Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5478
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5478, 330 aa
1>>>pF1KE5478 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1479+/-0.00141; mu= 11.3952+/- 0.082
mean_var=185.4577+/-62.131, 0's: 0 Z-trim(101.3): 438 B-trim: 366 in 1/46
Lambda= 0.094179
statistics sampled from 5931 (6468) to 5931 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 2147 305.2 4.7e-83
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 1250 183.3 2.2e-46
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1024 152.6 3.9e-37
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 1024 152.6 3.9e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1024 152.6 3.9e-37
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1020 152.1 6.1e-37
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1017 151.7 7.5e-37
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1011 150.8 1.3e-36
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 999 149.2 4.1e-36
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 999 149.2 4.1e-36
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 993 148.4 7.2e-36
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 991 148.1 8.8e-36
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 990 148.0 9.5e-36
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 990 148.0 9.5e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 983 147.1 1.9e-35
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 982 146.9 2e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 982 146.9 2e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 979 146.5 2.7e-35
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 975 145.9 3.9e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 974 145.9 4.6e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 971 145.4 5.7e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 969 145.2 7.5e-35
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 968 145.0 7.7e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 967 144.9 8.4e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 960 143.9 1.6e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 960 143.9 1.6e-34
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 959 143.8 1.8e-34
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 959 143.8 1.8e-34
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 958 143.6 2e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 957 143.5 2.1e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 956 143.4 2.3e-34
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 954 143.1 2.8e-34
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 946 142.1 6.4e-34
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 944 141.8 7.5e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 943 141.6 8.2e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 941 141.3 9.6e-34
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 941 141.3 9.6e-34
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 940 141.3 1.1e-33
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 939 141.1 1.2e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 935 140.5 1.7e-33
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 934 140.4 1.9e-33
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 932 140.1 2.2e-33
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 932 140.1 2.2e-33
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 931 140.0 2.5e-33
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 931 140.0 2.5e-33
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 931 140.0 2.5e-33
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 930 139.8 2.7e-33
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 929 139.7 3e-33
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 929 139.7 3e-33
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 929 139.7 3e-33
>>CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 2147 init1: 2147 opt: 2147 Z-score: 1604.6 bits: 305.2 E(32554): 4.7e-83
Smith-Waterman score: 2147; 99.4% identity (99.7% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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CCDS31 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNLSFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS31 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSWASGALVSLVDTSFTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
310 320 330
>>CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1260 init1: 1080 opt: 1250 Z-score: 946.2 bits: 183.3 E(32554): 2.2e-46
Smith-Waterman score: 1250; 63.2% identity (84.0% similar) in 307 aa overlap (17-323:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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CCDS31 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
.: :. .::.::::::::: :.:.:::::::.::::.:::.: ..:.:.: : .... :
CCDS31 LISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
:. :::.::::::::::::::.:.:: : .::: .::. :. : .:: :::.:::.: .
CCDS31 LIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFIL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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CCDS31 RLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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CCDS31 VVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPM
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
:::.::::::::::.::::.. :
CCDS31 LNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1051 init1: 1024 opt: 1024 Z-score: 780.2 bits: 152.6 E(32554): 3.9e-37
Smith-Waterman score: 1024; 48.2% identity (79.3% similar) in 305 aa overlap (20-324:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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CCDS31 IVTVTSVDLALQTPMYFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
.. : .:: ::..:.:::.::.:.::.::.::.. .:::... : ::. ::...:.. .
