FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5479, 331 aa
1>>>pF1KE5479 331 - 331 aa - 331 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9696+/-0.000507; mu= 18.3119+/- 0.031
mean_var=103.4616+/-26.744, 0's: 0 Z-trim(108.4): 228 B-trim: 1141 in 1/52
Lambda= 0.126091
statistics sampled from 16222 (16504) to 16222 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 6.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 1195 228.7 1.3e-59
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 937 181.8 1.7e-45
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 908 176.5 6.5e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 908 176.5 6.6e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 906 176.1 8.3e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 901 175.2 1.6e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 890 173.2 6.3e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 868 169.2 1e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 821 160.7 3.8e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 813 159.2 1e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 811 158.9 1.3e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 811 158.9 1.3e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 803 157.4 3.6e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 797 156.3 7.5e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 795 156.0 1e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 795 156.0 1e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 795 156.0 1e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 791 155.2 1.7e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 737 145.4 1.5e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 540 109.6 9.3e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 536 108.9 1.5e-23
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 230 53.2 8.9e-07
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 227 52.6 1.3e-06
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 214 50.3 6.8e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 207 49.1 1.8e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 207 49.1 1.8e-05
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 195 46.9 8.1e-05
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 177 43.5 0.0007
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 166 41.7 0.0034
NP_064707 (OMIM: 610376) atypical chemokine recept ( 362) 165 41.4 0.0034
XP_016860005 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 165 41.4 0.0034
XP_005246155 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 165 41.4 0.0034
XP_005246154 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 165 41.4 0.0034
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 161 40.6 0.005
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 161 40.6 0.005
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 161 40.6 0.005
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 162 40.9 0.0053
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 162 40.9 0.0053
NP_005297 (OMIM: 603823) free fatty acid receptor ( 330) 161 40.7 0.0054
XP_016882198 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty ( 330) 161 40.7 0.0054
XP_016882199 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty ( 330) 161 40.7 0.0054
XP_016882200 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty ( 330) 161 40.7 0.0054
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 160 40.6 0.007
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 159 40.3 0.0072
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 159 40.3 0.0072
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 159 40.4 0.0076
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 159 40.4 0.0079
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 1201 init1: 907 opt: 1195 Z-score: 1191.4 bits: 228.7 E(85289): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 1195; 59.1% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (8-301:9-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKR----ISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ASMAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLN
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310 320 330
pF1KE5 EFKNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
: : ::
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 937; 45.4% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRP
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pF1KE5 CDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 FTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310 320 330
pF1KE5 NALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
.: .:..
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
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pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
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::::. :
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 908; 43.3% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLV-GFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
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NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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::::. :
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 964 init1: 904 opt: 908 Z-score: 909.3 bits: 176.5 E(85289): 6.6e-44
Smith-Waterman score: 908; 43.3% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-306:11-316)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVW
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 SSTSLHRPMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCT
.. :: :::.:::..::..: . .:::: . .:. . ::: ::.::.:: .:
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV-LLHTLLMAPLSFC
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..:...:::::..:.:::.:.: :.. . . .... :.: . :: ::: .::..:
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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pF1KE5 SATGCWRAFFTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLI
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
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: :::. .:.::::. :
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 943 init1: 885 opt: 906 Z-score: 907.5 bits: 176.1 E(85289): 8.3e-44
Smith-Waterman score: 906; 43.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:4-304)
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pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
: :.:.. :::.:: : . .:: .::. :. :. ::..:. . .. :: ::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFF
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KE5 ALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
:::.
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 893 init1: 859 opt: 901 Z-score: 902.5 bits: 175.2 E(85289): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 901; 46.1% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPG-LQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFF
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310 320 330
pF1KE5 ALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
::...:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 857 init1: 857 opt: 890 Z-score: 891.7 bits: 173.2 E(85289): 6.3e-43
Smith-Waterman score: 890; 43.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFFT
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKNA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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pF1KE5 LKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 883 init1: 857 opt: 868 Z-score: 870.1 bits: 169.2 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 868; 43.0% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (5-306:8-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHR
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLAS
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 FCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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pF1KE5 KNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
..:.:. .:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 866 init1: 813 opt: 821 Z-score: 823.9 bits: 160.7 E(85289): 3.8e-39
Smith-Waterman score: 821; 40.8% identity (74.0% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFFT
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKNA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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NP_001 LERLLSRADSCP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]