Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5468, 316 aa
1>>>pF1KE5468 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1984+/-0.000453; mu= 16.1632+/- 0.028
mean_var=68.1384+/-14.434, 0's: 0 Z-trim(109.2): 44 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.155374
statistics sampled from 17331 (17373) to 17331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 4.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 2070 473.4 2.6e-133
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 844 198.6 1.4e-50
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 809 190.7 3.2e-48
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 793 187.2 3.8e-47
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 647 154.4 2.7e-37
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 642 153.3 5.9e-37
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 592 142.1 1.4e-33
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 585 140.5 4.1e-33
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 581 139.6 7.7e-33
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 572 137.6 3.1e-32
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 571 137.4 3.7e-32
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 550 132.7 9.5e-31
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 549 132.5 1.1e-30
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 546 131.8 1.7e-30
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 546 131.8 1.7e-30
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 546 131.8 1.7e-30
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 524 126.8 5.3e-29
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 522 126.4 7.3e-29
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 521 126.2 8.4e-29
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 520 126.0 9.8e-29
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 491 119.5 9.7e-27
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 471 115.0 2.1e-25
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 458 112.1 1.6e-24
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 444 108.9 1.3e-23
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 427 105.1 1.8e-22
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 356 89.2 1.1e-17
>>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa)
initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070 Z-score: 2514.3 bits: 473.4 E(85289): 2.6e-133
Smith-Waterman score: 2070; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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NP_058 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_058 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_058 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
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NP_058 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_058 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 CESGHLKPGSKGPIFS
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NP_058 CESGHLKPGSKGPIFS
310
>>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa)
initn: 824 init1: 476 opt: 844 Z-score: 1029.0 bits: 198.6 E(85289): 1.4e-50
Smith-Waterman score: 844; 44.6% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (1-293:1-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFR-GIEATR--NVTEHFRKKRSE
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NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSV--FISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
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NP_076 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVV
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NP_076 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 MLRCESGHLKPGSKGPIFS
NP_076 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 864 init1: 410 opt: 809 Z-score: 986.8 bits: 190.7 E(85289): 3.2e-48
Smith-Waterman score: 809; 41.0% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (1-301:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
........: ..:... .. . .: . :::.:.:..:..:::.:.: ::::: ::: ::
NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLG----ALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRS
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NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKH---KRNITEMFHVSKI
130 140 150 160 170
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pF1KE5 EYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRII
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NP_076 PYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
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NP_076 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
:: :
NP_076 RMLTCRKIACMI
300
>>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa)
initn: 783 init1: 429 opt: 793 Z-score: 967.3 bits: 187.2 E(85289): 3.8e-47
Smith-Waterman score: 793; 38.9% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
: . :....:: . ..:.:: : :: ::: .:.: . .:: :.:. .::. :: :::
NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
.: :.:.. . :.:. ......:..: :::.:. :.:...::...: ::::..::: :.
NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::: ....::. .:::..:.: .. :. : .:. . .:.: .:. .. .
NP_076 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPK-NDDMWYHLFK-VSHEENITWKFKVSKIPGTF
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
.. .: . :.:. : :. ::.::: :::.:. ..:. :::.:::: :::. .. :.
NP_076 KQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
.:...:. .::. . . ..:. :.. :::...:...:..::::::.:::::...:. :::
NP_076 LLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLR
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310
pF1KE5 ---CESGHLKPGSKGPIFS
: . ::
NP_076 FVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa)
initn: 606 init1: 586 opt: 647 Z-score: 790.4 bits: 154.4 E(85289): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 647; 38.1% identity (69.0% similar) in 310 aa overlap (8-313:8-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
.::::. ..: ...: : :: ::: : .:.... .:::.: ::. : :
NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::.::.. ..: .:. .:.: ::. :. . .. .: :.: .. .... :
NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLI--FDSLVLEI-FIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDK
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pF1KE5 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
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NP_852 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF-LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
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NP_852 SFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLQQTAV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
.: ::. .: :
NP_852 RLL----WHLRNYTKTPNPLPL
300 310
>>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa)
initn: 634 init1: 316 opt: 642 Z-score: 784.5 bits: 153.3 E(85289): 5.9e-37
Smith-Waterman score: 642; 39.5% identity (70.4% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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NP_076 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::: :.. :. .:.. ::.: ::.: . ... .. ... . .:::..
NP_076 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLIS-----SLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
..: .: . . .:: . .::.:: ::.::: .: :. :: .:::: .:.....::.
NP_076 KQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQ-TFVVM-
.::.:::... : . ..:. :.: . : .:: ::::::::::::::: .. :.
NP_076 ILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 -LRCESGHLKPGSKGPIFS
:.:
NP_076 QLKCCEKRKNLRVT
300
>>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa)
initn: 528 init1: 295 opt: 592 Z-score: 724.0 bits: 142.1 E(85289): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 592; 35.7% identity (66.3% similar) in 300 aa overlap (1-298:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
: . ..: .. ..: .: : : :: :.: .: . ...: : .. ::. :: :.
NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
::.. :: :: ..:. :: .::...:::: ....: ::::::: :.::
NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
.:::::..:.. .:::.:.. . .. ..: . . : ::.: .: . : .
NP_076 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDW--LDRYE--RNTTWNFSMSDFETFS
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 IHV--LGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILS
. : :.. : :. :.. :. :::::: .: ..: : . ::: :..: :..:..:
NP_076 VSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVIS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVM
:.... .:: :: :. . : .. . :. :.. .: :..:::.:::::.::.:.:...
NP_076 FLLFYASFFLCVLI-SWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRCESGHLKPGSKGPIFS
NP_076 AAKVWAKR
300
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300
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]