Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5388
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5388, 308 aa
1>>>pF1KE5388 308 - 308 aa - 308 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6021+/-0.00052; mu= 20.1104+/- 0.032
mean_var=106.6247+/-29.703, 0's: 0 Z-trim(108.0): 288 B-trim: 1083 in 1/49
Lambda= 0.124207
statistics sampled from 15623 (16034) to 15623 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 4.520
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 1029 195.9 9.3e-50
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 874 168.1 2.1e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 869 167.2 3.9e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 862 165.9 9.3e-41
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 862 165.9 9.3e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 862 165.9 9.4e-41
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 860 165.6 1.2e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 860 165.6 1.2e-40
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 832 160.5 3.8e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 829 160.0 5.6e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 816 157.7 2.8e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 807 156.1 8.5e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 796 154.1 3.4e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 783 151.8 1.7e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 778 150.9 3.1e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 775 150.3 4.6e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 767 148.9 1.2e-35
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 758 147.3 3.7e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 687 134.6 2.5e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 594 117.9 2.7e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 582 115.8 1.2e-25
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 228 52.4 1.5e-06
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 206 47.8 1.3e-05
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 211 49.4 1.4e-05
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 211 49.4 1.4e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 205 48.3 2.7e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 197 46.8 7e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 190 45.5 0.00016
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 191 45.8 0.00016
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 191 45.8 0.00016
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 190 45.5 0.00017
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 186 44.8 0.00028
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 186 44.8 0.00028
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 182 44.1 0.00046
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 182 44.1 0.00047
XP_011538931 (OMIM: 605051) PREDICTED: cannabinoid ( 360) 178 43.4 0.00079
XP_016855750 (OMIM: 605051) PREDICTED: cannabinoid ( 360) 178 43.4 0.00079
NP_001832 (OMIM: 605051) cannabinoid receptor 2 [H ( 360) 178 43.4 0.00079
NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335) 176 43.0 0.00097
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 175 43.0 0.0012
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 174 42.7 0.0013
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 175 43.0 0.0013
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 175 43.0 0.0013
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 175 43.0 0.0013
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 172 42.3 0.0016
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 173 42.7 0.0017
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 173 42.7 0.0017
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 171 42.3 0.002
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 171 42.3 0.002
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 1022 init1: 767 opt: 1029 Z-score: 1014.3 bits: 195.9 E(85289): 9.3e-50
Smith-Waterman score: 1029; 50.8% identity (79.3% similar) in 295 aa overlap (11-301:12-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPM
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pF1KE5 YFFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLG----RSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNK
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300
pF1KE5 EVRETLLKKWKGK
::...:
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 874; 45.7% identity (73.5% similar) in 302 aa overlap (1-301:1-302)
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pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQT-LQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPM
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pF1KE5 YDRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFC
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pF1KE5 DIAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFS
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pF1KE5 TCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRE
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300
pF1KE5 TLLKKWKGK
.:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 869; 44.2% identity (75.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
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pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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:.::::.....:.. .. ..: : . .:. :.. :. ::: :.:::.::.::.:::...
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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pF1KE5 LLKKWKGK
:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE5 LLKKWKGK
: :: :.
XP_011 L-KKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 872 init1: 850 opt: 862 Z-score: 852.8 bits: 165.9 E(85289): 9.3e-41
Smith-Waterman score: 862; 44.8% identity (72.7% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
:. :.. ..:::::. . : ::..:: ::. :: ::. :.. :: . ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE5 LLKKWKGK
: :: :.
NP_036 L-KKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 872 init1: 850 opt: 862 Z-score: 852.6 bits: 165.9 E(85289): 9.4e-41
Smith-Waterman score: 862; 44.8% identity (72.7% similar) in 308 aa overlap (1-308:11-317)
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pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVS
:. :.. ..:::::. . : ::..:: ::. :: ::. :.. ::
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 TSHQLHTPMYFFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 EYFLLAAMAYDRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PRAINHFFCDIAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPS
::.:::::..: . :.:..:. :.. . ...:... : ..::..: :.:..::
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ASGRSKAFSTCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIY
..:: ::::::.:::.:::..:.. . .. . . . . :: :::::.::::::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 TLRNKEVRETLLKKWKGK
.:::. .. .: :: :.
XP_011 SLRNRYLKGAL-KKVVGRVVFSV
310 320
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 853 init1: 822 opt: 860 Z-score: 850.7 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 860; 43.5% identity (74.2% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
: : :.: ..:.:::. .. ..:::.::::::..:: :: :..:. . .::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
:: .:.: :.:.::: . : :.::. ::: ::.. : ::. : .: . :.:. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVR--
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 -ETLLKKWKGK
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 853 init1: 822 opt: 860 Z-score: 850.7 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 860; 43.5% identity (74.2% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVR--
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 -ETLLKKWKGK
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 853 init1: 822 opt: 860 Z-score: 850.7 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 860; 43.5% identity (74.2% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
:: .:.: :.:.::: . : :.::. ::: ::.. : ::. : .: . :.:. :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
. . :::..:.. :.. .: ..:.... ....::. ::::::.: : ::.::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVR--
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 -ETLLKKWKGK
. :: :..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 866 init1: 825 opt: 832 Z-score: 823.7 bits: 160.5 E(85289): 3.8e-39
Smith-Waterman score: 832; 42.8% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (4-308:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPM
:: : :.:::: . :: .:::.:: ... :.....:. . .:::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFS-LGCTEYFLLAAM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]