Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5465
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5465, 310 aa
1>>>pF1KE5465 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5556+/-0.00121; mu= 14.0518+/- 0.071
mean_var=147.1695+/-48.222, 0's: 0 Z-trim(102.1): 435 B-trim: 790 in 2/49
Lambda= 0.105722
statistics sampled from 6240 (6792) to 6240 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 1.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 2047 324.9 5e-89
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1286 208.8 4.4e-54
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1251 203.5 1.8e-52
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1223 199.2 3.7e-51
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1222 199.1 4.2e-51
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1216 198.1 7.2e-51
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1216 198.1 7.2e-51
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1187 193.7 1.5e-49
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1181 192.8 2.9e-49
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1179 192.5 3.7e-49
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1172 191.4 7.5e-49
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1161 189.7 2.4e-48
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1138 186.2 2.8e-47
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1128 184.7 7.9e-47
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1122 183.8 1.5e-46
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1103 180.9 1.1e-45
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1090 178.9 4.5e-45
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1071 176.0 3.3e-44
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1065 175.1 6.2e-44
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1058 174.0 1.3e-43
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1057 173.9 1.4e-43
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1051 172.9 2.7e-43
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1050 172.8 3e-43
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1045 172.0 5.2e-43
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1043 171.8 6.7e-43
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1029 169.6 2.8e-42
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1025 169.0 4.5e-42
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1022 168.5 5.8e-42
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1018 167.9 9e-42
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1014 167.3 1.4e-41
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1002 165.5 4.8e-41
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1002 165.5 4.8e-41
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1001 165.3 5.3e-41
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 993 164.1 1.3e-40
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 990 163.7 1.8e-40
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 988 163.3 2.1e-40
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 984 162.7 3.2e-40
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 973 161.1 1e-39
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 958 158.8 5.1e-39
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 949 157.4 1.3e-38
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 932 154.8 7.8e-38
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 917 152.5 3.9e-37
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 917 152.5 3.9e-37
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 917 152.5 3.9e-37
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 916 152.4 4.3e-37
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 915 152.2 4.8e-37
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 914 152.1 5.3e-37
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 895 149.2 4e-36
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 892 148.7 5.4e-36
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 882 147.2 1.6e-35
>>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 2047 init1: 2047 opt: 2047 Z-score: 1711.7 bits: 324.9 E(32554): 5e-89
Smith-Waterman score: 2047; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 HGKIISENKG
::::::::::
CCDS31 HGKIISENKG
310
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1301 init1: 1270 opt: 1286 Z-score: 1084.4 bits: 208.8 E(32554): 4.4e-54
Smith-Waterman score: 1286; 57.5% identity (87.3% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
:.....: ::::.::::.:. .:..::.::..:: :. ::.::.::: .:..:.::::::
CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
: .::. :. .:.:.::.::::...:::::..: ::.:..: :.:: ::..: .:: :
CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
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CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
:::::.:.::. ..:... ::: :: .:.::..::..::.::.:.: .:. ::::.: :
CCDS31 PLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
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CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 HGKIISENKG
. :. :.:
CCDS31 RKKVTSDND
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1251 init1: 1251 opt: 1251 Z-score: 1055.6 bits: 203.5 E(32554): 1.8e-52
Smith-Waterman score: 1251; 56.5% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
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CCDS31 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
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CCDS31 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
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CCDS31 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
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CCDS31 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
:: .:..::::: :.: :: ::: :::::::::: ::.:::::::::::::::::.:::
CCDS31 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 HGKIISENKG
... : ::
CCDS31 GRNVFLEAKGK
310
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 1202 init1: 1202 opt: 1223 Z-score: 1032.0 bits: 199.2 E(32554): 3.7e-51
Smith-Waterman score: 1223; 56.2% identity (84.5% similar) in 304 aa overlap (1-304:31-334)
10 20 30
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFL
:...:.: :::::::::.: ::..:: ::
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 IFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKII
..:: :..::.:::::: .:..::::::::: ::: :. .::. ::..::: ::::: :
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 TYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGS
... ::.:.: :::. :...:..:: :::.::::::. :...::..... ::::.
CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFM
..:: .:... .:::::: .::.. ::: ::::::: .::. .: ...:.::::. .:.
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVA
...:: ::::::...: .::.::. .:.::. :::::: ::::.:.:: .:::.:: ..
CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 VFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLWHGKIISENKG
: :. ::.::::::::.:::.:.:::::: :.
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 1246 init1: 1040 opt: 1222 Z-score: 1030.9 bits: 199.1 E(32554): 4.2e-51
Smith-Waterman score: 1222; 57.2% identity (83.0% similar) in 311 aa overlap (1-309:55-365)
10 20 30
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFL
::... : ::.::::.:.: :.::::.::
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KE5 IFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLG-SPMYFFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKI
. :..:: :::::.::: :: .: ::::::: .::: :.:::. .:..:::.: :
CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 ITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIG
:... :: :.:: :.:. .:..:: :: ::::::::::.: .::....: ::. .:: :
CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 SLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSF
.:.:: ::.....:::::: .:.:. ::: :::.::: ::....:..: ::: :: .:
CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 MILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMV
.:..:: ::: :::.::..:. ::::.: ::: :::::: ::::.:::::..: .:::.
CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310
pF1KE5 AVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLWHG-KIISENKG
:.:: : .:.:::::::.:: :::.:::..:. ..:..:
CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
330 340 350 360 370
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1233 init1: 1200 opt: 1216 Z-score: 1026.7 bits: 198.1 E(32554): 7.2e-51
Smith-Waterman score: 1216; 57.0% identity (83.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
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CCDS31 LSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDC
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CCDS31 PLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALSTCAS
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CCDS31 SKK---ENPGRE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]