FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5425, 311 aa
1>>>pF1KE5425 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6129+/-0.00157; mu= 8.6751+/- 0.091
mean_var=166.6481+/-56.183, 0's: 0 Z-trim(100.3): 381 B-trim: 749 in 2/44
Lambda= 0.099351
statistics sampled from 5564 (6043) to 5564 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 1.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 2025 303.4 1.5e-82
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1662 251.4 6.8e-67
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1497 227.7 9e-60
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1477 224.8 6.5e-59
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1362 208.4 6e-54
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1350 206.6 2e-53
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1333 204.3 1.1e-52
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1305 200.2 1.7e-51
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1262 194.1 1.3e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1237 190.4 1.5e-48
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1134 175.7 4.1e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1101 171.0 1.1e-42
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1096 170.2 1.8e-42
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1047 163.2 2.4e-40
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1046 163.1 2.6e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1037 161.8 6.5e-40
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1037 161.9 6.9e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1034 161.4 8.5e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1029 160.6 1.4e-39
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1027 160.3 1.7e-39
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1022 159.6 2.8e-39
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1008 157.6 1.1e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1007 157.5 1.2e-38
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1005 157.2 1.5e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 995 155.8 4.1e-38
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 995 155.8 4.1e-38
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 992 155.3 5.5e-38
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 991 155.2 6.1e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 991 155.2 6.1e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 989 154.9 7.6e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 987 154.6 9.3e-38
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 985 154.3 1.1e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 985 154.3 1.1e-37
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 984 154.2 1.2e-37
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 984 154.2 1.2e-37
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 981 153.8 1.6e-37
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 981 153.8 1.7e-37
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 977 153.2 2.4e-37
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 970 152.2 4.9e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 969 152.0 5.4e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 963 151.2 9.8e-37
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 962 151.1 1.1e-36
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 956 150.2 2e-36
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 956 150.2 2e-36
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 952 149.6 3.1e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 950 149.3 3.6e-36
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 948 149.0 4.3e-36
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 948 149.0 4.3e-36
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 947 148.9 4.8e-36
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 946 148.8 5.5e-36
>>CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2025 init1: 2025 opt: 2025 Z-score: 1595.7 bits: 303.4 E(32554): 1.5e-82
Smith-Waterman score: 2025; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
:::::::::::
CCDS84 LKKILNKNAFS
310
>>CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1646 init1: 1646 opt: 1662 Z-score: 1314.5 bits: 251.4 E(32554): 6.8e-67
Smith-Waterman score: 1662; 80.1% identity (94.5% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
:::.::: ::.::: ::: :::..:::::::::::.::::::::::::: ::::::::::
CCDS31 MAAKNSS-VTEFILEGLTHQPGLRIPLFFLFLGFYTVTVVGNLGLITLIGLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
:::.:::.::::.:..:::::::::: .:: ::..::::::::: :::::::::::::::
CCDS31 FFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFFFCFFVVSESFILSAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
:::::::::::: :::: :::.:::::.::::::::::::. .:..::::.:::::.:::
CCDS31 DRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGFAGAMAHTGSIMNLTFCADNLVNHFMCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
:::::: .:.:.:.::::::.::..:.:.: ::.:::::::::::.: .:::::::::::
CCDS31 ILPLLELSCNSSYMNELVVFIVVAVDVGMPIVTVFISYALILSSILHNSSTEGRSKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
::::::.:::::::::::::::.:.: ..:::::::::: .::.::::::::::::::::
CCDS31 CSSHIIVVSLFFGSGAFMYLKPLSILPLEQGKVSSLFYTIIVPVLNPLIYSLRNKDVKVA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
:.. :... ::
CCDS31 LRRTLGRKIFS
300 310
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1518 init1: 1270 opt: 1497 Z-score: 1186.6 bits: 227.7 E(32554): 9e-60
Smith-Waterman score: 1497; 73.0% identity (90.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
: :.:.:.::.::::::::.: : ::::::: :.::.::::::: :. ::::::::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNLGLIILFGLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
.::.::::::.:::::.::::::.:: ::: :::.:::::::::::::.:: ..:..:::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISYVGCMTQLFFFLFFVISECYMLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
:::::::::::: :::: ::: .: ...: ::.::: :::.::. .:::. :..:::.::
CCDS31 DRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
:::::. .::::::::.::..::::.: ::. ::.:::..:..::.:: ::.::::::::
CCDS31 ILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
::::.::.::::::.::::.: .: .:.::::::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHVIALSLFFGSAAFMYIK-YSSGSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
:.: : :
CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
300 310
