FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5445, 316 aa
1>>>pF1KE5445 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6427+/-0.00152; mu= 14.4677+/- 0.088
mean_var=202.0958+/-70.668, 0's: 0 Z-trim(100.7): 414 B-trim: 348 in 1/47
Lambda= 0.090218
statistics sampled from 5733 (6232) to 5733 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 2017 276.2 2.3e-74
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CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1191 168.7 5.2e-42
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CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1172 166.3 3e-41
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CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 1130 160.8 1.3e-39
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CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 1091 155.7 4.3e-38
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1065 152.4 4.8e-37
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1037 148.7 5.6e-36
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1034 148.3 7.3e-36
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1031 147.9 9.7e-36
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1026 147.3 1.5e-35
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1010 145.2 6.4e-35
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 990 142.6 3.9e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 989 142.4 4.3e-34
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 989 142.5 4.4e-34
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 987 142.2 5.1e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 977 140.9 1.3e-33
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 975 140.6 1.5e-33
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 974 140.5 1.6e-33
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CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 957 138.3 7.6e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 956 138.1 8.3e-33
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 952 137.6 1.2e-32
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 952 137.6 1.2e-32
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 943 136.5 2.7e-32
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 938 135.8 4.3e-32
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CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 935 135.4 5.6e-32
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 934 135.3 6.1e-32
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 931 134.9 8e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 930 134.8 8.9e-32
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 923 133.8 1.6e-31
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 923 133.9 1.7e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 921 133.6 2e-31
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 921 133.6 2e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 916 132.9 3.1e-31
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 915 132.8 3.4e-31
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 914 132.7 3.7e-31
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 912 132.4 4.5e-31
>>CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 (316 aa)
initn: 2017 init1: 2017 opt: 2017 Z-score: 1448.7 bits: 276.2 E(32554): 2.3e-74
Smith-Waterman score: 2017; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGNLIDHFTCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGNLIDHFTCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KKLLGKITLHQTHEHL
::::::::::::::::
CCDS67 KKLLGKITLHQTHEHL
310
>>CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 (319 aa)
initn: 689 init1: 689 opt: 1303 Z-score: 946.4 bits: 183.3 E(32554): 2.1e-46
Smith-Waterman score: 1303; 65.1% identity (88.7% similar) in 301 aa overlap (5-304:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
:.: ..::. :: .:: ..:..:. :.::: ::::: :: ::::::.:.::::
CCDS35 MFPANWTSVKVFFFLGFFHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
:::.::::.:: :.:... .:.:..:...:: :::::.:::::::::::::::: .:::
CCDS35 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQMYLSLAMGSTECVLLPMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCE
:::::::::::: .:::: .:...:. ::.::::::..: .: . :::: .:.:::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPVIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
:::.:::.:... :.. ::::.:.::::.::::.:::: :::..::::.:.:::.:::::
CCDS35 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDA
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CCDS35 CTAHLMVVVLFYGTALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MKKLLGKITLHQTHEHL
.::::
CCDS35 LKKLLIRNHFNTAFISILK
310
>>CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 (346 aa)
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Smith-Waterman score: 1272; 62.1% identity (86.2% similar) in 311 aa overlap (1-310:33-342)
10 20 30
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVF
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CCDS35 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 SLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMYLFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQK
:.::. ::::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::.:.: .:. ..: .:
CCDS35 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
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pF1KE5 TIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAYDRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWV
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CCDS35 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
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160 170 180 190 200
pF1KE5 TGCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCEILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIP
::::.::.: .....:.::: .:::.::::::.:::.:.. . :: :..:. : :
CCDS35 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
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210 220 230 240 250 260
pF1KE5 MLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFSTCGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKI
.::. :::.::::.::::. ::::.::::::.:: ::::.::.:: ::.::.:.:..
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270 280 290 300 310
pF1KE5 DKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
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CCDS35 DEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSR-HLHLLKM
310 320 330 340
>>CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 (318 aa)
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Smith-Waterman score: 1191; 58.7% identity (86.1% similar) in 310 aa overlap (1-303:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
:. :: :: :::.: : .: ::...::. ..::.. ::::.:::::.::: .:.::::
CCDS35 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLC-GNLIDHFTCE
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CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
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CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSS---NAQKID---KIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRN
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CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
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CCDS35 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
310
>>CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1202 init1: 686 opt: 1179 Z-score: 859.2 bits: 167.2 E(32554): 1.5e-41
Smith-Waterman score: 1179; 56.9% identity (85.9% similar) in 313 aa overlap (1-306:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
:. :: :: :::.:.: .: ::...::. ..::.. ::::.:::::.::: .:.::::
CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
.:::::::.:::::..:.:. ::..:: .::: .:::::::.:.::::.::::::..::.
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLC-GNLIDHFTCE
:::::::::::: :::.. . . ::. ::. : ... ... :..:.:.: .:.:.:::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
::::.::::.. . ::::.. :.. :.::. .:: .:. .:..:.:.:::.:: ::
CCDS35 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSS---NAQKID---KIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRN
:.:::::::..::. : ::.::.:. :.. .: ::::..:::.:::.::.::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
:.::.:.:.::..
CCDS35 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
310
>>CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 (347 aa)
initn: 1148 init1: 641 opt: 1172 Z-score: 853.9 bits: 166.3 E(32554): 3e-41
Smith-Waterman score: 1172; 56.5% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (3-310:32-347)
10 20 30
pF1KE5 MQGE-NFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFS
:: : :. : :.: :.: :: .:.: :..
CCDS35 IVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFALI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMYLFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKT
:::::. :.::..::. .:.::...::::.:::::::.::::::.:::. ::.:.:....
CCDS35 LVMYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKRN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 IIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAYDRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVT
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CCDS35 ISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWLS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE5 GCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCEILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSIL-LLPIP
: ... ..: .:...:.::: .:.::.::::::::::: ... .: : .:.: . .: .:
CCDS35 GGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLAC-ADISLNIITMVISNMAFLVLP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 MLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFSTCGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNA---
.... .::.::: :::...:: :: ::::::.:::::::..::. . :: ::.:..
CCDS35 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310
pF1KE5 ---QKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
: .::.:::.:::.:::::::.::::::.:: :.: ::.: .:
CCDS35 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
310 320 330 340
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10 20 30 40 50 60
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CCDS35 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
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CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
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CCDS35 ILAVLKLAC-SDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFS
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CCDS35 TCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLR
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300 310
pF1KE5 NKEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
::.:: :.: ::.. ...:
CCDS35 NKDVKAAIKYLLSRKAINQ
300 310
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10 20 30 40 50
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CCDS65 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
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pF1KE5 YDRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCG-NLIDHFTC
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CCDS65 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
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pF1KE5 EILAVLKLACTSSLLMNTI-MLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAF
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CCDS65 EILAVLKLAC-ADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVF
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pF1KE5 STCGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDK------IISLLYGVLTPMLNPIIYSL
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300 310
pF1KE5 RNKEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
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CCDS65 RNKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
300 310
>>CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 (318 aa)
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CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLSLAMGTTECVLLGVMAF
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::::.::::.. . :.::.. :.: :.::. .:: .:. .:..:.:.:::.: ::
CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFILLVTTTLFLLTPLLLIIVSYTLIILSIFKISSSEGRSKPSST
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CCDS35 CSARLTVVITFCGTIFLMYMKPKSQETLNSDDLDATDKLIFIFYRVMTPMMNPLIYSLRN
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CCDS35 KDVKEAVKHLLRRKNFNK
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
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CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
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CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
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CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
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CCDS31 LRKLLSGKL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]