Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5393
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5393, 309 aa
1>>>pF1KE5393 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3462+/-0.00133; mu= 15.5165+/- 0.079
mean_var=194.3634+/-72.561, 0's: 0 Z-trim(99.9): 382 B-trim: 347 in 1/46
Lambda= 0.091996
statistics sampled from 5470 (5917) to 5470 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 1.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 2019 281.7 5e-76
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1190 171.7 6.7e-43
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1180 170.3 1.7e-42
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1176 169.8 2.4e-42
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1168 168.8 5.1e-42
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1166 168.5 6e-42
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1160 167.7 1e-41
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1134 164.2 1.1e-40
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1132 163.9 1.4e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1127 163.3 2.2e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1122 162.6 3.5e-40
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1120 162.4 4.2e-40
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1118 162.1 5e-40
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1109 160.9 1.2e-39
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1105 160.4 1.7e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1103 160.1 2e-39
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1102 160.0 2.2e-39
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1101 159.8 2.4e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1098 159.5 3.2e-39
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1095 159.0 4.1e-39
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1093 158.8 5.1e-39
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1092 158.7 5.6e-39
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1091 158.5 6e-39
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1083 157.5 1.3e-38
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1080 157.1 1.7e-38
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1077 156.7 2.2e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1077 156.7 2.2e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1076 156.5 2.4e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1074 156.3 2.9e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1068 155.5 5e-38
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1063 154.8 7.9e-38
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1061 154.5 9.5e-38
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1054 153.6 1.8e-37
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1053 153.5 2e-37
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1053 153.5 2e-37
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1050 153.1 2.6e-37
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1049 153.0 3.1e-37
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1048 152.8 3.1e-37
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1048 152.8 3.1e-37
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1047 152.7 3.4e-37
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1034 151.0 1.1e-36
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1034 151.0 1.2e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1033 150.8 1.3e-36
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1032 150.7 1.4e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1032 150.7 1.4e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1030 150.5 1.8e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1026 149.9 2.4e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1024 149.6 2.9e-36
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1013 148.2 8.1e-36
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1011 147.9 9.4e-36
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 1478.4 bits: 281.7 E(32554): 5e-76
Smith-Waterman score: 2019; 99.7% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIVFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKKIIINKN
:::::::::
CCDS41 LKKIIINKN
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1196 init1: 1027 opt: 1190 Z-score: 883.7 bits: 171.7 E(32554): 6.7e-43
Smith-Waterman score: 1190; 58.1% identity (83.1% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
:: : :..:::::.:... ::..:::..:: .: .:..::::.: : .:. :.::::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
:::..::.... :.::.:::: ::: :... :: :::::: :: :..:: ..:: :::
CCDS31 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
:::::::::::::::.. .:. ::.. : :.: :. . .: .::: :::.::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIVFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
..::: :.:::: . . .: :. ..::.::.:::. :. .::.. :.:::.:::::
CCDS31 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTD-KMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKE
:.:::.:::::::::.:::.:: :.:.:::: ::::::::..:::::::::::.::.::
CCDS31 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 ALKKIIINKN
::.... :
CCDS31 ALQRFMTNLCYSFKTM
310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1197 init1: 1168 opt: 1180 Z-score: 876.5 bits: 170.3 E(32554): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 1180; 58.5% identity (83.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
: :..:::::::::: ::..:::..:: :::.:.:::::.: :: :. :.::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
:::.:.:.:: : ..:: ..: :. : .:: : .:: :::::.:.::.:.::.::
CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIVFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
::: :.:::. .... :: .:. . :.:....::.::. .:..:.: :::::::::
CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
:.::. ::.::::: :::::.:.::: . :::::::::...:::::::.:::.::::: :
CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKKIIINKN
.:: .
CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1208 init1: 1176 opt: 1176 Z-score: 873.6 bits: 169.8 E(32554): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 1176; 57.0% identity (82.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
:: : :..:::::.:... ::..:::..:: .:..:..::::.: : .:. :..:::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
::: .::.... :.::.:::: ::: :... :: :::::: :: :..:: ..:: :::
CCDS31 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
:::::::::::::::.. .:. ::.. : :.: :. . : .::: :::.::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIVFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
::: :.:::: . . .: :. .. :.. :.:::. :. .:::..: :::.:::::
CCDS31 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
:.:::.:::.::::..::::::...:.::::::::::::..:::::::::::.:..:. :
CCDS31 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKKIIINKN
:::.. :
CCDS31 LKKFMENPCYSFKSM
310
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1231 init1: 1154 opt: 1168 Z-score: 867.8 bits: 168.8 E(32554): 5.1e-42
Smith-Waterman score: 1168; 57.5% identity (81.7% similar) in 306 aa overlap (3-308:9-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTS
: :..:::::.:.::. :. ::: ::: ::: ::.::::...: :..
CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLL
:.::::::: .:...:. ::.::.:::: ::. ..:.::.. ::::. : :.::: ..
CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LASMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIV
:..::::::::::.::::...:. . :: ::: :: ...:: :: :.::.: :::.
CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NHFYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIVFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGR
..:::: .::. . :::: .: :. .: .. :: ::..:::::. :::::.: .::
CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QKAFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQN
::::::.::. .: .:::::.:.::::.:::.: :::::::::..:::::::::::.:
CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KEVKEALKKIIINKN
::::.:::. . :.
CCDS31 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
310
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1211 init1: 1157 opt: 1166 Z-score: 866.6 bits: 168.5 E(32554): 6e-42
Smith-Waterman score: 1166; 57.7% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
:.. : : :::::. :: . ::..::: .:: :::.:::::: .:.: . :. :.::::
CCDS31 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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CCDS84 LKKIL-NKNAFS
310
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CCDS53 LKNVLR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]