FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5465, 310 aa
1>>>pF1KE5465 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2165+/-0.000475; mu= 22.4630+/- 0.030
mean_var=111.5980+/-34.908, 0's: 0 Z-trim(108.3): 388 B-trim: 981 in 1/49
Lambda= 0.121408
statistics sampled from 15855 (16412) to 15855 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 5.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1216 224.6 2e-58
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 822 155.6 1.2e-37
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 813 154.0 3.6e-37
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 813 154.0 3.6e-37
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 813 154.0 3.7e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 798 151.4 2.2e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 790 150.0 5.9e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 777 147.7 2.8e-35
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 777 147.7 2.9e-35
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 777 147.7 2.9e-35
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 777 147.7 2.9e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 772 146.8 5.2e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 770 146.4 6.6e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 766 145.8 1.1e-34
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 751 143.1 6.8e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 750 143.0 7.6e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 735 140.3 4.7e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 733 140.0 6e-33
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 715 136.9 5.5e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 711 136.1 8.7e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 519 102.5 1.2e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 476 95.0 2.2e-19
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 229 51.8 2.4e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 209 48.2 2.6e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 207 47.9 3.4e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 202 47.0 6.3e-05
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 202 47.1 6.4e-05
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 201 46.9 7.3e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 198 46.3 0.0001
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 196 46.0 0.00013
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 196 46.0 0.00013
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 196 46.0 0.00013
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 196 46.0 0.00013
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 196 46.1 0.00014
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 196 46.1 0.00014
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 196 46.1 0.00014
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 196 46.1 0.00014
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 196 46.2 0.00015
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 196 46.3 0.00016
NP_001286 (OMIM: 601159) C-C chemokine receptor ty ( 355) 194 45.7 0.00017
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 194 45.7 0.00018
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 193 45.4 0.00018
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 194 45.7 0.00018
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 194 45.7 0.00018
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 194 45.8 0.00018
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 195 46.1 0.00018
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 193 45.4 0.00018
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 194 45.8 0.00018
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 194 45.8 0.00018
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 193 45.4 0.00018
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1233 init1: 1200 opt: 1216 Z-score: 1169.8 bits: 224.6 E(85289): 2e-58
Smith-Waterman score: 1216; 57.0% identity (83.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
:.. :.. ::.:::::..: :::.::.:...:. :::: .::.::: .: .::::::.
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
: :::: :.:.:. ..: ::. .: :: : .: ::::::. :.:: : ..: .:: :.
NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
::::::::.: :::.: :: .:. ..:.:...:.: ::.. ..:::::: .:::. :::.
NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
:::.::: ::.:..:....::: :: .: .:..::.::: :::.:: ....::::.:.:
NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
:: :::::: ::::.: :: .:.:.:: ::.:::. ::.::::::::.::..:::.:::
NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 HGKIISENKG
: :: .:
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 716 init1: 579 opt: 822 Z-score: 796.8 bits: 155.6 E(85289): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 822; 42.9% identity (71.0% similar) in 303 aa overlap (7-306:11-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSP
: ::::::. : : ..:..:: .: ..::. ... :. . : .:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILM
::::: :::.: :. .. .:...:. :::.: :.: : : . . :. : :.: :
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AVDRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYC
: :::::::.:: : ..::. .:. ::::...:. . : .. .:. : .: .:.:.
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDLQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHSAKGKKKAL
::: :::::.: :: . . :: . .... :.:.::::. :: : :. .: .:.::..
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SACTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTF-P-MDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVK
:.:.::. : .. : .:::.:: . : ::...::::: : ::::::.::: .::
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 NAMRKLWHGKIISENKG
.: .:. ..:. :
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 849 init1: 599 opt: 813 Z-score: 788.3 bits: 154.0 E(85289): 3.6e-37
Smith-Waterman score: 813; 38.8% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (5-305:7-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMY
.:: ::.::::...: .:...::.:: .:..::.::.:::.... . : .:::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAV
::: :::.: ::: .:.:..... . : . :.. :.::.. . .: :. :.: .::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCD
:..::.:.::.: . :..:.: .:.. :. . .. . .: : ::. : :. ::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHSAKGKKKALSA
. :::::.: ::.. .....:... . . :. .. ::. : . :. :.::. ::.:.
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDK--MVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNA
: ::. ::.::.. : .: : .. .: :..:.::. ::.:::.::.::: .:.:
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRKLWHGKIISENKG
..:. :...
XP_011 LKKVV-GRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 849 init1: 599 opt: 813 Z-score: 788.3 bits: 154.0 E(85289): 3.6e-37
Smith-Waterman score: 813; 38.8% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (5-305:7-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMY
.:: ::.::::...: .:...::.:: .:..::.::.:::.... . : .:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAV
::: :::.: ::: .:.:..... . : . :.. :.::.. . .: :. :.: .::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCD
:..::.:.::.: . :..:.: .:.. :. . .. . .: : ::. : :. ::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHSAKGKKKALSA
. :::::.: ::.. .....:... . . :. .. ::. : . :. :.::. ::.:.
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDK--MVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNA
: ::. ::.::.. : .: : .. .: :..:.::. ::.:::.::.::: .:.:
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRKLWHGKIISENKG
..:. :...
