Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5426, 315 aa
1>>>pF1KE5426 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9193+/-0.00104; mu= 12.8955+/- 0.061
mean_var=192.9751+/-65.899, 0's: 0 Z-trim(105.0): 410 B-trim: 458 in 1/51
Lambda= 0.092326
statistics sampled from 7688 (8203) to 7688 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 2077 289.8 1.8e-78
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1834 257.5 1e-68
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1828 256.7 1.8e-68
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 1514 214.8 6.9e-56
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 1497 212.6 3.3e-55
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1059 154.2 1.2e-37
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1024 149.6 3.1e-36
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1012 148.0 9.3e-36
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 990 145.0 7e-35
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 964 141.6 8.1e-34
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 927 136.7 2.4e-32
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 921 135.8 4.1e-32
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 920 135.7 4.5e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 920 135.7 4.6e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 908 134.1 1.4e-31
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 907 134.0 1.5e-31
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 903 133.4 2.2e-31
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 902 133.3 2.4e-31
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 897 132.6 3.7e-31
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 895 132.4 4.7e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 894 132.2 5e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 894 132.2 5e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 891 131.8 6.6e-31
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 889 131.5 7.7e-31
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 886 131.2 1e-30
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 885 131.1 1.2e-30
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 882 130.6 1.5e-30
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 879 130.3 2.1e-30
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 877 130.0 2.4e-30
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 875 129.7 2.9e-30
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 870 129.1 4.6e-30
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 865 128.4 7.2e-30
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 860 127.7 1.1e-29
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 859 127.6 1.3e-29
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 858 127.5 1.4e-29
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 858 127.5 1.4e-29
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 858 127.5 1.4e-29
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 857 127.3 1.5e-29
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 857 127.3 1.5e-29
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 851 126.5 2.6e-29
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 850 126.4 2.9e-29
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 847 126.0 3.8e-29
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 845 125.7 4.6e-29
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 845 125.7 4.6e-29
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 844 125.6 5e-29
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 842 125.3 6.2e-29
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 841 125.2 6.7e-29
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 839 124.9 7.9e-29
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 839 124.9 8.2e-29
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 837 124.6 9.6e-29
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 2077 init1: 2077 opt: 2077 Z-score: 1522.1 bits: 289.8 E(32554): 1.8e-78
Smith-Waterman score: 2077; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
:::::::::::::::
CCDS12 AMKRTFLSTLYSSGT
310
>>CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 1834 init1: 1834 opt: 1834 Z-score: 1347.1 bits: 257.5 E(32554): 1e-68
Smith-Waterman score: 1834; 89.6% identity (96.4% similar) in 307 aa overlap (5-311:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
::.....:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.::: .::.:: ::
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::..: .:: ::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS12 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
:::::: ::.::::::::::::::.:.: ::::::. ::.::::::::::::::::::::
CCDS12 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
:::.::.: ::
CCDS12 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
310
>>CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1872 init1: 1823 opt: 1828 Z-score: 1342.9 bits: 256.7 E(32554): 1.8e-68
Smith-Waterman score: 1828; 88.4% identity (95.2% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::.::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
::::::::::::::::: :::.: :::::::: :::::::::::.:.::: .::.::.::
CCDS32 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::..: .:: ::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS32 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
:::::: ::.::::::::::::::::.: ::::::. ::.::::::::::::::::::::
CCDS32 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AMKRTFLSTLYSSGT
:::.: .. :.
CCDS32 AMKKTCFTKLFPQNC
310
>>CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1529 init1: 1451 opt: 1514 Z-score: 1116.8 bits: 214.8 E(32554): 6.9e-56
Smith-Waterman score: 1514; 73.6% identity (90.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
: . :.. .::: : :::::: :: .::::.:::.:::::::::::::.: :. :::::
CCDS32 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YLFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
:::::.:::::::.:::: ::::::::::..::.:.:::.:::::: ::::::::: :::
CCDS32 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLC
:::::::::::::::::::: :: ::.:.:::::::::.::. .:.::::::. :.::.:
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAF
:: :::::: :.. .: .:: :::. ::.::..::.:::.:::: ::.:::::::.:.:
CCDS32 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.::: ::..::.::: ::::::: ::. .:.::::::.:.:::::::::::::::::
CCDS32 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VAMKRTFLSTLYSSGT
:....:
CCDS32 NAINKNFYRKFCPPSS
310
>>CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1517 init1: 1414 opt: 1497 Z-score: 1104.6 bits: 212.6 E(32554): 3.3e-55
Smith-Waterman score: 1497; 73.0% identity (90.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQL-MLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
: : :. ..::::: ::::::. : .::::.:::.::::::::::::::: :: :::::
CCDS12 MPGQNYRTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YLFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
:::::.::.::::.:::: :::::::: :.:::.:.::: :::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLC
::.::.:::::.::.:::::::: ::. .:::::::::.:: .:.::::::. :.::::
CCDS12 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAF
:: :::::::... .: .:: :::. ::.::..::.::..:::: ::.:::::::.:.:
CCDS12 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.::: ::..::.:::.::::::: ::. .:.::::::.:.:::::::::::::::::
CCDS12 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VAMKRTFLSTLYSSGT
:....:
CCDS12 NAINKNFCRRFCPLSS
310
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1090 init1: 656 opt: 1059 Z-score: 789.3 bits: 154.2 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1059; 51.6% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (5-314:5-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
: :: .:...:::. .:::.:: ::: .:: :: .:..:. .. . ::::::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::: :: :: ::..::::::. : . ...:....::.::::: :.. :. :::..::.
CCDS30 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
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CCDS30 TALKRVLGMPVATKMS
300 310
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