Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5476, 329 aa
1>>>pF1KE5476 329 - 329 aa - 329 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0382+/-0.000524; mu= 17.0808+/- 0.032
mean_var=86.4284+/-22.283, 0's: 0 Z-trim(107.4): 362 B-trim: 1824 in 2/47
Lambda= 0.137958
statistics sampled from 14968 (15516) to 14968 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 5.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1282 265.9 7.7e-71
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 842 178.4 1.8e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 842 178.4 1.8e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 842 178.4 1.8e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 830 176.0 9.3e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 830 176.0 9.3e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 830 176.0 9.5e-44
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 813 172.6 9.6e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 805 171.0 2.9e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 794 168.8 1.3e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 789 167.8 2.7e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 788 167.6 3.1e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 785 167.0 4.7e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 781 166.2 8.3e-41
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 779 165.8 1.1e-40
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 769 163.8 4.2e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 755 161.0 2.9e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 753 160.6 3.8e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 742 158.5 1.7e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 734 156.9 5.1e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 559 122.0 1.6e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 513 112.9 9.3e-25
NP_004221 (OMIM: 605111,610419,610419) sphingosine ( 353) 233 57.2 5.9e-08
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 214 53.6 1e-06
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 214 53.6 1.1e-06
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 199 50.4 6.3e-06
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 199 50.5 7e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 198 50.3 7.9e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 198 50.3 7.9e-06
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 196 50.0 1.2e-05
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 196 50.0 1.3e-05
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 194 49.5 1.3e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 193 49.2 1.4e-05
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 193 49.3 1.6e-05
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 193 49.3 1.6e-05
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 193 49.3 1.6e-05
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 193 49.4 1.9e-05
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 193 49.4 1.9e-05
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 193 49.5 2.2e-05
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 191 48.9 2.2e-05
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 193 49.5 2.3e-05
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 193 49.5 2.4e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 189 48.4 2.4e-05
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 190 48.7 2.5e-05
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 188 48.3 3.1e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 186 47.8 3.7e-05
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 188 48.4 3.8e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 185 47.6 4.4e-05
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 184 47.5 5.2e-05
XP_011543933 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 182 47.1 6.8e-05
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1279 init1: 1279 opt: 1282 Z-score: 1392.8 bits: 265.9 E(85289): 7.7e-71
Smith-Waterman score: 1282; 61.2% identity (87.3% similar) in 299 aa overlap (28-326:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIY
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE
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NP_001 IITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFN
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pF1KE5 CCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLH
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NP_001 GCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLH
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pF1KE5 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA
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pF1KE5 ASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFY
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220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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NP_001 TMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
280 290 300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 842; 44.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (34-329:9-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 VLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVT
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVT
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCM
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pF1KE5 AQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLV
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XP_011 AQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPV
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pF1KE5 QLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASY
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XP_011 QTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSY
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pF1KE5 IVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPI--DKNMALFY
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XP_011 IQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFY
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310 320
pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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XP_011 AILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLL-WKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 842; 44.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (34-329:9-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 VLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVT
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVT
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pF1KE5 VCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCM
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pF1KE5 AQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLV
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XP_011 AQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPV
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pF1KE5 QLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASY
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XP_011 QTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSY
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pF1KE5 IVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPI--DKNMALFY
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XP_011 IQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFY
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310 320
pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
.::::::::.::.:::.:::.: .::. :
XP_011 AILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLL-WKFSGLTSKLAT
280 290 300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 823 init1: 596 opt: 842 Z-score: 919.4 bits: 178.4 E(85289): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 842; 44.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (34-329:9-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 VLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVT
..::..::::.. ... :::.::..::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVT
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pF1KE5 VCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCM
: :: :::. : . : .:.::::.:::..:. :..:..:.:.: : : ..: .. :
NP_036 VLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCA
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pF1KE5 AQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLV
:::: . :::.:..::.:::::::::.: :. ..:: ::: :. ..:..::. : :
NP_036 AQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPV
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pF1KE5 QLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASY
: ... ::.: . :.:..:.: ....::..: . ....: .. . : .. ::
NP_036 QTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSY
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pF1KE5 IVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPI--DKNMALFY
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NP_036 IQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFY
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pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
.::::::::.::.:::.:::.: .::. :
NP_036 AILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLL-WKFSGLTSKLAT
280 290 300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 805 init1: 609 opt: 830 Z-score: 906.6 bits: 176.0 E(85289): 9.3e-44
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVV
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pF1KE5 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC
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XP_011 TVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGC
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XP_011 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS
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XP_011 YMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVL
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XP_011 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 805 init1: 609 opt: 830 Z-score: 906.6 bits: 176.0 E(85289): 9.3e-44
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVV
...::..::::.. . :..::: :: .:..
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC
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NP_036 TVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGC
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSL
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NP_036 LTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAAS
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NP_036 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE5 YIVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN-MA-LF
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NP_036 YMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVL
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE5 YGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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NP_036 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 805 init1: 609 opt: 830 Z-score: 906.4 bits: 176.0 E(85289): 9.5e-44
Smith-Waterman score: 830; 41.8% identity (77.8% similar) in 297 aa overlap (33-326:18-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVV
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC
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XP_011 TVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSL
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XP_011 LTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAAS
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XP_011 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE5 YIVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN-MA-LF
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XP_011 YMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE5 YGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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XP_011 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 836 init1: 579 opt: 813 Z-score: 888.4 bits: 172.6 E(85289): 9.6e-43
Smith-Waterman score: 813; 39.5% identity (74.6% similar) in 299 aa overlap (34-329:6-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 VLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVT
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCM
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NP_001 FLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCM
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLV
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NP_001 SQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASY
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NP_001 HTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISY
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 -IVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFS--TLPIDKNMALFY
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NP_001 GFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALY
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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NP_001 TLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
280 290 300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 802 init1: 533 opt: 805 Z-score: 879.7 bits: 171.0 E(85289): 2.9e-42
Smith-Waterman score: 805; 39.5% identity (75.7% similar) in 296 aa overlap (37-329:15-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVTVCG
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 NMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCMAQL
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NP_001 NLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLVQLL
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NP_001 YFVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSS
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 LVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASYIVI
...:.:.:: ..:: :.. ::...:..:.: : .. .:... :. .... .:: .:
NP_001 FTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN--MALFYGIL
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NP_001 VRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVV
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 TPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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NP_001 TPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
290 300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 817 init1: 611 opt: 794 Z-score: 867.9 bits: 168.8 E(85289): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 794; 40.0% identity (76.3% similar) in 295 aa overlap (35-327:10-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVTV
.::..::.:.. : ::.:: .:: .:.:::
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCMA
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NP_002 VGNVLIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLT
40 50 60 70 80 90
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pF1KE5 QLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLVQ
::. : ... ..:.::::::::::: ::: :: :. .:: .:... :. . :..:..
NP_002 QLYFLVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIH
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 LLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASYI
::. . ::: :... :..: ::..::.: . ...:.. .: :. : .. ::.
NP_002 TLLMTRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYV
160 170 180 190 200 210
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NP_002 LIIRAILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAV
220 230 240 250 260 270
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]