Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5412, 310 aa
1>>>pF1KE5412 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2336+/-0.00142; mu= 10.2109+/- 0.081
mean_var=152.0176+/-50.250, 0's: 0 Z-trim(100.4): 395 B-trim: 346 in 1/46
Lambda= 0.104022
statistics sampled from 5617 (6086) to 5617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 1.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 2031 317.7 7.2e-87
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1620 256.0 2.6e-68
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1402 223.3 1.9e-58
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1233 198.0 8.2e-51
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1218 195.7 3.9e-50
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1167 188.0 7.7e-48
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1033 167.9 8.8e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1009 164.3 1.1e-40
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1006 163.9 1.5e-40
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1004 163.6 1.8e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1003 163.4 2e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 999 162.8 3e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 996 162.4 4.2e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 984 160.6 1.4e-39
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 983 160.4 1.6e-39
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 982 160.3 1.8e-39
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 976 159.5 3.6e-39
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 975 159.2 3.7e-39
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 972 158.8 5e-39
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 971 158.6 5.6e-39
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 964 157.6 1.2e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 963 157.4 1.3e-38
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 961 157.1 1.6e-38
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 960 157.0 1.8e-38
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 957 156.5 2.4e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 953 155.9 3.7e-38
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 948 155.2 6.1e-38
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 947 155.0 6.7e-38
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 947 155.1 7e-38
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 946 154.9 7.5e-38
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 944 154.6 9.2e-38
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 937 153.5 1.9e-37
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 936 153.4 2.3e-37
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 936 153.4 2.3e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 935 153.3 2.4e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 933 152.9 2.9e-37
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 933 152.9 2.9e-37
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 932 152.8 3.2e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 931 152.6 3.6e-37
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 928 152.2 4.9e-37
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 926 151.9 6e-37
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 925 151.7 6.6e-37
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 924 151.6 7.8e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 923 151.4 8.3e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 916 150.4 1.7e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 916 150.4 1.7e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 916 150.4 1.7e-36
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 915 150.2 1.9e-36
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 911 149.6 2.9e-36
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 906 148.9 4.8e-36
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 1673.1 bits: 317.7 E(32554): 7.2e-87
Smith-Waterman score: 2031; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCADP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFSTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEAVN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KAITKTYVRQ
::::::::::
CCDS31 KAITKTYVRQ
310
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1636 init1: 1617 opt: 1620 Z-score: 1339.8 bits: 256.0 E(32554): 2.6e-68
Smith-Waterman score: 1620; 76.8% identity (93.8% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMYFF
: :::::::: ::::: :.: :::::..::.::.::..:::::..::..::::..:::::
CCDS31 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAFDR
::::::.:: :::::::::::::::. :::.:.::::::.::::.::::..:::.:::::
CCDS31 LSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCADP
::: :::::::::::.::.:::. ::.::: .:: :::::::::::..::::::::::
CCDS31 YMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCADP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFSTCG
:::..::. . .:: :::..:::::::::.:..::: .:..:.::::::.::.:::::::
CCDS31 PLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEAVN
:::::: .:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
CCDS31 SHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKAMM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KAITKTYVRQ
:.:...
CCDS31 KVISRSC
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1417 init1: 1395 opt: 1402 Z-score: 1162.9 bits: 223.3 E(32554): 1.9e-58
Smith-Waterman score: 1402; 67.6% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (3-307:4-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMYF
: : :::: ::::: :.:::.:.:..:::.::.:. ::.:::.::. . :. ::::
CCDS31 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMYF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAFD
:::::::.:.:::::::::::: .::: :.::: .::::::.:::.::::.:::::::::
CCDS31 FLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAFD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 RYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCAD
:::: ::::::::.::..:: ::.:::::: ..:. :.:::.: ::: :::::::::
CCDS31 RYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCAD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFSTC
::::..::. .. ::..:...:: :...:: .. ::: : :.:..::..::.::::::
CCDS31 PPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFSTC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEAV
:::::::..::.: .::::: :..::::::::::::::::::::: .:::::::.::::.
CCDS31 GSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEAL
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 NKAIT-KTYVRQ
: .. : :
CCDS31 IKELSMKIYFS
310
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1223 init1: 1223 opt: 1233 Z-score: 1025.7 bits: 198.0 E(32554): 8.2e-51
Smith-Waterman score: 1233; 57.9% identity (85.1% similar) in 309 aa overlap (2-309:4-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMY
:: : :::: ::::: :. ..: ::::.:.::: ::. ::.:: . :::.:::
CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAF
:::.::::.:.:.::::::.::.:.::: :::::.::..:: .:::.: .: :.:: ::.
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCA
:::.: :.:: :.:.::...:. :..:::.::: .: :: :. : :::..::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFST
:::::..::. ...:...:.:.::.... :: ..:.:: .: .:..:.:::.::.:::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEA
:.:::: :..:::: . ::.: :.:.:::..:..::::: . :::::.::::::.:: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VNKAIT-KTYVRQ
... : :.. .
CCDS53 IQQMIRGKSFCKIAV
310
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1212 init1: 1212 opt: 1218 Z-score: 1013.6 bits: 195.7 E(32554): 3.9e-50
Smith-Waterman score: 1218; 58.6% identity (85.4% similar) in 302 aa overlap (2-303:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMY
:: : :::: ::::: :. ..: ::::.:.::: ::. ::.:: . .::.:::
CCDS53 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAF
:::.::::.:.:.::::::.::.:.::: :::::.::..:: .:::.: .: :::: ::.
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCA
:::.: :.:: :.:.::...:: :...::.::: .. .: :. : :::..::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFST
:::::..::. ...:...:.:.::.:.. :: ..:.:: .: .:..:.:::.::.:::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEA
:.:::: :..:::: . ::.: :.:.:::..:..::::: . :::::.:::::: :: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VNKAITKTYVRQ
... :
CCDS53 MQQMIRGKSFHKIAV
310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1186 init1: 852 opt: 1167 Z-score: 972.4 bits: 188.0 E(32554): 7.7e-48
Smith-Waterman score: 1167; 55.5% identity (86.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMY
: . .::: ::::: ::: :.::.::.::..:::::.:::.:. .. .:..:::
CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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300
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