NP_036 LKKVV-GRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 849 init1: 599 opt: 813 Z-score: 788.1 bits: 154.0 E(85289): 3.7e-37
Smith-Waterman score: 813; 38.8% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (5-305:17-319)
10 20 30 40
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIK
.:: ::.::::...: .:...::.:: .:..::.::.:::....
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 SSRTLGSPMYFFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCM
. : .:::::: :::.: ::: .:.:..... . : . :.. :.::.. . .: :
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 EIFVLILMAVDRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCG
. :.: .:: :..::.:.::.: . :..:.: .:.. :. . .. . .: : ::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 PYLIDHYCCDLQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHS
: :. ::. :::::.: ::.. .....:... . . :. .. ::. : . :. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 AKGKKKALSACTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDK--MVAVFYTIGTPFLNPLIY
.::. ::.:.: ::. ::.::.. : .: : .. .: :..:.::. ::.:::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 TLRNAEVKNAMRKLWHGKIISENKG
.::: .:.:..:. :...
XP_011 SLRNRYLKGALKKVV-GRVVFSV
310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 797 init1: 548 opt: 798 Z-score: 774.1 bits: 151.4 E(85289): 2.2e-36
Smith-Waterman score: 798; 41.1% identity (71.9% similar) in 302 aa overlap (1-299:1-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNS--VPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMY
:.: :. : ::.::::.. : ....:...: :. ::.::.:.: .. . : .:::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAV
::: ::.:: ::::. .:. .: ::.::.:... : .... . .::: . .: .:.
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCD
:::::::.:::::.::. .::. : . .: .... :... . ::::. : : :. :.
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYI-VILHSLRNHSAKGKKKALSA
:: :: ::. .. . . .: .....:: .:. .. .:. :. ::.:.
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMR
: ::..:::::.: :. : : .. ..: :.:::.: ::.::::::.::: .:: :.:
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KLWHGKIISENKG
:.
NP_003 KVATRNFP
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 763 init1: 520 opt: 790 Z-score: 766.5 bits: 150.0 E(85289): 5.9e-36
Smith-Waterman score: 790; 40.4% identity (70.2% similar) in 302 aa overlap (1-299:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
: ...:.: :.:::... : .. .::. : :. :.::: :::. . : ::::::
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
: ::: : ::.:: .:...:. . :: :.. .: .:.: . .: : ..: .:: ::
NP_009 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
:::.:.::.: ::. ..: : .::. .:..:..: .:.:::: .: . :..
NP_009 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHSAKGKKKALSACT
:..:.: :: . .. .. : : . ....:: .: . :: .::::..::...:.
NP_009 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMD--KMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMR
::. :: ::.. : .: .: . . .. :. ..::..::: :::::::::: :: :.:
NP_009 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KLWHGKIISENKG
.:
NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 779 init1: 525 opt: 777 Z-score: 754.2 bits: 147.7 E(85289): 2.8e-35
Smith-Waterman score: 777; 39.5% identity (70.8% similar) in 301 aa overlap (4-300:2-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNSV-PEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYF
:.:: :::.::::. : : :.:..::: :. . .::::::.. . :: .:::
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVD
::. :. .: .:: :... :. .. :.: ::.:.: . :. .. :: :
NP_001 FLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 RYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDL
:::::: ::.: :::....:. :. .. .. .: .. : .:: :::: :::. :..
NP_001 RYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 QPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISY-IVILHSLRNHSAKGKKKALSAC
::: :.: . . .... . .. ..:.. ::: ..:. :: ....::.::.:.:
NP_001 PPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPT--TFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAM
.::. :: :...: :. : :: . :: ::.::..::. :: :::..:...: :.. ..
NP_001 SSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RKLWHGKIISENKG
::..
NP_001 RKVFAFLKH
300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 775 init1: 543 opt: 777 Z-score: 754.1 bits: 147.7 E(85289): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 777; 41.1% identity (71.9% similar) in 299 aa overlap (7-300:9-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMY
: :::::::..: . .::.::..:. ::.:: ::.. :. . : .:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAV
::: ::..: ..::..:.:.. :.:.: : .. : .:.: .: .:. .: .::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCD
:::::.: ::: .:: .: : . .:....: : .: ....::.: .::: :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHSAKGKKKALSA
: ...:::.:: .. .. .: .. . : ....::: :. . :. .: .:.:::. .
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHIIVVILFFGPCIFIYTRP---PTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKN
:.::. :: : .: :: : .: :... ..:. .:::.: ::.:::.::.::: :::.
NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVL-QEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AMRKL-WHGKIISENKG
: .:: :
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 775 init1: 543 opt: 777 Z-score: 754.1 bits: 147.7 E(85289): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 777; 41.1% identity (71.9% similar) in 299 aa overlap (7-300:9-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMY
: :::::::..: . .::.::..:. ::.:: ::.. :. . : .:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAV
::: ::..: ..::..:.:.. :.:.: : .. : .:.: .: .:. .: .::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCD
:::::.: ::: .:: .: : . .:....: : .: ....::.: .::: :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHS-LRNHSAKGKKKALSA
: ...:::.:: .. .. .: .. . : ....::: :. . :. .: .:.:::. .
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHIIVVILFFGPCIFIYTRP---PTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKN
:.::. :: : .: :: : .: :... ..:. .:::.: ::.:::.::.::: :::.
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVL-QEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AMRKL-WHGKIISENKG
: .:: :
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
310 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 07:39:24 2016 done: Tue Nov 8 07:39:25 2016
Total Scan time: 5.250 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]