Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5391
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5391, 308 aa
1>>>pF1KE5391 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4607+/-0.00128; mu= 14.6743+/- 0.075
mean_var=139.7563+/-44.630, 0's: 0 Z-trim(101.5): 387 B-trim: 734 in 2/48
Lambda= 0.108490
statistics sampled from 6066 (6549) to 6066 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 1.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1977 321.9 3.8e-88
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1352 224.1 1.1e-58
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1312 217.8 8.3e-57
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1309 217.4 1.2e-56
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1305 216.7 1.8e-56
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1299 215.8 3.4e-56
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1299 215.8 3.5e-56
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1269 211.1 8.8e-55
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1230 205.0 6e-53
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1179 197.0 1.5e-50
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1161 194.2 1.1e-49
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1158 193.7 1.5e-49
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1126 188.8 5.2e-48
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1093 183.6 1.7e-46
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1082 181.8 5.7e-46
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1066 179.3 3.2e-45
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1061 178.6 5.5e-45
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1061 178.6 5.6e-45
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1059 178.3 7e-45
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1058 178.1 7.7e-45
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1056 177.8 9.5e-45
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1054 177.5 1.2e-44
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1054 177.5 1.2e-44
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1053 177.3 1.3e-44
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1049 176.7 2e-44
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1047 176.4 2.5e-44
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1045 176.1 3.1e-44
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1045 176.1 3.2e-44
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1044 175.9 3.6e-44
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1041 175.4 4.9e-44
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1038 174.9 6.7e-44
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1035 174.5 9.3e-44
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1028 173.4 2e-43
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1025 172.9 2.8e-43
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1023 172.6 3.4e-43
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1022 172.5 4e-43
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1021 172.3 4.3e-43
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1021 172.3 4.3e-43
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1018 171.9 6e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1015 171.3 8.1e-43
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1013 171.1 1e-42
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1008 170.2 1.7e-42
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1006 170.0 2.2e-42
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1004 169.6 2.7e-42
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1001 169.2 3.7e-42
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1000 169.0 4.2e-42
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 996 168.4 6.4e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 994 168.1 8.2e-42
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 989 167.3 1.4e-41
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 985 166.7 2.2e-41
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1977 init1: 1977 opt: 1977 Z-score: 1695.9 bits: 321.9 E(32554): 3.8e-88
Smith-Waterman score: 1977; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKVLVGK
::::::::
CCDS31 LRKVLVGK
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1346 init1: 1346 opt: 1352 Z-score: 1167.2 bits: 224.1 E(32554): 1.1e-58
Smith-Waterman score: 1352; 64.6% identity (88.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
:. :: : ...:.: ::..: :::::::::::::::::::::::: :: .: ::::::
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
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CCDS73 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
:::.::::::::..:.:. .: :.:.....:.. : .::. :....::: .:::::::
CCDS73 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
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CCDS73 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
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CCDS73 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKVLVGK
:.:.:
CCDS73 LKKMLQRRTLL
310
>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1296 init1: 1276 opt: 1312 Z-score: 1133.3 bits: 217.8 E(32554): 8.3e-57
Smith-Waterman score: 1312; 65.2% identity (87.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
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CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
::::::::.::::::::::::: .:: . .: :: ::.::::: : :..: :.:.:::
CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
:::::::::::: .::: :::::: :.: .:: .:. : . ...:::: :.::.:::::
CCDS31 DRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
..::..::::.:...:::.:.:.::: .. .:.. .:::::: :::.:.:..:: :::.:
CCDS31 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
::::: ::..:.::. ::.:: ::.:: ::::::::::::: :::::::::::..:..:
CCDS31 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRNA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKVLVGK
: :.:
CCDS31 LMKLLRRKISLSPG
310
>>CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 (346 aa)
initn: 1321 init1: 1301 opt: 1309 Z-score: 1130.4 bits: 217.4 E(32554): 1.2e-56
Smith-Waterman score: 1309; 63.0% identity (87.3% similar) in 308 aa overlap (1-308:36-342)
10 20 30
pF1KE5 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLL
:. ::.:....:.: :::...::::::::.
CCDS66 QGITFLQKENNNTIHLNTMFFLSPAETHQRMAAENHSFVTKFILVGLTEKSELQLPLFLV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 FLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKN
:::::::::.:::::: ::..: :::::: :::::::.:::.:.::::::::::. .::
CCDS66 FLGIYVVTVLGNLGMITLIGLSSHLHTPMYCFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 TILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFF
: : :::.::.::.::..:: ..:.::::: ::::::::::. :.:. .: :.:...
CCDS66 IISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDGYVAICSPLLYSIIISNKACFSLILVVYV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVP
.:.. : .: . :....::: .:::::::.. .:.::::.:..::::..:..:.: :::
CCDS66 IGLICASAHIGCMFRVQFCKFDVINHYFCDLISILKLSCSSTYINELLILIFSGINILVP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQ
.:.. :: ::. :::.:: .:::::::.:::::. :: .:::: .:::..: : .:.::
CCDS66 SLTILSSYIFIIASILRIRYTEGRSKAFSTCSSHISAVSVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE5 EKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKALRKVLVGK
:::::::: :.:::::::::::::::. ::.:.: ::
CCDS66 GKVSSVFYTIVVPMLNPLIYSLRNKDVHVALKKTL-GKRTFL
310 320 330 340
>>CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1350 init1: 1299 opt: 1305 Z-score: 1127.5 bits: 216.7 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 1305; 61.6% identity (87.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
:. :: :...::.: :::.: .:.:::.::::.::::::::::.: :: .. ::::::
CCDS84 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
.:: .:::.:::::::::::::..:. :::.: :. ::.:::::. :::.:...:.::::
CCDS84 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
:::::::.:::: . :: :: ::.:... .:: .:..::. :: ..:: ....:::.::
CCDS84 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
.::::. .:..:..:::..:...:.. :::... .:::.:: ::.:: :.:::::::.:
CCDS84 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
::::..:: .:::: .:::.:: : ...: ::::.:::::.:::::::::::::::: :
CCDS84 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKVLVGK
:.:.:
CCDS84 LKKILNKNAFS
310
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1312 init1: 1066 opt: 1299 Z-score: 1122.4 bits: 215.8 E(32554): 3.4e-56
Smith-Waterman score: 1299; 60.5% identity (89.5% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
: .: :....:.: :::.. :.: :::.::: .:.::.:::::.:.:.... ::::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNLGLIILFGLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
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CCDS31 FFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFFFCFFVVSESFILSAMAY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]