Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5455
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5455, 310 aa
1>>>pF1KE5455 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1455+/-0.00119; mu= 10.8434+/- 0.069
mean_var=157.9685+/-52.373, 0's: 0 Z-trim(103.6): 377 B-trim: 449 in 1/48
Lambda= 0.102044
statistics sampled from 6992 (7468) to 6992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 2052 314.8 5.3e-86
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 2027 311.1 6.8e-85
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1610 249.7 2.1e-66
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1429 223.1 2.2e-58
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1429 223.1 2.2e-58
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1314 206.2 2.7e-53
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1264 198.8 4.5e-51
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1252 197.1 1.5e-50
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1232 194.1 1.2e-49
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 899 145.1 6.7e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 871 141.0 1.2e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 870 140.9 1.4e-33
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 868 140.6 1.7e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 866 140.2 1.9e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 857 138.9 4.8e-33
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 857 138.9 5e-33
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 856 138.7 5.4e-33
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 855 138.6 6e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 854 138.5 6.6e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 854 138.5 6.6e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 854 138.5 6.7e-33
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 852 138.2 8.2e-33
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 851 138.0 9.1e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 849 137.7 1.1e-32
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 848 137.6 1.2e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 843 136.8 2e-32
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 842 136.7 2.3e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 841 136.5 2.5e-32
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 840 136.4 2.8e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 839 136.2 3.1e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 838 136.1 3.4e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 836 135.8 4.2e-32
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 835 135.6 4.6e-32
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 835 135.7 4.7e-32
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 834 135.5 5.1e-32
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 833 135.4 5.7e-32
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 833 135.4 5.7e-32
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 829 134.8 8.5e-32
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 829 134.8 8.7e-32
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 828 134.6 9.6e-32
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 827 134.5 1e-31
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 826 134.3 1.2e-31
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 825 134.2 1.3e-31
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 825 134.2 1.3e-31
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 824 134.0 1.4e-31
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 823 133.9 1.6e-31
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 822 133.8 1.8e-31
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 821 133.6 1.9e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 821 133.6 2e-31
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 821 133.6 2e-31
>>CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 (310 aa)
initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052 Z-score: 1657.4 bits: 314.8 E(32554): 5.3e-86
Smith-Waterman score: 2052; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
::::::::::
CCDS51 KRVLGVERAL
310
>>CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2027 init1: 2027 opt: 2027 Z-score: 1637.6 bits: 311.1 E(32554): 6.8e-85
Smith-Waterman score: 2027; 99.0% identity (99.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS55 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
::::::::::
CCDS55 KRVLGVERAL
310
>>CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1743 init1: 1608 opt: 1610 Z-score: 1305.8 bits: 249.7 E(32554): 2.1e-66
Smith-Waterman score: 1610; 79.5% identity (88.6% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
:: : ::: ::::::::.::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::.::::
CCDS43 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::: ::.:::.:::::::::::::::: : : ::: .:: ::::::::::::
CCDS43 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
:::::::::: .::::.::::::.::: ::::.:.:::::::: :: :::. ::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
.:::::::::::::: ::::::.: ::: . . :.::. ::::::.::: : .::: :
CCDS43 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
:::::.:: ::::::::: :.: .::::::::::::::::::::::: ::::.::..::
CCDS43 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
::.: .:
CCDS43 KRMLEKKRTS
310
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1479 init1: 1429 opt: 1429 Z-score: 1161.8 bits: 223.1 E(32554): 2.2e-58
Smith-Waterman score: 1429; 70.7% identity (87.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
::.: : . ::::::: .::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::.::::
CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::. ::::.::.::::::::::::: : :::: .:. .::::::.::::
CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
:::::::::: .:::::::::::::::: : ::.: :.::.: ::: :..: ::::::
CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
:.::.:::::: .:. ...:. . :::: : ..::: :: :::.::: : .:::: ::
CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
:::::.:: .:.:::::..:. .:.::.: ..::.:.::: ::::: ::::.:::..:
CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
.:.:: :
CCDS56 RRALGKESHS
310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1479 init1: 1429 opt: 1429 Z-score: 1161.8 bits: 223.1 E(32554): 2.2e-58
Smith-Waterman score: 1429; 70.7% identity (87.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
::.: : . ::::::: .::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::.::::
CCDS43 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::. ::::.::.::::::::::::: : :::: .:. .::::::.::::
CCDS43 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
:::::::::: .:::::::::::::::: : ::.: :.::.: ::: :..: ::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
:.::.:::::: .:. ...:. . :::: : ..::: :: :::.::: : .:::: ::
CCDS43 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
:::::.:: .:.:::::..:. .:.::.: ..::.:.::: ::::: ::::.:::..:
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
.:.:: :
CCDS43 RRALGKESHS
310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1308 init1: 919 opt: 1314 Z-score: 1070.3 bits: 206.2 E(32554): 2.7e-53
Smith-Waterman score: 1314; 64.8% identity (84.2% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
: : : . ::.:::::.. :::::: :::::.:::::::::.::::: ::::::.::::
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNL-LHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSY
::::::..::.:: :.::.::.:: :. : :::. :::::. .:: ::::.::.:::
CCDS43 FLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
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300 310
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310
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310
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CCDS43 KRVLWKQRSM
310
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310
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CCDS43 RRALRKERLT
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>>CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 (312 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]