FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5463, 309 aa
1>>>pF1KE5463 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9270+/-0.00127; mu= 12.1023+/- 0.075
mean_var=71.7789+/-15.773, 0's: 0 Z-trim(100.7): 59 B-trim: 411 in 1/46
Lambda= 0.151383
statistics sampled from 6154 (6201) to 6154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 1.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 2018 450.4 7.9e-127
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1832 409.8 1.3e-114
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1734 388.4 3.7e-108
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1726 386.7 1.3e-107
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1421 320.0 1.4e-87
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1373 309.6 2e-84
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1366 308.0 5.6e-84
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 867 199.1 3.7e-51
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 789 182.0 5.1e-46
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 690 160.4 1.7e-39
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 686 159.5 3e-39
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 630 147.3 1.4e-35
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 622 145.5 4.8e-35
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 576 135.5 5e-32
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 572 134.6 9.4e-32
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 520 123.3 2.4e-28
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 442 106.2 3.2e-23
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 430 103.6 2.2e-22
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 415 100.3 1.9e-21
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 406 98.4 7.9e-21
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 364 89.2 4.5e-18
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 357 87.7 1.2e-17
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 349 85.9 4.1e-17
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 320 79.6 3.7e-15
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 2390.4 bits: 450.4 E(32554): 7.9e-127
Smith-Waterman score: 2018; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
:::::::::
CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1832 init1: 1832 opt: 1832 Z-score: 2170.9 bits: 409.8 E(32554): 1.3e-114
Smith-Waterman score: 1832; 88.3% identity (96.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
..::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::::::::
CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
::::: ::
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1734 init1: 1734 opt: 1734 Z-score: 2055.2 bits: 388.4 E(32554): 3.7e-108
Smith-Waterman score: 1734; 85.4% identity (93.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..:: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: .:::: :.::: :::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
:.:::::::::. :::::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::::::.
CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
:::::..::::: :::::::::::.:: ::::: :::::::::::::::::::: .::::
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
::::::::
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 1726 init1: 1726 opt: 1726 Z-score: 2045.6 bits: 386.7 E(32554): 1.3e-107
Smith-Waterman score: 1726; 87.1% identity (95.0% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::: ::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.:.::::.::::: :.:::::::::::: ::::.:::::::.::::.::::::::::.
CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
.::::::::::::::::::::::::::::.. .::::::::.::::::::::: :: :.:
CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::::.:.:: .: ::..::::::.:: :::::::::::: ::::::: ::::: :::::
CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
::
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1449 init1: 1410 opt: 1421 Z-score: 1685.8 bits: 320.0 E(32554): 1.4e-87
Smith-Waterman score: 1421; 69.5% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:..:: :.::::.::.:..::::::::::.: : : :::::: ::::..:::::::::::
CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
:..:.::.: :::. ....: : :.::: :::: ::::::::::::::.::: ::: :
CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
:::..:::::::.:: :.:::::: . . .::.: :::.:::::::.::.::: ::.
CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.::::.::::::::::::: :::::::::::::::::::: :.::::::::::::.: ::
CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::: .:.: :.:. .. :.:.:.:... ::: : :::::::: ::::::::::.: :
CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VKGEKPSSS
.::.. :.
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1395 init1: 1366 opt: 1373 Z-score: 1629.4 bits: 309.6 E(32554): 2e-84
Smith-Waterman score: 1373; 70.5% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::: :.:::::.: ::.:::::::::::: :.: ::.::: ::::::::::::.::::
CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
.:.:::: : ::::: :.:.:::.::.:.: :::: :::..:::::::::::::::.:::
CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
:::::.::.:::::: :.::::::.: ::.. .:..::::::: :.:::....:: :::
CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
: ...::::.:::::.::::::::::::::::.:::: : :::::::::. ::::::::
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
.:: .:.:::: . :.: :: : .:.. : . ::::: .::::.::: .: ..:
CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE5 VKGEKPSSS
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1358 init1: 1358 opt: 1366 Z-score: 1621.1 bits: 308.0 E(32554): 5.6e-84
Smith-Waterman score: 1366; 69.7% identity (88.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
:. :: :: :::.: .::.:: ::::::::: :.: . .::: :.::::::.:::.::::
CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
:... :::: .: :. ..::::.: :.::: :::: :::.::::: ::::::::::: ::
CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
::.:.::::::::::::.::.:.: ::.:.. .::::::::.:::::::.:..::. :::
CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
::::.::::.:: :::::::::::::::.::.::::::: ::::::::::::::.: ::
CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
::: :: :.:.... ..: :...:...:. ::: : :::: :..:::::::::::..
CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
pF1KE5 VKGEKPSSS
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 814 init1: 266 opt: 867 Z-score: 1032.0 bits: 199.1 E(32554): 3.7e-51
Smith-Waterman score: 867; 46.9% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]