FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5426, 315 aa
1>>>pF1KE5426 315 - 315 aa - 315 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1842+/-0.000434; mu= 16.8960+/- 0.027
mean_var=110.9059+/-31.078, 0's: 0 Z-trim(110.8): 381 B-trim: 1164 in 1/52
Lambda= 0.121786
statistics sampled from 18562 (19173) to 18562 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 6.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 920 173.0 7e-43
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 860 162.5 1e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 860 162.5 1.1e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 857 161.9 1.5e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 829 157.0 4.5e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 828 156.8 5e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 827 156.7 5.8e-38
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 809 153.5 5.2e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 809 153.5 5.2e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 808 153.4 6e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 805 152.8 8.4e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 804 152.6 9.5e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 799 151.8 1.7e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 797 151.4 2.2e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 796 151.2 2.4e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 785 149.3 9.6e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 784 149.1 1.1e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 713 136.6 6.1e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 577 112.8 9.7e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 570 111.5 2.3e-24
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 222 50.5 6.4e-06
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 222 50.5 6.4e-06
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 222 50.5 6.4e-06
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 222 50.5 6.4e-06
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 222 50.5 6.6e-06
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 222 50.5 6.6e-06
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 222 50.5 6.6e-06
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 222 50.5 6.7e-06
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 214 49.1 1.7e-05
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 214 49.1 1.7e-05
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 208 48.1 4e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 201 46.7 7.6e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 201 46.7 7.7e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 201 46.7 7.8e-05
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 201 46.9 9.5e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 199 46.4 0.0001
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 198 46.1 0.0001
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 198 46.1 0.0001
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 198 46.1 0.0001
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 200 46.7 0.00011
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 200 46.8 0.00012
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 195 45.6 0.00016
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 194 45.5 0.00018
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 193 45.4 0.00023
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 193 45.4 0.00023
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 193 45.4 0.00023
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 193 45.4 0.00023
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 193 45.4 0.00023
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 920; 47.7% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (5-310:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
: : .:::::..::..: ..: .::: :: .:: :: :: ::. .. .. ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTI-LVVMIPC-LLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
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NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
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pF1KE5 KVAMKRTFLSTLYSSGT
: :..::: ..:
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPPLLKLACGNN--VPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKA
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pF1KE5 FSTCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKEL
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300 310
pF1KE5 KVAMKRTFLSTLYSSGT
: :.:.. ...:
XP_011 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 854 init1: 541 opt: 860 Z-score: 833.9 bits: 162.5 E(85289): 1e-39
Smith-Waterman score: 860; 43.0% identity (72.9% similar) in 314 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPPLLKLACGNN--VPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKA
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEG---ALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKA
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pF1KE5 FSTCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKEL
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NP_036 FSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYL
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pF1KE5 KVAMKRTFLSTLYSSGT
: :.:.. ...:
NP_036 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 854 init1: 541 opt: 860 Z-score: 833.8 bits: 162.5 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 860; 43.0% identity (72.9% similar) in 314 aa overlap (1-312:11-321)
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pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVW
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pF1KE5 IIFSLRNKELKVAMKRTFLSTLYSSGT
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 857; 43.4% identity (77.6% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-301)
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pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
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NP_003 APALLILA-STDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFS
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NP_003 TCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--VSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKA
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310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
:...
NP_003 ALRKVATRNFP
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 829; 42.6% identity (72.6% similar) in 310 aa overlap (5-313:7-314)
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pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYLFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GYDRYVAICHPLRYNVLMSPRG-CACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMS-RGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LCHVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNK
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEII-CFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFSTCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LKVAMKRTFLSTLYSSGT
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 793 init1: 543 opt: 828 Z-score: 803.6 bits: 156.8 E(85289): 5e-38
Smith-Waterman score: 828; 40.5% identity (77.6% similar) in 304 aa overlap (4-306:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMF-FSFSFGFTHSFLLTVMG
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLG-AEMVLFTTMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLC
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NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAF
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NP_001 EIPPLLALSC-SPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELK
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NP_001 STCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VAMKRTFLSTLYSSGT
......:
NP_001 AGIRKVFAFLKH
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 815 init1: 546 opt: 827 Z-score: 802.6 bits: 156.7 E(85289): 5.8e-38
Smith-Waterman score: 827; 40.7% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
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NP_001 MPALIRMACVSTV-AIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFG
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
:. : .:
NP_001 ALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 793 init1: 521 opt: 809 Z-score: 785.4 bits: 153.5 E(85289): 5.2e-37
Smith-Waterman score: 809; 43.3% identity (72.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:5-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
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NP_036 LLAVVRLAC-VDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
: ..
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 793 init1: 521 opt: 809 Z-score: 785.4 bits: 153.5 E(85289): 5.2e-37
Smith-Waterman score: 809; 43.3% identity (72.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:5-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
:.: .:::::.:.:. .. ::.:::.::. :.::: ::. . . ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
.:: ::. .. :.....:..:: .:. ...: : .::.:.:::...: . ::.::.:
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
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XP_011 LLAVVRLAC-VDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
:::::: :: . :: : :..:.. : . :... ::.:::.:.:.:.::::::.:
XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
: ..
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
315 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]