>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1466 init1: 1250 opt: 1477 Z-score: 1171.1 bits: 224.8 E(32554): 6.5e-59
Smith-Waterman score: 1477; 72.0% identity (90.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
: :.:.:.::.::::::::.: . ::::::: .:.::.:::::::::. ::::::::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFRQPLFFLFLVIYIVTMVGNLGLITLFGLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
.::.::::::.:::::.::::::.:: ::: :: .::::.::::::::.:: ..:..:::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISNVGCMTRLFFFLFFVISECYMLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
:::::::::::: :::: ::: .: ...: ::.::: :::.::. .:::. :..:::.::
CCDS31 DRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
:::::. .::::::::.::..::: .: ::. ::.:::..:..::.:: ::.::::::::
CCDS31 ILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGTNITVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
::::.::.::::::.::::.: .: .:.::::::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHVIALSLFFGSAAFMYIK-YSSGSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
:.: : :
CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
300 310
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1416 init1: 1354 opt: 1362 Z-score: 1082.1 bits: 208.4 E(32554): 6e-54
Smith-Waterman score: 1362; 64.8% identity (88.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
:..::.: ::.::::::..:: .:.:::.::::.::::::::::. ::: :.::::::::
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
.:: .:::::::.:.:::::::..:: .:: ::: :::::.::: :...: .:.::::
CCDS73 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
:::.:::.:::: : .: ..:: :.:::: .:.. : .::.::. : :: .:.:::.::
CCDS73 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
.::::. .:.: :::.:... : ...: ::..::. :: .:..::.:: :::::::::::
CCDS73 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
::::..:: .::::.:::::.: :. .:.::::::.::: .::::::::::::::::.:.
CCDS73 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
:::.:..
CCDS73 LKKMLQRRTLL
310
>>CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1347 init1: 953 opt: 1350 Z-score: 1072.8 bits: 206.6 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 1350; 66.5% identity (85.8% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
:. .::: ::.:::.::..:: .:.:::.::::.:: :::::::::::: .: ::::::
CCDS31 MTLRNSSSVTEFILVGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVFTVVGNLGLITLIGINPSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
:::.::::::.::: :.::::: .:: ... :::.::::::::: ::: :: ..: .:::
CCDS31 FFLFNLSFIDLCYSCVFTPKMLNDFV-SESIISYVGCMTQLFFFCFFVNSECYVLVSMAY
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
::::::::::::::::::.:::::..: : .:::::::::. :. .::: .:...::.::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVTMSPRVCFLLMFGSYVVGFAGAMAHTGSMLRLTFCDSNVIDHYLCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
.::::. .::::.:.::: :.:::. . ...: ::::::::.:. : :.:::::::::
CCDS31 VLPLLQLSCTSTHVSELVFFIVVGVITMLSSISIVISYALILSNILCIPSAEGRSKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
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CCDS31 WGSHIIAVALFFGSGTFTYLTTSFPGSMNHGRFASVFYTNVVPMLNPSIYSLRNKDDKLA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
: : :.. :
CCDS31 LGKTLKRVLF
300
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10 20 30
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::::: ::::.:::.:::.. .:.:::..
CCDS66 QGITFLQKENNNTIHLNTMFFLSPAETHQRMAAENHSFVTKFILVGLTEKSELQLPLFLV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 FLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMYFFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKN
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CCDS66 FLGIYVVTVLGNLGMITLIGLSSHLHTPMYCFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
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CCDS66 IISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDGYVAICSPLLYSIIISNKACFSLILVVYV
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160 170 180 190 200 210
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.:. : :: .::. : :: ...:::.::.. .:. .:.:::.:::.... ::.: ::
CCDS66 IGLICASAHIGCMFRVQFCKFDVINHYFCDLISILKLSCSSTYINELLILIFSGINILVP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
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CCDS66 SLTILSSYIFIIASILRIRYTEGRSKAFSTCSSHISAVSVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQ
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280 290 300 310
pF1KE5 GKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVALKKILNKNAFS
:::::.::: :::::::::::::::::.::::: :.: .:
CCDS66 GKVSSVFYTIVVPMLNPLIYSLRNKDVHVALKKTLGKRTFL
310 320 330 340
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
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CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
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pF1KE5 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
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CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
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pF1KE5 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
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CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
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310
pF1KE5 LKKILNKNAFS
:.:.:
CCDS31 LRKVLVGK
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10 20 30 40
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::: : : ::.::: ::: . .:.:::.::::.:.::.::::
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pF1KE5 GLITLIRLNSHLHTPMYFFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFF
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CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
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CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
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CCDS31 LKLPYC-EHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
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CCDS31 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
240 250 260 270 280 290
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CCDS31 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
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CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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CCDS31 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]