FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5477, 329 aa
1>>>pF1KE5477 329 - 329 aa - 329 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6312+/-0.00106; mu= 13.9633+/- 0.062
mean_var=142.3713+/-49.261, 0's: 0 Z-trim(104.2): 393 B-trim: 864 in 2/48
Lambda= 0.107489
statistics sampled from 7260 (7764) to 7260 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.610
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1101 183.1 2.5e-46
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CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1062 177.1 1.7e-44
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CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1055 176.0 3.7e-44
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CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1045 174.4 1.1e-43
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CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1033 172.6 3.8e-43
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CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1008 168.7 5.7e-42
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1007 168.5 6.2e-42
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1005 168.2 7.9e-42
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CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 883 149.3 3.9e-36
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 878 148.5 6.5e-36
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CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 815 138.8 5.8e-33
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 784 134.0 1.6e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 773 132.3 5.3e-31
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 767 131.4 1.1e-30
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 763 130.7 1.5e-30
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 752 129.0 5e-30
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 742 127.4 1.4e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 741 127.3 1.6e-29
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 704 121.6 8.8e-28
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 660 114.7 9.8e-26
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 657 114.2 1.3e-25
>>CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 (329 aa)
initn: 2144 init1: 2144 opt: 2144 Z-score: 1819.0 bits: 344.9 E(32554): 5.4e-95
Smith-Waterman score: 2144; 99.7% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQPSFLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVGN
10 20 30 40 50 60
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:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAIDLVLASSTAPKALAVLLVHAHEIGYIVCLIQMF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYLL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 MPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
310 320
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1126 init1: 970 opt: 1128 Z-score: 967.6 bits: 187.3 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 1128; 53.7% identity (85.9% similar) in 298 aa overlap (29-325:14-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQPSFLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVGN
.:.:.:::::: .. :::.:. .::.:::::
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAINLVLASSTAPKALAVLLVHAHEIGYIVCLIQMF
......: :: .:: ::::: .:. .:.:.:.:.:: ::.: .:: ::.. :: :::
CCDS31 AALILVIAMDNALHAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPIL
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CCDS31 CVHSIYALESSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHIL
: : .: .. :.:::::....:::.. ::: .::::.:::..::: . :..::. ::
CCDS31 LRRLPYCGHRVMTHTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFIL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE5 QAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHH-VPHHVHVLLATRYL
.::...:. .:. ::.::::::: .:::::.:..::::::::::: ::.:::..::. :.
CCDS31 HAVFHLPSHDAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYV
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300 310 320
pF1KE5 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
:.::.:::..::..:..::.:.:...
CCDS31 LVPPVLNPILYGARTKEIRSRLLKLLHLGKTSI
290 300 310
>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1112; 52.4% identity (81.8% similar) in 313 aa overlap (18-329:1-313)
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pF1KE5 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQPS-FLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVG
.: :. :..:. ::::::::::. . ::..:. . : :::.:
CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLG
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: :.:.:: : .::. :::::.:::::.:::.::. :: ::.. . .::....:: ::
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pF1KE5 FFIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPI
::.:.:: :::.::.:::.:::::::.:::.. .: ..: .:::....:.. :. :.:.
CCDS31 FFLHSFSIMESAVLLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPF
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pF1KE5 LLGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHI
:: . .:.. .:.: ::::::::.:::..:. : ::...:.... ::.: . .:: :
CCDS31 LLRCFHYCRGPVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFI
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pF1KE5 LQAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYL
::::: . ..::: :::.:: ::: .::.::. ..: . :: ..:. :::.:::. ::
CCDS31 LQAVLLLASQEARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYL
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pF1KE5 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
:.:: .::..:::::.:::. .: :: .::
CCDS31 LFPPMVNPIIYGVKTKQIRESILGVFPRKDM
290 300 310
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1094 init1: 651 opt: 1105 Z-score: 948.5 bits: 183.7 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1105; 49.4% identity (83.4% similar) in 314 aa overlap (16-328:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQP-SFLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVG
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CCDS31 MFYHNKS--IFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLG
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:.:::..: .. .:.. :. ::..:..:.:.:.....:. :... ::::.: .:. ::
CCDS31 NATILLVIKVEQTLREPMFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQM
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CCDS31 FLIHAFTGMEAEVLLAMAFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVY
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 LLGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHI
:. : :::: ::.:.:::::...::.:.. .: ::: .. . . :... ::.::..:
CCDS31 LIYRLPFCQAHIIAHSYCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV-LNLVLIGISYVYI
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pF1KE5 LQAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYL
:.::...:. .:.:::.::::.:. :: :::.:..::::::::::..: ..:.:.:. ::
CCDS31 LRAVFRLPSHDAQLKALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYL
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
..::.:::..:::.:.:::.::: :::.:
CCDS31 IIPPSLNPIIYGVRTKQIRERVLYVFTKK
290 300 310
>>CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1122 init1: 1097 opt: 1101 Z-score: 945.1 bits: 183.1 E(32554): 2.5e-46
Smith-Waterman score: 1101; 52.1% identity (81.9% similar) in 315 aa overlap (16-329:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQPS-FLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVG
:: :: . ..:. ::::::::::. . ::..:. . : :::.:
CCDS31 MLPSNIT--STHPAVFLLVGIPGLEHLHAWISIPFCFAYTLALLG
10 20 30 40
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CCDS31 NCTLLFIIQADAALHEPMYLFLAMLATIDLVLSSTTLPKMLAIFWFRDQEINFFACLVQM
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pF1KE5 FFIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPI
::.:.:: :::.::.:::.:::::::.:::..:.: ..: .:::....:.. :. :.:.
