIVKL
300
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CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
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CCDS77 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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CCDS77 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPN-I
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CCDS77 INHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
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CCDS77 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
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CCDS77 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
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CCDS58 MKNKTVLTEFILLGLTDVPELQVAVFTFLFLAYLLSILGNLTILILTLLDSHLQTP
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CCDS58 MYFFLRNFSFLEISFTNIFIPRVLISITTGNKSISFAGCFTQYFFAMFLGATEFYLLAAM
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CCDS58 SYDRYVAICKPLHYTTIMSSRICIQLIFCSWLGGLMAII-PTITLMSQQDFCASNRL-NH
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CCDS58 YFCDYEPLLELSCSDTSLIEKVVFLVASVTLVVTLVLVILSYAFIIKTILKLPSAQQRTK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]