Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5387, 308 aa
1>>>pF1KE5387 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4216+/-0.00134; mu= 9.3779+/- 0.077
mean_var=197.1823+/-75.281, 0's: 0 Z-trim(101.6): 437 B-trim: 355 in 1/49
Lambda= 0.091336
statistics sampled from 6024 (6571) to 6024 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 1.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 1959 271.7 4.9e-73
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1270 181.0 1.1e-45
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1038 150.4 1.7e-36
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1037 150.3 2e-36
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1019 147.9 9.7e-36
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1006 146.2 3.1e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1004 145.9 3.8e-35
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 995 144.7 8.6e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 994 144.6 9.3e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 983 143.1 2.6e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 977 142.3 4.4e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 974 141.9 5.8e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 974 141.9 5.8e-34
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 967 141.0 1.1e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 965 140.8 1.3e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 961 140.2 1.9e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 961 140.3 2e-33
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 957 139.7 2.8e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 956 139.6 3e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 954 139.3 3.6e-33
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 954 139.3 3.6e-33
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 952 139.1 4.8e-33
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 951 138.9 4.8e-33
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 951 138.9 4.8e-33
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 951 139.0 5.1e-33
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 948 138.5 6.3e-33
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 948 138.5 6.3e-33
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 947 138.4 7e-33
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 947 138.4 7.2e-33
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 946 138.3 8e-33
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 945 138.1 8.4e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 942 137.7 1.1e-32
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 942 137.7 1.1e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 942 137.7 1.1e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 936 136.9 1.9e-32
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 936 136.9 1.9e-32
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 935 136.8 2.1e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 930 136.1 3.3e-32
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 929 136.0 3.6e-32
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 927 135.7 4.3e-32
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 927 135.8 4.3e-32
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 927 135.8 4.3e-32
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 925 135.5 5.2e-32
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 924 135.4 5.8e-32
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 923 135.2 6.1e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 923 135.2 6.2e-32
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 921 135.0 7.4e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 920 134.9 8.6e-32
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 919 134.7 8.9e-32
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 919 134.7 8.9e-32
>>CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1959 init1: 1959 opt: 1959 Z-score: 1424.7 bits: 271.7 E(32554): 4.9e-73
Smith-Waterman score: 1959; 99.4% identity (99.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFTLRLPYRGSNSIAHFFCE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 APALLILASTDTHASEMAIFLTGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALR
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVATRNFP
::::::::
CCDS31 KVATRNFP
>>CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 1292 init1: 1100 opt: 1270 Z-score: 933.7 bits: 181.0 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1270; 63.8% identity (84.4% similar) in 307 aa overlap (1-305:17-323)
10 20 30 40
pF1KE5 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLL
: . ::: :..:..::::. .:. ::::..: .::.::::: :
CCDS31 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 LISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFF
.: :. .::.::::::::: :::.:::::::.::::.:::.: ..:.:.: : .... :
CCDS31 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNLSFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 LIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFTL
:. :::.::::::::::::::.:.:: : .::: .::. :. ::.:: :::.:::.::.
CCDS31 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSWASGALVSLVDTSFTF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLTGVVILLIPVFLILVSYGRIIVT
.::: :.: : :.::: :::: ::: ::...::::: :::::: :: ::: :: :: :
CCDS31 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPM
:..:.: : :::::::::::.::.:::::.:.::: : :..:. .: .::::. ::::
CCDS31 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 LNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
:::.::::::::::.::::.. :
CCDS31 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
310 320 330
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1021 init1: 903 opt: 1038 Z-score: 768.7 bits: 150.4 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1038; 48.8% identity (82.2% similar) in 303 aa overlap (5-305:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
:.:.::::.:::....:. . ::: .:..: ::.:::.:..... :: :.::::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
::: :::: ..::. .::. :: :.: .:.:.:. :.... ::..:: ..: ::..:.:
CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFTLRLPYRGSNSIAHFFCE
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CCDS31 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 APALLILASTDTHASEMAIFLTGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
.: .: :...:: :: . . ......: :::::: :::.:...:.:..: :::::
CCDS31 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
:.:::.:: ::::.: .::. :::... : : ::. :...::::::.::.:::..::.:
CCDS31 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRKVATRNFP
.... :.
CCDS31 VKRTITQKVLQKLDVF
310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1035 init1: 892 opt: 1037 Z-score: 767.4 bits: 150.3 E(32554): 2e-36
Smith-Waterman score: 1037; 50.8% identity (78.6% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
: .:.. ::.:: .:: : : :...: :..:..::: .: . ::: .::::::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
::: :::: :::..:. ::: ::.. . .:::.. :.:.:..:: .: :.: ::::: .
CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFTLRLPYRGSNSIAHFFCE
::.:::: ::.: :: ..: :::..:: ::. ::...:.::..: : . . :::::
CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 APALLILASTDTHASEMAIFLTGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
.:::: :. .:: :.: .:. .:..::::: :::.::. :. .:....:. :. :::.:
CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
:::::.:: ::::.:: :. : : ::.. : ::.: .:..::::::::.::::.:: :
CCDS46 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRKVATRNFP
.........
CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 917 init1: 854 opt: 1019 Z-score: 755.1 bits: 147.9 E(32554): 9.7e-36
Smith-Waterman score: 1019; 49.7% identity (79.8% similar) in 302 aa overlap (1-300:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
:.. :... :::::.:: :. :..:: ..: :....::: :: . .::.::::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
::: ::: .:.::.:...:: :: . .. :.... :.:.: . .: ..: :::::.:
CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFTLRLPYRGSNSIAHFFCE
:::.:.: :::: :: . :..:: :.: ::...:... ..:..:: : .. :.:::
CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 APALLILASTDTHASEMAIFLTGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
.:.:. :: .:: .: .:...::.:..::.::::::: : .:...::..: :::.:
CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
:.:::.:::.:::. :. :. : . ::.: : ::.::.::::.:::.::.:::::::.:
CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRKVATRNFP
::
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
>>CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 1018 init1: 836 opt: 1006 Z-score: 745.9 bits: 146.2 E(32554): 3.1e-35
Smith-Waterman score: 1006; 50.8% identity (78.3% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
: .:.. . ::.:::.:: : : :..:.: : ::..::: .: . ..:..::::::
CCDS46 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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310
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CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
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CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
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CCDS46 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
310 320
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CCDS34 FFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNIGCNKKTISYAGCVAHLIIFLALGATECLLLAVMSF
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310
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CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
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