Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5394, 309 aa
1>>>pF1KE5394 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0316+/-0.000576; mu= 17.6642+/- 0.036
mean_var=107.7935+/-28.373, 0's: 0 Z-trim(106.9): 275 B-trim: 891 in 1/49
Lambda= 0.123532
statistics sampled from 14622 (15005) to 14622 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 5.050
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1070 202.3 1e-51
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1000 189.8 6e-48
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 986 187.3 3.3e-47
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 949 180.7 3.2e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 949 180.7 3.2e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 949 180.7 3.3e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 906 173.1 6.6e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 906 173.1 6.6e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 906 173.1 6.6e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 889 170.0 5.4e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 878 168.1 2.1e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 857 164.3 2.8e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 839 161.1 2.6e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 823 158.3 1.8e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 812 156.3 7.5e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 811 156.1 8.2e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 804 154.9 1.9e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 797 153.6 4.6e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 790 152.4 1.1e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 781 150.8 3.3e-36
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 549 109.5 9.4e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 502 101.1 3.2e-21
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 214 49.8 9.4e-06
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 207 48.5 2.2e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 204 47.9 3e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 204 48.0 3.2e-05
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 196 46.6 8.7e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 192 45.9 0.00015
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 192 45.9 0.00015
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 187 44.9 0.00025
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 177 43.4 0.0011
XP_011530319 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 445) 171 42.3 0.0022
NP_001304021 (OMIM: 602001) neuropeptide Y recepto ( 445) 171 42.3 0.0022
NP_001304020 (OMIM: 602001) neuropeptide Y recepto ( 445) 171 42.3 0.0022
NP_006165 (OMIM: 602001) neuropeptide Y receptor t ( 445) 171 42.3 0.0022
XP_005263095 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 445) 171 42.3 0.0022
XP_016863744 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 171 42.3 0.0022
XP_011530317 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 171 42.3 0.0022
XP_016863745 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 171 42.3 0.0022
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 168 41.5 0.0026
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 168 41.6 0.0027
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 168 41.6 0.0029
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 168 41.6 0.0029
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 168 41.7 0.003
NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 167 41.4 0.0031
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 167 41.4 0.0031
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 168 41.7 0.0031
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 165 41.1 0.0042
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 165 41.1 0.0042
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 164 40.9 0.0048
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1115 init1: 1042 opt: 1070 Z-score: 1049.3 bits: 202.3 E(85289): 1e-51
Smith-Waterman score: 1070; 51.3% identity (81.0% similar) in 306 aa overlap (2-307:4-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALST
: .. ::::: .: : .... :: .::::. :: .....:..:::..:...:.::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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240 250 260 270 280 290
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::::.::. .::.: :. ::.::::.:.. ::.:::::...::::::..::::..::..:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300
pF1KE5 FKKVLRRQKFL
. .:. :..
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1014 init1: 994 opt: 1000 Z-score: 981.8 bits: 189.8 E(85289): 6e-48
Smith-Waterman score: 1000; 47.7% identity (80.6% similar) in 304 aa overlap (3-306:7-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTP
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFF
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pF1KE5 CDVPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQ
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300
pF1KE5 NAFKKVLRRQKFL
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 986; 46.4% identity (80.9% similar) in 304 aa overlap (3-306:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPM
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DVPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300
pF1KE5 AFKKVLRRQKFL
:.:.. .:.
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALST
: .. ::::: : .:::.. ... .. .: :. ::. : :.::. :.::. ::.::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KE5 FKKVLRRQKFL
.:::. : :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 999 init1: 924 opt: 949 Z-score: 932.8 bits: 180.7 E(85289): 3.2e-45
Smith-Waterman score: 949; 46.7% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (3-308:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY
: . :..:.::::. :. : ::..: .:: :. ::: ..: . .:::::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCD
:...:::.:::::. :: .. : :. : .: . ::. .: . :::: .: . :::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALST
: .. ::::: : .:::.. ... .. .: :. ::. : :.::. :.::. ::.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNA
:.::...: .::.:.: .:..: :::: . : ::.:.:... ::::: .:::::: ...:
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 FKKVLRRQKFL
.:::. : :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 999 init1: 924 opt: 949 Z-score: 932.6 bits: 180.7 E(85289): 3.3e-45
Smith-Waterman score: 949; 46.7% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (3-308:15-320)
10 20 30 40
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLIL
: . :..:.::::. :. : ::..: .:: :. ::: ..: .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 MDSCLHTPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATV
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ENYLLASMAYDRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCK
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SNLVHHFFCDVPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHS
.: . :::::: .. ::::: : .:::.. ... .. .: :. ::. : :.::. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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230 240 250 260 270 280
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290 300
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::::: ...:.:::. : :
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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..:.:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAY
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300
pF1KE5 FKKVLRRQKFL
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY
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pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 FKKVLRRQKFL
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]