Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5471
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5471, 323 aa
1>>>pF1KE5471 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4600+/-0.00115; mu= 14.8109+/- 0.069
mean_var=63.8458+/-13.388, 0's: 0 Z-trim(100.5): 43 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.160512
statistics sampled from 6099 (6132) to 6099 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 2102 495.9 1.7e-140
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 1168 279.7 2.3e-75
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 531 132.1 5.5e-31
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 512 127.7 1.2e-29
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 487 121.9 6.4e-28
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 485 121.5 8.5e-28
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 471 118.2 8.5e-27
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 465 116.8 2.1e-26
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 447 112.7 4e-25
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 446 112.4 4.6e-25
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 444 112.0 6.5e-25
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 443 111.8 7.4e-25
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 417 105.7 4.7e-23
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 412 104.6 1.1e-22
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 406 103.2 2.8e-22
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 399 101.6 8.7e-22
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 398 101.3 1e-21
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 392 99.9 2.5e-21
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 386 98.6 7.4e-21
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 375 96.0 4.1e-20
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 366 93.9 1.8e-19
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 353 90.9 1.4e-18
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 311 81.2 1.1e-15
>>CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 (323 aa)
initn: 2102 init1: 2102 opt: 2102 Z-score: 2635.7 bits: 495.9 E(32554): 1.7e-140
Smith-Waterman score: 2102; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
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CCDS43 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFYC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIPSSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIPSSNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRDPSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRDPSMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSVQLILGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSVQLILGN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 PGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
:::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
310 320
>>CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 (338 aa)
initn: 1137 init1: 742 opt: 1168 Z-score: 1466.5 bits: 279.7 E(32554): 2.3e-75
Smith-Waterman score: 1168; 57.4% identity (80.1% similar) in 317 aa overlap (7-323:23-338)
10 20 30 40
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYG
: .....: : .:. :.: : . ::...::: ::..
CCDS47 MLGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 AEWARGKTLPTGDRIMLMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFL
:::...:.. :. ::...:: ::. :: :::: .: :....:: ::. .::
CCDS47 AEWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYAFKISFIFL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 NHSNLWFAAWLKVFYCLRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDV
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CCDS47 NFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSM-FCINI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FNVYVNSSIPIPSSNSTEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHT
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CCDS47 CTVYCNNSFPIHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRHT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LHMGSNATGSRDPSMKAHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILCKII
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CCDS47 LHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFIYLSNMFDINSLWNNLCQII
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE5 MAAYPAGHSVQLILGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
::::::.::. :: ::::::::::.: .. :: : ::
CCDS47 MAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL
300 310 320 330
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 484 init1: 295 opt: 531 Z-score: 669.8 bits: 132.1 E(32554): 5.5e-31
Smith-Waterman score: 531; 33.8% identity (64.0% similar) in 308 aa overlap (14-319:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
: ... . ....: : :: :.:::. . .: . . . : :.
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAG-ELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE5 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYI-LFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFY
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CCDS86 ISLAISRICLLCVISLDGFFMLLFPGTYG-NSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CLRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIPSSN
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CCDS86 LLKIANISHPFFFWLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVS---HEEN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 STEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRDPSM
: : :. . . :.:..::.:. ... ::..:: ::: .. .::: ::::
CCDS86 ITWKFKVSKIPGTFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPST
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAHIGAIKATSYFLILYI-FNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSVQLIL
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CCDS86 EAHMRAIKAVIIFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIM
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE5 GNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
:: ::.:. .. . : .:.
CCDS86 GNSKLREAFLKMLRFVKCFLRRRKPFVP
290 300 310
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 552 init1: 439 opt: 512 Z-score: 645.9 bits: 127.7 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 512; 31.1% identity (64.7% similar) in 309 aa overlap (15-321:4-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
: ..:. ... : : .::::..:: . .:.. . . . : :.
CCDS86 MADKVQTTLLFLAVG-EFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFYC
:..::. : ..:. .. .:. :: .. . .. . .. :: ..:::. :...:
CCDS86 TSLAISRICLLCVILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE5 LRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIP-SSN
..:.:: ::::. :: .: .. :.: :..:. .:.: .... :. . ..:
CCDS86 FKIGNFFHPLFLWMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENL-NADFRFCVKAKRKTN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 STEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRDPSM
: . ..:. .. .: :.. ..:. . ... ::::::.:: .: .::: ::::
CCDS86 LTWSCRVNKTQHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPST
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILC-KIIMAAYPAGHSVQLIL
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CCDS86 EAHVRALKAVISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILIL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE5 GNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
:: ::.: . .: :::.
CCDS86 GNNKLRHASLKVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
290 300 310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 453 init1: 259 opt: 487 Z-score: 614.8 bits: 121.9 E(32554): 6.4e-28
Smith-Waterman score: 487; 33.2% identity (64.7% similar) in 295 aa overlap (20-309:9-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
: ....: : : ::::.:.:. . .: . : . : : :.
