Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5410
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5410, 312 aa
1>>>pF1KE5410 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8470+/-0.00111; mu= 12.4075+/- 0.065
mean_var=191.4886+/-69.774, 0's: 0 Z-trim(104.0): 402 B-trim: 412 in 1/50
Lambda= 0.092684
statistics sampled from 7181 (7694) to 7181 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 2048 287.2 1.1e-77
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1800 254.0 1.1e-67
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1245 179.8 2.3e-45
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1210 175.1 6e-44
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1200 173.9 1.6e-43
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1197 173.4 2e-43
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1195 173.1 2.5e-43
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1185 171.8 6.2e-43
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1169 169.6 2.7e-42
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1165 169.1 4e-42
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1164 169.0 4.3e-42
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1156 167.9 9.1e-42
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1153 167.5 1.2e-41
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1147 166.7 2.1e-41
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1112 162.0 5.3e-40
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1108 161.5 7.7e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 990 145.7 4.4e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 983 144.8 8.4e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 982 144.7 9.6e-35
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 976 143.9 1.6e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 969 142.9 3e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 969 142.9 3e-34
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 965 142.4 4.4e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 960 141.7 7e-34
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 960 141.8 7.4e-34
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 959 141.5 7.5e-34
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 959 141.6 7.8e-34
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 953 140.8 1.4e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 946 139.9 2.6e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 943 139.4 3.4e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 942 139.3 3.7e-33
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 938 138.8 5.4e-33
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 937 138.6 6e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 936 138.5 6.6e-33
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 935 138.4 7.2e-33
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 933 138.1 8.6e-33
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 929 137.6 1.2e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 927 137.3 1.5e-32
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 924 136.9 2e-32
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 924 137.0 2.1e-32
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 923 136.8 2.2e-32
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 922 136.6 2.4e-32
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 922 136.7 2.4e-32
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 920 136.4 2.8e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 918 136.1 3.5e-32
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 917 136.0 3.8e-32
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 913 135.4 5.4e-32
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 913 135.4 5.4e-32
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 911 135.1 6.6e-32
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 909 134.9 7.9e-32
>>CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 2048 init1: 2048 opt: 2048 Z-score: 1508.0 bits: 287.2 E(32554): 1.1e-77
Smith-Waterman score: 2048; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RLLGKEMGLTQS
::::::::::::
CCDS34 RLLGKEMGLTQS
310
>>CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 (316 aa)
initn: 1800 init1: 1800 opt: 1800 Z-score: 1328.7 bits: 254.0 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1800; 88.2% identity (96.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
:::::: :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.: :.::::::::
CCDS46 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::::::
CCDS46 LSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
::::::::::::::::::::::::::::..::.:.::::::::::::: .:.:::.::::
CCDS46 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
.:::::: ::::::::.::.::...::::::::.:::: . :::::::: . ::::::::
CCDS46 SLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::. ::.:
CCDS46 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRALR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RLLGKEMGLTQS
::::::
CCDS46 RLLGKERDSRESWRAA
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1258 init1: 1236 opt: 1245 Z-score: 927.8 bits: 179.8 E(32554): 2.3e-45
Smith-Waterman score: 1245; 60.2% identity (86.2% similar) in 304 aa overlap (3-305:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
:.:: :.:::::.:: :: .::: :. :::::::: ::..: ::: ::.:::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
:::.:::.::::..:..:::: ::::..:. ::. :.... ::.::.: ....: :.::
CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
::::..:.: ::. ::. . :.::...:.: .:: .::: :: :::::.:...:.:::.:
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
:::::::: .::...: :::::.. :::..:::..:::.. ::.:::.:::::::.. .:
CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FRRLL-GKEMGLTQS
.:.:: ::
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1210 init1: 1210 opt: 1210 Z-score: 902.4 bits: 175.1 E(32554): 6e-44
Smith-Waterman score: 1210; 57.0% identity (83.3% similar) in 305 aa overlap (2-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHS
:: :: :.:.:::. : :: ..::::. ::.::.:: .::.:: :: .::.
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTV
:::::::::::::::.::: .::.:::::::.::::. : .:... :.::::::.::.:
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDF
:..:::.:::.::::....:::.: :: ..:: :...:.... :. .:.: :::: :
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKA
::::::.:::: :: ::. . ..: .....:: :::.:::::. :.::..:. : .:.
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEV
::::..:: .:.::. .. .:::: . .:..:::..:::.: :::::::::::::: :
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TRAFRRLLGKEMGLTQS
: .::.: :
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1200 init1: 1200 opt: 1200 Z-score: 894.6 bits: 173.9 E(32554): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 1200; 57.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (2-307:4-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
::.: :.:: ::..: :: ::. . ::.::. :: :::.: .: :::.:::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
:::::::.::::.::: :::::::. . .:.::. : .:.::::.::.:::.::.:: :
CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
::.::.:.::::. :.: :::.:::...:. :. .::.:. ::..:.: ..:: : ::
CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
::::..::: ::. :: .. ::..:..:..:::.::. :. :::::.::.:.::::::
CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
:.::: ::.:::...:..:::: .: ...:::. .:: .. .: ::::::::::::: .:
CCDS46 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FRRLLGKEMGLTQS
:.::..: .
CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
>>CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1196 init1: 1196 opt: 1197 Z-score: 893.0 bits: 173.4 E(32554): 2e-43
Smith-Waterman score: 1197; 59.2% identity (81.6% similar) in 309 aa overlap (2-308:4-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
::.:: ::.:.:.:.:: :: .:.... ::::::.::. ::::: :. .::.:::
CCDS10 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
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240 250 260 270 280 290
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300 310
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310
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CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
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CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
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310
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