CCDS31 FFFGSSECFLLSMMAYDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
::. : : ..:.::. : .:::...:: :: .. ..... : ::: :: :: :
CCDS31 ALPFCGPNAVDHFFCDGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIIT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
...:.:. :: ::::::.:::::: ::::.. .::.::.:. . : :..:. ::..:::
CCDS31 ILRMSSATGRQKAFSTCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPM
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
::::::.:::..::::... . .:
CCDS31 LNPIIYGLRNNEVKGAVKRTITQKVLQKLDVF
290 300 310
>>CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 (317 aa)
initn: 1065 init1: 1022 opt: 1024 Z-score: 780.2 bits: 152.6 E(32554): 3.9e-37
Smith-Waterman score: 1024; 54.3% identity (79.8% similar) in 302 aa overlap (20-321:4-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
.:::.: .::.::::.: ::: :: :::. ::.::::: :
CCDS43 MEIDNQTWVREFILLGLSSDWCTQISLFSLFLVTYLMTVLGNCL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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CCDS43 IVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
: .: : .:::::.:::.::: : ::.:: .: :.. : .::.. :::.:..::
CCDS43 LALGGIEFVLLAVMAYDRHVAVSDRLRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGSINSLVQTAITF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
.::. ...:.: :: :...:: .:: :.: ::. ..:.:..: :.: :: ::::
CCDS43 QLPMCTNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEAAIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIRIIST
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
....:: ::: ::: ::.::: ::.: ::. ::::..:.: . .:.:::::. : :.
CCDS43 ILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGTTIFTYIQPHSGPSVLQEKLISVFYAIVMPL
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
:::.:::::::.:::: .::.
CCDS43 LNPVIYSLRNKEVKGAWHKLLEKFSGLTSKLGT
290 300 310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1037 init1: 1013 opt: 1024 Z-score: 780.1 bits: 152.6 E(32554): 3.9e-37
Smith-Waterman score: 1024; 50.3% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (17-324:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
: ..::: ...::.::.:. . :.::: .:.. :. :. :: :
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
::. : .::::::.:: :..: :.:..:: :::..::.: :.:.::. ::..:...:
CCDS46 IILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
.. .:: :::.:.::::.:.:.:: ::.:... .: :. :.: : :.: : .::
CCDS46 VFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
::. :.: ::..::. : :: :. .: .:.:..: :: : .: :. :: ::::
CCDS46 CLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIIST
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
....::.::: ::::::.::: .: :::::.::::.:: : . . :...::.:..::::
CCDS46 ILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPM
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
::::::.:::::.: :. : .: :
CCDS46 LNPIIYTLRNKDIKEAV-KTIGSKWQPPISSLDSKLTY
290 300 310 320
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1011 init1: 1011 opt: 1020 Z-score: 776.7 bits: 152.1 E(32554): 6.1e-37
Smith-Waterman score: 1020; 48.1% identity (79.8% similar) in 312 aa overlap (17-328:1-312)
10 20 30 40 50 60
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CCDS34 IMMVCILDPKLHTPMYFFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNIGCNKKTISYAGCVAHLIIF
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CCDS34 VLKIRSAEGRQKAFGTCGSHMIVVSLFYGTAIYMYLQPPSSTSKDWGKMVSLFYGIITSM
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CCDS34 LNSLIYSLRNKDMKEAFKRLMPRIFFCKK
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CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTA
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CCDS31 LILVCCLDSRLHTPMYFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVA
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CCDS31 MGLGSSECILLAVMAYDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTV
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CCDS31 QLPLCGHRTLDHIFCEVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQA
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CCDS31 VLRIKSAAGRQKAFGTCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPL
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CCDS31 LNPIIYTLRNKDVKGALRTLILGSAAGQSHKD
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CCDS43 MGE-NQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGA
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CCDS43 ILGLISLDSRLHTPMYFFLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLC
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CCDS43 LSFGHSECLLLVLMSYDRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLIL
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CCDS43 RLPFSGPHEINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAA
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CCDS43 ILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPT
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CCDS43 LNPLIYSLRNGEVKGALRRALGKESHS
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CCDS56 MGE-NQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGA
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70 80 90 100 110 120
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CCDS56 ILGLISLDSRLHTPMYFFLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLC
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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CCDS56 LSFGHSECLLLVLMSYDRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLIL
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CCDS56 RLPFSGPHEINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAA
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