Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5445, 316 aa
1>>>pF1KE5445 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2888+/-0.00061; mu= 16.3935+/- 0.037
mean_var=112.4375+/-31.040, 0's: 0 Z-trim(105.8): 349 B-trim: 828 in 1/47
Lambda= 0.120954
statistics sampled from 13443 (13929) to 13443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16
Scan time: 5.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1034 192.3 1.1e-48
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1023 190.4 4.1e-48
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NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 921 172.6 9.4e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 916 171.7 1.7e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 914 171.4 2.2e-42
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XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 893 167.7 2.8e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 893 167.7 2.8e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 883 166.0 9.3e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 825 155.8 1e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 825 155.8 1e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 810 153.2 6.3e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 799 151.3 2.5e-36
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 551 108.0 2.6e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 531 104.5 2.9e-22
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 213 49.1 1.5e-05
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 212 49.0 1.8e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 202 47.3 6.7e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 198 46.4 9.1e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 198 46.5 9.5e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 189 44.9 0.00029
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 189 45.0 0.0003
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 190 45.3 0.00031
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 189 45.0 0.00031
XP_011509323 (OMIM: 602886) PREDICTED: G-protein c ( 293) 187 44.5 0.00032
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 190 45.3 0.00033
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 189 45.0 0.00033
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 188 44.8 0.00035
NP_115892 (OMIM: 606111) melanin-concentrating hor ( 340) 187 44.6 0.00036
NP_001035269 (OMIM: 606111) melanin-concentrating ( 340) 187 44.6 0.00036
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 189 45.1 0.00036
NP_001499 (OMIM: 602886) G-protein coupled recepto ( 453) 187 44.7 0.00043
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 185 44.3 0.0005
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 183 43.8 0.00055
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 183 43.8 0.00055
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 184 44.1 0.00056
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 183 43.8 0.00057
NP_005279 (OMIM: 600752) G-protein coupled recepto ( 334) 183 43.8 0.00057
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 183 43.9 0.00059
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 183 43.9 0.00061
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 183 43.9 0.00061
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 183 43.9 0.00064
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 183 44.0 0.00067
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
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310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1023; 52.1% identity (80.9% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
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pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
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pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCE
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pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
.::: :..
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 987; 47.3% identity (81.4% similar) in 296 aa overlap (12-306:10-305)
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pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
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pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCE
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pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
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pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
...::::
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
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Smith-Waterman score: 973; 46.1% identity (78.6% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-308)
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pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGNL-IDHFTCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MKKLL-GKITLHQTHEHL
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NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 946 init1: 575 opt: 953 Z-score: 919.0 bits: 178.2 E(85289): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 953; 47.0% identity (81.2% similar) in 287 aa overlap (12-297:10-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCE
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
XP_011 GS
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 882 init1: 519 opt: 921 Z-score: 888.6 bits: 172.6 E(85289): 9.4e-43
Smith-Waterman score: 921; 45.8% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (5-304:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYLFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCG-NLIDHFT
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CEILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 DAMKKLLGKITLHQTHEHL
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 860 init1: 489 opt: 916 Z-score: 883.9 bits: 171.7 E(85289): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 916; 47.7% identity (76.6% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCG-NLIDHFTCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQ--EKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
..:.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 896 init1: 518 opt: 914 Z-score: 882.0 bits: 171.4 E(85289): 2.2e-42
Smith-Waterman score: 914; 45.4% identity (79.1% similar) in 302 aa overlap (3-303:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YLFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCG-NLIDHFTC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 EILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKD
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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:.:.:
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]