Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5463
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5463, 309 aa
1>>>pF1KE5463 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5118+/-0.000529; mu= 14.0724+/- 0.032
mean_var=66.9834+/-14.336, 0's: 0 Z-trim(106.6): 89 B-trim: 874 in 1/49
Lambda= 0.156708
statistics sampled from 14615 (14703) to 14615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 4.960
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 2018 465.8 4.8e-131
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1832 423.8 2.2e-118
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1734 401.6 1e-111
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1726 399.8 3.7e-111
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1717 397.8 1.4e-110
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1717 397.8 1.4e-110
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1717 397.8 1.4e-110
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1421 330.8 2.1e-90
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1373 320.0 3.7e-87
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1366 318.4 1.1e-86
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 867 205.6 1e-52
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 789 188.0 2.2e-47
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 690 165.6 1.2e-40
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 686 164.7 2.2e-40
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 630 152.0 1.4e-36
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 622 150.2 5e-36
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 576 139.8 6.6e-33
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 572 138.9 1.3e-32
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 520 127.1 4.3e-29
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 442 109.5 8.5e-24
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 415 103.4 5.9e-22
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 406 101.4 2.6e-21
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 364 91.9 1.8e-18
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 357 90.3 5.1e-18
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 349 88.5 1.8e-17
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 317 81.3 3e-15
NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380) 163 46.5 0.0001
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 149 43.3 0.00087
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 149 43.3 0.00087
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 149 43.3 0.00093
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 149 43.3 0.00095
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 149 43.3 0.00095
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 2473.6 bits: 465.8 E(85289): 4.8e-131
Smith-Waterman score: 2018; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
:::::::::
NP_795 VKGEKPSSS
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1832 init1: 1832 opt: 1832 Z-score: 2246.3 bits: 423.8 E(85289): 2.2e-118
Smith-Waterman score: 1832; 88.3% identity (96.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: :::::::.::: ::::.:::::::::::::.::::::::::::::.::::
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::::::::.::.::::::::.:::::::::.:. :::.::::::::::.::::.:: :::
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
..::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::::::::
NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
:::::..::::: :::::::::::.:: ::::: :::::::::::::::::::.:..:::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
::::: ::
NP_795 VKGEKTSSP
>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1734 init1: 1734 opt: 1734 Z-score: 2126.6 bits: 401.6 E(85289): 1e-111
Smith-Waterman score: 1734; 85.4% identity (93.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..:: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: .:::: :.::: :::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
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NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
:.:::::::::. :::::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::::::.
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
:::::..::::: :::::::::::.:: ::::: :::::::::::::::::::: .::::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
::::::::
NP_795 VKGEKPSSP
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 1726 init1: 1726 opt: 1726 Z-score: 2116.6 bits: 399.8 E(85289): 3.7e-111
Smith-Waterman score: 1726; 87.1% identity (95.0% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::: ::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.:.::::.::::: :.:::::::::::: ::::.:::::::.::::.::::::::::.
NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
.::::::::::::::::::::::::::::.. .::::::::.::::::::::: :: :.:
NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::::.:.:: .: ::..::::::.:: :::::::::::: ::::::: ::::: :::::
NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
::
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1717 init1: 1717 opt: 1717 Z-score: 2106.0 bits: 397.8 E(85289): 1.4e-110
Smith-Waterman score: 1717; 85.3% identity (95.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::.::::::::::::::::::: :: :::::::::::.::::::::::::
XP_006 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: ::::: :.:.: ::::.::: .::::: :::::::::::::::::::::.
XP_006 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::::::::.::.::::::::.:::::.:::::.:::::::::::::::: :::::.::::
XP_006 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::: :::::.:::: ::.:: ::
XP_006 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::.:.:.:::::..::::::::::.::.:: :.:::::::::::::::.:::::..::
XP_006 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE5 VKGEKPSSS
>>XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1717 init1: 1717 opt: 1717 Z-score: 2106.0 bits: 397.8 E(85289): 1.4e-110
Smith-Waterman score: 1717; 85.3% identity (95.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::.::::::::::::::::::: :: :::::::::::.::::::::::::
XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: ::::: :.:.: ::::.::: .::::: :::::::::::::::::::::.
XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::::::::.::.::::::::.:::::.:::::.:::::::::::::::: :::::.::::
XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::: :::::.:::: ::.:: ::
XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::.:.:.:::::..::::::::::.::.:: :.:::::::::::::::.:::::..::
XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE5 VKGEKPSSS
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1717 init1: 1717 opt: 1717 Z-score: 2106.0 bits: 397.8 E(85289): 1.4e-110
Smith-Waterman score: 1717; 85.3% identity (95.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::.::::::::::::::::::: :: :::::::::::.::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: ::::: :.:.: ::::.::: .::::: :::::::::::::::::::::.
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::::::::.::.::::::::.:::::.:::::.:::::::::::::::: :::::.::::
NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::: :::::.:::: ::.:: ::
NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::.:.:.:::::..::::::::::.::.:: :.:::::::::::::::.:::::..::
NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE5 VKGEKPSSS
>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1449 init1: 1410 opt: 1421 Z-score: 1744.1 bits: 330.8 E(85289): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 1421; 69.5% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
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NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
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NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
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NP_795 AKGQNQSTP
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1395 init1: 1366 opt: 1373 Z-score: 1685.7 bits: 320.0 E(85289): 3.7e-87
Smith-Waterman score: 1373; 70.5% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
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NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
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NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE5 VKGEKPSSS
>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1358 init1: 1358 opt: 1366 Z-score: 1677.2 bits: 318.4 E(85289): 1.1e-86
Smith-Waterman score: 1366; 69.7% identity (88.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
:... :::: .: :. ..::::.: :.::: :::: :::.::::: ::::::::::: ::
NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
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NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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pF1KE5 VKGEKPSSS
309 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]