CCDS31 FFLHSFSIMESAVLLAMAFDRYVAICKPLHYTTVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPF
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 LLGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHI
:: . .:.. .:.: ::::::::.:::..:. : ::...:.... ::.: . .::. :
CCDS31 LLRRFHYCRGPVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLFVILSYVFI
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 LQAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYL
:::::.. ..::: :::.:: ::: .:: :.: ..: . :: ..:. .::.::: ::
CCDS31 LQAVLQLASQEARYKAFGTCVSHIGAILSTYTPVVISSVMHRVARHAAPRVHILLAIFYL
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300 310 320
pF1KE5 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
:.:: .::..:::::.:::. :: .: .:.
CCDS31 LFPPMVNPIIYGVKTKQIREYVLSLFQRKNM
290 300 310
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS44 CGLLYLIHYEDALHKPMYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMF
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: :.:..::::::. ::::::::::.::..:::: ::...: ....::.::.::: .:
CCDS44 FTHTFTGMESGVLMLMALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFL
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CCDS44 TKLLPYCRGNILPHTYCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMIL
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CCDS44 RAVVSLSSADARQKAFNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYL
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CCDS44 LLPPTMNPIVYGVKTKQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
290 300 310 320
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: :::.:::::. . ::..:. :.::.:.:::
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGN
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CCDS31 MTILFVIKTEHSLHQPMFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMF
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CCDS31 FIHMFTGMETVLLVVMAYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFL
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CCDS31 ILRLPFCGHNIVPHTYCEHRGLAGLACAPIKINIIYGL-MVISYIIVDVILIASSYVLIL
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pF1KE5 QAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYLL
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CCDS31 RAVFRLPSQDVRLKAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVV
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CCDS31 VPPALNPVIYGVRTKQIREQIVKIFVQKE
290 300 310
>>CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1066; 52.9% identity (81.8% similar) in 297 aa overlap (29-324:13-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQPSFLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVGN
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CCDS31 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAINLVLASSTAPKALAVLLVHAHEIGYIVCLIQMF
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CCDS31 VTILAVVKIERSLHQPMYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMF
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pF1KE5 FIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPIL
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CCDS31 LIHCFATVESGIFLAMAFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLM
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 LGT-LIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHI
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CCDS31 IRLRLPLYKTHVISHSYCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMI
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pF1KE5 LQAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYL
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CCDS31 FRAVMGLATPEARLKTLGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYL
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pF1KE5 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
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CCDS31 LIPPILNPIVYAVRTKQIRESLLQIPRIEMKIR
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>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLG
10 20 30 40
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pF1KE5 NVTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAINLVLASSTAPKALAVLLVHAHEIGYIVCLIQM
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CCDS31 NTALLFVIQTEQSLHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHM
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pF1KE5 FFIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPI
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CCDS31 FFIHFFTAMESIVLVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVF
110 120 130 140 150 160
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CCDS31 LLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLL-LDVILIILSYVRI
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CCDS31 LYAVFCLPSWEARLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYV
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..::::::..:::.:.:::.::::.: . .
CCDS31 VVPPALNPVIYGVRTKQIRERVLRIFLKTNH
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>>CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 886 init1: 886 opt: 1062 Z-score: 912.3 bits: 177.1 E(32554): 1.7e-44
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CCDS31 MAETLQLNSTF-LHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGN
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CCDS31 GALPAVVWIDSTLHQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMF
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pF1KE5 FIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPIL
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CCDS31 FVHALTAMESGVLLAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVPFPLL
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pF1KE5 LGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHIL
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CCDS31 HAVLQLPTREAHAKAFGTCSSHICVILAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYL
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