Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5435
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5435, 318 aa
1>>>pF1KE5435 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6436+/-0.00107; mu= 14.1878+/- 0.062
mean_var=153.7100+/-49.710, 0's: 0 Z-trim(104.4): 424 B-trim: 887 in 2/47
Lambda= 0.103448
statistics sampled from 7314 (7868) to 7314 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 1.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 2100 325.9 2.5e-89
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1952 303.9 1.1e-82
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 1834 286.2 2.2e-77
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 1510 237.9 8e-63
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 1478 233.1 2.2e-61
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1035 167.0 1.7e-41
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1032 166.5 2.4e-41
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1008 163.0 2.8e-40
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1004 162.4 4.3e-40
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 956 155.2 6.1e-38
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 955 155.1 6.9e-38
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 953 154.8 8.7e-38
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 933 151.8 6.7e-37
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 931 151.5 8.2e-37
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 929 151.2 1e-36
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 929 151.2 1e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 925 150.6 1.5e-36
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 917 149.4 3.5e-36
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 914 148.9 4.7e-36
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 905 147.6 1.2e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 900 146.9 2e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 897 146.4 2.8e-35
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 892 145.7 4.7e-35
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 887 144.9 7.8e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 886 144.8 9.1e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 885 144.6 9.5e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 881 144.0 1.4e-34
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 881 144.0 1.5e-34
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 880 143.9 1.6e-34
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 878 143.6 2e-34
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 876 143.2 2.4e-34
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 876 143.3 2.4e-34
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 876 143.3 2.5e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 875 143.1 2.7e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 874 143.0 3e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 874 143.0 3e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 874 143.0 3e-34
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 870 142.4 4.5e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 867 141.9 6.1e-34
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 862 141.2 1e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 862 141.2 1e-33
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 859 140.7 1.4e-33
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 858 140.6 1.6e-33
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 858 140.6 1.6e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 854 140.0 2.3e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 853 139.8 2.6e-33
CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 ( 307) 851 139.5 3.2e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 851 139.5 3.2e-33
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 851 139.5 3.2e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 848 139.1 4.4e-33
>>CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 2100 init1: 2100 opt: 2100 Z-score: 1717.2 bits: 325.9 E(32554): 2.5e-89
Smith-Waterman score: 2100; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
::::::::::::::::::
CCDS12 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
310
>>CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 2001 init1: 1952 opt: 1952 Z-score: 1597.9 bits: 303.9 E(32554): 1.1e-82
Smith-Waterman score: 1952; 93.6% identity (97.4% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
:: ::..:..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
::::::::::::::::: :::.: ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS32 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
::::: :.::.:.
CCDS32 AMKKTCFTKLFPQNC
310
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1834 init1: 1834 opt: 1834 Z-score: 1502.7 bits: 286.2 E(32554): 2.2e-77
Smith-Waterman score: 1834; 89.6% identity (96.4% similar) in 307 aa overlap (5-311:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
::.....:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.::: .::.:: ::
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::..: .:: ::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS12 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
:::::: ::.::::::::::::::.:.: ::::::. ::.::::::::::::::::::::
CCDS12 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
:::.::.: ::
CCDS12 AMKRTFLSTLYSSGT
310
>>CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1497 init1: 1449 opt: 1510 Z-score: 1241.4 bits: 237.9 E(32554): 8e-63
Smith-Waterman score: 1510; 72.2% identity (88.2% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
: :.: ...: : :::.:: :: .::::.:::.:::::::::::::.: :. :::::
CCDS32 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
:::::.:::::::.:::: ::::::::::..::.:.:::.:::::: ::::::::: :::
CCDS32 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFAC
:::::::::::::::::::: :: ::.:.:::: ::::.::. .:::.::: . :::: :
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
:: :::::: . . : :: :::.:::.::..::.:::.:::::::.:::::::.:.:
CCDS32 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.::: ::::::. .:. .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS32 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VAMKKTFFSKLYPEKNVMM
:..:.:. :. :
CCDS32 NAINKNFYRKFCPPSS
310
>>CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1491 init1: 1409 opt: 1478 Z-score: 1215.6 bits: 233.1 E(32554): 2.2e-61
Smith-Waterman score: 1478; 71.2% identity (87.9% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQL-MLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
: :. :...::: :::.::. : .::::.:::.::::::::::::::: :: :::::
CCDS12 MPGQNYRTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
::::::::.::::.:::: :::::::: :.:::.:.::: :::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFAC
::.::.:::::.::.:::::::: ::. .:::: ::::.:: .:::.::: . :::: :
CCDS12 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
:: :::::::. . : :: :::.:::.::..::.::..:::::::.:::::::.:.:
CCDS12 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.:::.::::::. .:. .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS12 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VAMKKTFFSKLYPEKNVMM
:..:.: .. :
CCDS12 NAINKNFCRRFCPLSS
310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1045 init1: 666 opt: 1035 Z-score: 858.3 bits: 167.0 E(32554): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 1035; 50.8% identity (79.4% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
:...:...: .:...::: . .:: .::..:::.::::: : .:..:. .:.::::::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
.:: :: ::: :: .:.:.::.:::: ...:.::.:: ::: . :: .:::::..:::
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130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VPPLLKLAC---GDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNK
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CCDS30 ISPVLKLASQHSGFSQLVIF----MLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYK
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CCDS30 TFSTCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKE
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300 310
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300 310
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CCDS30 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
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:....: ..:
CCDS30 ALRNAFRGRLLGKG
300 310
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CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
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CCDS30 DMAPVIKLAC-TDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGK-KAF
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pF1KE5 VAMKKTFFSKLYPEKNVMM
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CCDS30 TALKRVLGMPVATKMS
300 310
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CCDS30 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMF-SFLFLGCSHSFLLAVMG
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CCDS30 DIAPVLKLASHHNHFSQIV---IFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCK
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300 310
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CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
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