Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5442
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5442, 314 aa
1>>>pF1KE5442 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7415+/-0.00142; mu= 13.1141+/- 0.083
mean_var=142.9825+/-48.358, 0's: 0 Z-trim(100.2): 375 B-trim: 722 in 2/48
Lambda= 0.107259
statistics sampled from 5564 (6022) to 5564 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 2.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1986 320.0 1.5e-87
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1144 189.7 2.4e-48
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1142 189.4 3e-48
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1136 188.5 5.7e-48
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1136 188.5 5.7e-48
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1100 183.0 2.8e-46
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1095 182.2 4.7e-46
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1094 182.0 5.2e-46
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1091 181.5 7.1e-46
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1089 181.3 9.7e-46
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1086 180.8 1.2e-45
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1086 180.8 1.2e-45
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1079 179.7 2.6e-45
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1076 179.2 3.6e-45
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1070 178.3 6.8e-45
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1067 177.8 9.3e-45
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1065 177.5 1.1e-44
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1063 177.2 1.4e-44
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1059 176.6 2.3e-44
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1058 176.5 2.6e-44
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1057 176.3 2.8e-44
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1057 176.3 2.8e-44
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1055 176.0 3.4e-44
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1048 174.9 7.4e-44
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1046 174.6 9e-44
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1041 173.8 1.5e-43
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 1034 172.7 3.2e-43
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1034 172.7 3.3e-43
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1029 171.9 5.5e-43
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1024 171.2 9.4e-43
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1021 170.7 1.3e-42
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1017 170.1 2.1e-42
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1012 169.3 3.4e-42
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1011 169.2 3.8e-42
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1009 168.9 4.8e-42
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1008 168.8 5.6e-42
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1007 168.5 5.9e-42
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 1005 168.2 7.2e-42
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1004 168.2 8.8e-42
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 999 167.3 1.4e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 995 166.7 2.1e-41
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 995 166.7 2.2e-41
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 994 166.5 2.4e-41
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 991 166.1 3.3e-41
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 991 166.1 3.3e-41
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 985 165.1 6.2e-41
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 984 165.0 6.9e-41
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 983 164.8 7.7e-41
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 983 164.8 7.8e-41
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 979 164.2 1.2e-40
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1986 init1: 1986 opt: 1986 Z-score: 1685.5 bits: 320.0 E(32554): 1.5e-87
Smith-Waterman score: 1986; 99.7% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS31 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LANVISRKRTSSFL
::::::::::::::
CCDS31 LANVISRKRTSSFL
310
>>CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1165 init1: 803 opt: 1144 Z-score: 981.3 bits: 189.7 E(32554): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 1144; 53.1% identity (82.3% similar) in 311 aa overlap (1-311:2-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
: :.: :....:.: ::.:. :.:. ::..::.:: .:.:::.::.:.::.: ::::::
CCDS31 MMGRRNDTNVADFILTGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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CCDS31 YDRYAAICSPLHYTVIMPKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
:. :.. :::.:: : . :.:: ... .:..: .:: .: .:....: :...:::
CCDS31 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKK
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CCDS31 TCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALANVISRKRTSSFL
:: :..:.. :
CCDS31 ALIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1164 init1: 805 opt: 1142 Z-score: 979.7 bits: 189.4 E(32554): 3e-48
Smith-Waterman score: 1142; 53.4% identity (83.3% similar) in 311 aa overlap (1-311:2-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
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CCDS31 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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pF1KE5 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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pF1KE5 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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CCDS31 HDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFYDSNVIHHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
:. :.. :::.:: : . :..: ... .:..: .:: ..::.:....: :...:::
CCDS31 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKK
::.::: .. .::.: :.:::.: .::::..:.:::::::.:::.::::::::::::::.
CCDS31 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPVLNPLIYSLRNKEVKN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALANVISRKRTSSFL
:. :..:.. :
CCDS31 AVIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 665 init1: 614 opt: 1136 Z-score: 974.7 bits: 188.5 E(32554): 5.7e-48
Smith-Waterman score: 1136; 54.2% identity (82.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
:. .:.: .: :.: :.:. :::. :::.:: :: .:::::::.: :::.:::::::::
CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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CCDS31 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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CCDS31 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSS-INHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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CCDS31 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKKA
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CCDS31 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LANVISRKRTSSFL
: :: ::
CCDS31 LLRVIHRKLFP
300 310
>>CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1157 init1: 792 opt: 1136 Z-score: 974.7 bits: 188.5 E(32554): 5.7e-48
Smith-Waterman score: 1136; 54.0% identity (82.3% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
: :.: :.. .:.: ::.:. :.:. ::..::.:: .:.:::.::::.::.: :::::::
CCDS31 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
:::..:::.:. ::.:::: ::.::. .. ::: ::: ::.::. :...::.:.. :::
CCDS31 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLT-SNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
:::.::: :: : .:::. . ...: .. ...: .::. .: : ::::::..:::::
CCDS31 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
. :.. ::: :: : . :::: ... .:..: .:: .: .:....: :...:.::
CCDS31 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKKA
::::: .. .::.: :.:::.: .::::..:.:::::::.::::::::::::::::::.:
CCDS31 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LANVISRKRTSSFL
: :..:.. :
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1095 init1: 1071 opt: 1100 Z-score: 944.4 bits: 183.0 E(32554): 2.8e-46
Smith-Waterman score: 1100; 51.0% identity (83.9% similar) in 304 aa overlap (4-307:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
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CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
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pF1KE5 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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CCDS31 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
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pF1KE5 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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CCDS31 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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CCDS31 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKK
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CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
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300 310
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:. ... :
CCDS31 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
310 320
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CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
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CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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pF1KE5 KEVKKALANVISRKRTSSFL
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
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pF1KE5 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTP
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CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFF
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDSPPLFKLSCSDTILKE-SISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRA
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CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEII-CFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KE5 FSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEV
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CCDS79 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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pF1KE5 KKALANVISRKRTSSFL
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CCDS79 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVV-FVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
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CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
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: .....
CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
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10 20 30
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CCDS32 LGRIKPSQSPRCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLFVV
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CCDS32 VISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTIMSPEVCASLIVGSYS
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CCDS32 TLTILISYFLILNTILKMSSAQGRFKAFSTCASHLTAICLFFGTTLFMYLRPRSSYSLTQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]