Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5443
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5443, 313 aa
1>>>pF1KE5443 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4759+/-0.00105; mu= 14.2761+/- 0.061
mean_var=146.8295+/-51.788, 0's: 0 Z-trim(104.9): 386 B-trim: 970 in 2/49
Lambda= 0.105844
statistics sampled from 7634 (8138) to 7634 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 2041 324.1 8.8e-89
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1672 267.8 8.7e-72
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1466 236.3 2.4e-62
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1242 202.1 4.7e-52
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1219 198.6 5.3e-51
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1212 197.5 1.1e-50
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1197 195.2 5.5e-50
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1171 191.2 8.6e-49
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1168 190.8 1.2e-48
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1167 190.6 1.3e-48
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1156 189.0 4.2e-48
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1147 187.6 1.1e-47
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1141 186.7 2.1e-47
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1133 185.5 4.9e-47
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1130 185.0 6.6e-47
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1123 183.9 1.4e-46
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1056 173.7 1.7e-43
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1043 171.7 6.6e-43
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1037 170.8 1.2e-42
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1025 168.9 4.4e-42
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1025 169.0 4.5e-42
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1017 167.7 1e-41
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1012 167.0 1.8e-41
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 1002 165.4 5.1e-41
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 1001 165.3 5.6e-41
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 992 164.0 1.5e-40
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 971 160.7 1.4e-39
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 969 160.4 1.7e-39
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 964 159.6 2.8e-39
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 963 159.5 3.2e-39
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 961 159.2 3.9e-39
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 950 157.5 1.3e-38
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 948 157.2 1.5e-38
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 948 157.2 1.5e-38
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 945 156.7 2.1e-38
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 944 156.6 2.3e-38
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 943 156.4 2.6e-38
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 939 155.9 4.2e-38
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 936 155.4 5.4e-38
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 936 155.4 5.4e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 936 155.4 5.5e-38
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 934 155.1 6.8e-38
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 932 154.8 8.4e-38
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 931 154.6 9.3e-38
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 929 154.3 1.1e-37
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 928 154.1 1.3e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 926 153.8 1.6e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 925 153.7 1.8e-37
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 923 153.4 2.2e-37
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 922 153.2 2.4e-37
>>CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 2041 init1: 2041 opt: 2041 Z-score: 1707.4 bits: 324.1 E(32554): 8.8e-89
Smith-Waterman score: 2041; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
:::::::::::::
CCDS46 FKRLVARVFLIKK
310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1725 init1: 1672 opt: 1672 Z-score: 1402.3 bits: 267.8 E(32554): 8.7e-72
Smith-Waterman score: 1672; 81.6% identity (92.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
::::: :. :::::: :::.::::.: .:.::.:: .::::::::::::..: :::::::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
:::.::::::::::: ::::::::.:. :::::: :::::::::::::.:: :::::: :
CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
:::::::::::::.:::::::.:::::::..:::::: :: ::..::: .:::.::
CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
::::::::::.:::::::::..: :: :::.:::::::::::.::::::::::..:::::
CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
::::::::::::.::.:.:::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::.
CCDS46 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
::::::. .:
CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
>>CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 1466 init1: 1466 opt: 1466 Z-score: 1232.9 bits: 236.3 E(32554): 2.4e-62
Smith-Waterman score: 1466; 70.6% identity (87.9% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
::: :.: .:::::::::: ::..::.::.:::::.:::::..:..: :: :::::::
CCDS34 MNWENESSPKEFILLGFSDRAWLQMPLFVVLLISYTITIFGNVSIMMVCILDPKLHTPMY
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pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
:::::::.::::::: :::.::::. .:.::: ::::.:.::::::::: ::::::::
CCDS34 FFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNIGCNKKTISYAGCVAHLIIFLALGATECLLLAVMSF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
::.::.:::::: :::. .::..:: ::. ::.::: :.:::..: : .:::.::
CCDS34 DRYVAVCRPLHYVVIMNYWFCLRMAAFSWLIGFGNSVLQSSLTLNMPRCGHQEVDHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
:::::::::..: :::::. : :. :::.:::::::.::..:::.:.:::::::::::
CCDS34 VPALLKLSCADTKPIEAELFFFSVLILLIPVTLILISYGFIAQAVLKIRSAEGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
::::.:::::::.::. .:::::: .::: :::::::::::. ::: :::.::::..::.
CCDS34 CGSHMIVVSLFYGTAIYMYLQPPSSTSKDWGKMVSLFYGIITSMLNSLIYSLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
::::. :.:. ::
CCDS34 FKRLMPRIFFCKK
310
>>CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1261 init1: 1240 opt: 1242 Z-score: 1048.0 bits: 202.1 E(32554): 4.7e-52
Smith-Waterman score: 1242; 58.1% identity (87.7% similar) in 308 aa overlap (2-309:7-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKL
....:: . ::::: :::::::.::.::.:.::.....::..:::.::.: .:
CCDS31 MKSDNHSFLGDSP-KAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HTPMYFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLL
:.:::.::..::.::::::: ::::::::. : .:.::: ::..: .: :: :: ..:
CCDS31 HSPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AVMSFDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVID
:.:..::.::::.::::.:.::. :: ::.: .:..::.:: .::.:::.: :..
CCDS31 AAMALDRYVAICKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFLCEVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQ
.:.:::::..::::..:..:.. : .. .: :.::.:::.::.::.::::::::..::.
CCDS31 NFFCEVPAVIKLSCADTAVNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFGTCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNK
::::::.:::..::::: :. .:::::: :..:::..::::.::.: :::. ::::::
CCDS31 KAFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 EVKEGFKRLVARVFLIKK
..: ...::.::..
CCDS31 DMKGALRRLLARIWRLCG
300 310
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1219 init1: 1219 opt: 1219 Z-score: 1029.1 bits: 198.6 E(32554): 5.3e-51
Smith-Waterman score: 1219; 59.9% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (4-305:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHT
:: : :::.:::. : :: ..:: :: : .:..::: ::..: ::..:::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAV
::::::.:::.::::::: ..::.:::: . .:.::: ::. ::.. ::::.:: .::.:
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSFDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHF
::.::..:.::::::.:.:: :.: ::.::::.::.::. :..:. .::: .:::
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LCEVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKA
.:::::::.::::.: .:: :...: .: :::: ::: ::. ::::.::.::. : ::.
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FGTCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEV
:::::.::..::::. :. .:::::: .:.::::...::: ...: ::::::::::: :
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KEGFKRLVARVFLIKK
. . :::.
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1215 init1: 1196 opt: 1212 Z-score: 1023.3 bits: 197.5 E(32554): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 1212; 59.2% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
:. :.: ...::::::::.: :: :.: :. : .:. ::.:::..: :: ::::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
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130 140 150 160 170 180
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CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
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CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
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...:..
CCDS31 LRKLLSGKL
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pF1KE5 YFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMS
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CCDS43 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGITECVLLVVMS
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CCDS43 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
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CCDS43 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
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300 310
pF1KE5 GFKRLVARVFLIKK
. :::.
CCDS43 AAKRLLGWEWGK
310
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310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
.. :.
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
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CCDS34 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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CCDS34 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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CCDS34 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
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CCDS31 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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CCDS31 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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CCDS31 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
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CCDS31 LGRLLLGKRELGKE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]