CCDS86 MFSPADNIFIILITG-EFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFYC
: ..:. : :....: .: ::..:. :.. .. .: :. :.:... :.:::
CCDS86 TNLVIARICLISVMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE5 LRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLL----RLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIP
:.::. .::::. .: :: ... :.: .:.:::: .. :: : : .:
CCDS86 LKIASSSHPLFLWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCD----YRFHAIAKH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SSNSTEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRD
. : :: . :. . . . ..:. .::.:. ... ::. :: ::: .. ::::::
CCDS86 KRNITEMFHVSKIPYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PSMKAHIGAIKA-TSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSVQ
:: ..:. :::. ::........ ..... : .. :. . .: :: :::.
CCDS86 PSTEVHVRAIKTMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE5 LILGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
::. : ::... :
CCDS86 LIVLNNKLRQTFVRMLTCRKIACMI
290 300
>>CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 (299 aa)
initn: 411 init1: 239 opt: 485 Z-score: 612.5 bits: 121.5 E(32554): 8.5e-28
Smith-Waterman score: 493; 33.7% identity (64.7% similar) in 300 aa overlap (14-310:4-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
:.. . : :.: :. . ::. .:.:... : . . . . : ..
CCDS38 MLESHLIIYFLLAV--IQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFYC
:. ::..::.... :.. ..: : . . :. .: .:.:. .::.:.:: ::::
CCDS38 SCLAVSRIFLQLFIFYVNVIVIFF-IEFIMCSANC---AILLFINELELWLATWLGVFYC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE5 LRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVL-VSLSFSFPLSRDVFNV-YVNSSIPIPSS
..:. ::::. .: .: :.::.. :.: ::. : . : : : .. :.
CCDS38 AKVASVRHPLFIWLKMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFF--SQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NSTEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRDPS
:.: .: : ... .: . . :::..:..:. :::.:: ::: .: ....::: :.
CCDS38 NATIQK---EDTLAIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTRQMRNTVAGSRVPG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MKAHIGAIKATSYFLILYIFNA-IALFLSTSNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSVQLI
: :.:. . :::::. . : .:::. . : .. .... ::.:::. ::
CCDS38 RGAPISALLSILSFLILYFSHCMIKVFLSSLK-FHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILI
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE5 LGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
:::: :.. :.:
CCDS38 LGNPKLKQNAKKFLLHSKCCQ
280 290
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 400 init1: 217 opt: 471 Z-score: 594.6 bits: 118.2 E(32554): 8.5e-27
Smith-Waterman score: 471; 31.2% identity (64.0% similar) in 292 aa overlap (22-307:10-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
:..:: . ::: . :: . :. : . : . .: :.
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFII
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE5 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITV---FLNHSNLWFAAWLKV
:.. :..: .. . :.:... : .. :....: : : :: ..:.:. : :
CCDS58 TTLALLRIILLCIILTD---SFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FYCLRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIPS
.:::.::.:.:: :. .: .. .: :.: ..:.: . . : . :..: .
CCDS58 LYCLKIASFSHPTFLWLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINE-FKLYSVFRGIEAT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNSTE--KKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSR
: :: .: :: .... . .. . :::. . . .:::.:: ::: .: .:.:.::
CCDS58 RNVTEHFRKKRSEYYLIHV--LGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DPSMKAHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLST-SNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSV
::. .:: ::. :..:... .:..... .:.. . ... ... ::::::
CCDS58 DPTTEAHKRAIRIILSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSF
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE5 QLILGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
::::: :....
CCDS58 ILILGNSKLKQTFVVMLRCESGHLKPGSKGPIFS
290 300 310
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10 20 30 40 50 60
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...: : ..::. . :::.. :.... . ..:::.
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70 80 90 100 110
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CCDS58 FSLGITRFLMLGLFLVNTIY---FVSSNTERSVYLSAFFVLCFMFLDSSSVWFVTLLNIL
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120 130 140 150 160 170
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CCDS58 YCVKITNFQHSVFLLLKRNISPKIPRLLLACVLIS-AFTTCL-----YITLSQASPFPEL
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CCDS58 VTTRNNTSFNISEGILSLVVSLVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWN
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300 310 320
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CCDS58 SVLIIITHPKLKTTAKKILCFKK
280 290
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:..::. : .:... . :..: .. .... .. : . .:: ..:.:. : .::
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CCDS86 FLKIANFSNSIFLYLKWRVKKVVLVLL----LVTSVFLF-LNIALINIHINASINGYRRN
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:.... :.. . . .:. .. ::.:. . . :::.:. .: .: .. : :
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: ::: :. .. ..::. ::. ...:.:. . . :: ... :::. :: :
CCDS86 ASTKAHRGVKSVITFFLLYAIFS-LSFFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVL
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:::: ::.: : :.. .
CCDS86 ILGNKKLRQASLSVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
290 300 310
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
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: .:: . : . :.::.::: . . :..: : : :.
CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVS-ESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFIL
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CCDS86 TGLAISRIFL-IWIIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFY
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CCDS86 FLKIANFSNYIFLWLKSRTNMVLPFMI-VFLLISSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLN
110 120 130 140 150 160
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CCDS86 MYKSEYFIKQILLNLGVIFFFTLS--------LITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDS
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CCDS86 ILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEKRKNLRVT
280 290 300
323 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]