FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5467, 310 aa
1>>>pF1KE5467 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5192+/-0.00131; mu= 8.8247+/- 0.075
mean_var=219.4853+/-82.157, 0's: 0 Z-trim(102.3): 432 B-trim: 407 in 1/46
Lambda= 0.086571
statistics sampled from 6363 (6907) to 6363 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 1.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 2044 269.1 3e-72
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1631 217.5 1e-56
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1389 187.3 1.3e-47
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1375 185.6 4.3e-47
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1349 182.3 4.1e-46
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1296 175.7 4e-44
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1280 173.7 1.6e-43
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1240 168.7 5.1e-42
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1180 161.2 9.1e-40
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1146 157.0 1.7e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1142 156.5 2.4e-38
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1140 156.2 2.9e-38
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1132 155.2 5.8e-38
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1126 154.6 1e-37
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1115 153.1 2.6e-37
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1110 152.5 3.9e-37
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1102 151.5 7.9e-37
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1102 151.5 7.9e-37
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1099 151.1 1e-36
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1098 151.0 1.1e-36
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1095 150.6 1.4e-36
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1091 150.1 2e-36
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1091 150.1 2.1e-36
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1088 149.7 2.6e-36
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1083 149.1 4.2e-36
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1080 148.7 5.3e-36
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1078 148.6 6.6e-36
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1073 147.9 9.7e-36
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1066 147.1 2e-35
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1057 145.9 3.9e-35
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1055 145.7 4.9e-35
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1048 144.7 8.4e-35
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1047 144.6 9.1e-35
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1038 143.5 2e-34
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1025 141.9 6.1e-34
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1024 141.7 6.7e-34
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1022 141.5 8e-34
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1013 140.4 1.8e-33
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1004 139.2 3.8e-33
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1004 139.3 3.9e-33
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1001 138.9 4.9e-33
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 998 138.5 6.4e-33
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 998 138.5 6.4e-33
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 998 138.5 6.4e-33
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 996 138.2 7.6e-33
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 990 137.5 1.3e-32
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 987 137.1 1.6e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 941 131.4 8.9e-31
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 939 131.1 1.1e-30
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 936 130.8 1.4e-30
>>CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 2044 init1: 2044 opt: 2044 Z-score: 1410.6 bits: 269.1 E(32554): 3e-72
Smith-Waterman score: 2044; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
::::::::::
CCDS42 LGKCLVICRE
310
>>CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 (307 aa)
initn: 1657 init1: 1631 opt: 1631 Z-score: 1131.8 bits: 217.5 E(32554): 1e-56
Smith-Waterman score: 1631; 79.9% identity (93.1% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
:: : : :: ::.::.:::.:::.::::.::.::.::..::.::..::: : .::::::
CCDS32 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
:::::::..:::.:.::.::::::.: : :::::::::.::::::.:::. ::::::::.
CCDS32 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:: ::::.::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
:::::::::::::::::: ::::::: ..::.:::.:: :::::::: :.:::::::::
CCDS32 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
:::::::::::.: ::.:. ::::: ::: :::..:::::::::::::::::::.::.::
CCDS32 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
::.
CCDS32 LGRHRLV
>>CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1421 init1: 1357 opt: 1389 Z-score: 968.4 bits: 187.3 E(32554): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 1389; 63.9% identity (90.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
:. .: :.:. :..::..:..::.. :: ...:::.::..::.::::::: . .::::::
CCDS31 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
::::::...:.:.:..:.::.:.:.: ::::::..::..:.::::::::. :: :::::.
CCDS31 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:::::::.::.:.:::. :.::.::.:::::::::.:..:.:::::::::.::.::::
CCDS31 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
:::::.:::::: ::.:::::.::. . :..:::::::::.:::::.:..:::: :::
CCDS31 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
:.:: ::.. :.::::.:. ::: . : :.:...::..:.:::.:::::::.:: :::.
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
: . :
CCDS31 LKRRLGQSERILIQ
310
>>CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1375 init1: 1375 opt: 1375 Z-score: 959.0 bits: 185.6 E(32554): 4.3e-47
Smith-Waterman score: 1375; 63.4% identity (89.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
:: :.:.:. :..::..:.:. . :::.. :::.::..:::::::::: . :::::::
CCDS31 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
:::::::..:.:.:..:.::.:.:.: . ::::: .::.:::.::::::. .: :::::.
CCDS31 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
: :.:::.::.:::::. :..:. :.:.:::::::::..:.:::::::::.::.::::
CCDS31 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
:::::.:.:::: ::::::::.::.. .::..::.::::::. :::..: .:::: :::
CCDS31 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
:.:: ::.. :.::::.:. ::: . .::.:...::..:.:::.:::::::.::.::::
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
: . ::
CCDS31 LKRRLVPSERE
310
>>CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1349 init1: 1349 opt: 1349 Z-score: 941.4 bits: 182.3 E(32554): 4.1e-46
Smith-Waterman score: 1349; 62.7% identity (88.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
:: .: :.:. :..::..:..:.. :::..:::::::..:::::::::: . :::::::
CCDS53 MEMENCTRVKEFIFLGLTQNREVSLVLFLFLLLVYVTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
:::.::.. :.:.:..: ::.:::.: : ::::.. :..:.:.:::.:: :: :::::
CCDS53 FLLHNLSIADICFSSITVPKVLVDLLSERKTISFNHCFTQMFLFHLIGGVDVFSLSVMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:::.:::.::.:.:::. . :.::.::::.:::::::::..:.:::::::::.::.::::
CCDS53 DRYVAISKPLHYATIMSRDHCIGLTVAAWLGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
: .::.:: :: .::.:::::.:::. .::.:::.:: ::: . .:..:..:::: :::
CCDS53 VHRVLKLAHTDIFILELLMISNNGLLTTLWFFLLLVSYIVILSLPKSQAGEGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
:.:: ::.. :.::::.:. ::: . ::::.:...::..:.:::.::::::..::.::::
CCDS53 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPMDKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNHEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
: . ::
CCDS53 LKRRLVPSDRK
310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1298 init1: 1273 opt: 1296 Z-score: 905.6 bits: 175.7 E(32554): 4e-44
Smith-Waterman score: 1296; 61.8% identity (85.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
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CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
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CCDS31 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
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CCDS31 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
:
CCDS31 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
310
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CCDS31 MDQINHTNVKEFFFLELTRSRELEFFLFVVFFAVYVATVLGNALIVVTITCESRLHTPMY
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CCDS31 FLLRNKSVLDIVFSSITVPKFLVDLLSDRKTISYNDCMAQIFFFHFAGGADIFFLSVMAY
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CCDS31 DRYLAIAKPLHYVTMMRKEVWVALVVASWVSGGLHSIIQVILMLPFPFCGPNTLDAFYCY
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CCDS31 VLQVVKLACTDTFALELFMISNNGLVTLLWFLLLLGSYTVILVMLRSHSGEGRNKALSTC
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CCDS31 TSHMLVVTLHFVPCVYIYCRPFMTLPMDTTISINNTVITPMLNPIIYSLRNQEMKSAMQR
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310
pF1KE5 LGKCLVICRE
: . :
CCDS31 LQRRLGPSESRKWG
310
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CCDS32 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
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CCDS32 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
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CCDS32 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
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300 310
pF1KE5 RLGKCLVICRE
.:
CCDS32 KLRIKPCGIPLPC
310
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CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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CCDS32 LLSQHMFC
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CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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310 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]