Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5384, 307 aa
1>>>pF1KE5384 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4711+/-0.00142; mu= 14.3831+/- 0.083
mean_var=128.8788+/-45.631, 0's: 0 Z-trim(99.7): 386 B-trim: 677 in 2/46
Lambda= 0.112975
statistics sampled from 5349 (5835) to 5349 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.499), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 1.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 2000 338.4 4.3e-93
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1616 275.8 3e-74
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1427 245.0 5.6e-65
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1226 212.2 4.1e-55
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1221 211.4 7.2e-55
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1205 208.8 4.3e-54
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1045 182.7 3.1e-46
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1044 182.5 3.4e-46
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1040 181.9 5.5e-46
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1034 180.9 1.1e-45
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1033 180.8 1.2e-45
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1021 178.8 4.6e-45
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1018 178.3 6.6e-45
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1015 177.9 9.4e-45
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1012 177.3 1.3e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 990 173.8 1.6e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 983 172.6 3.5e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 970 170.5 1.5e-42
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 968 170.2 1.9e-42
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 965 169.7 2.6e-42
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 960 168.9 4.6e-42
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 960 168.9 5e-42
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 959 168.7 5.1e-42
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 959 168.7 5.1e-42
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 956 168.2 7.2e-42
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 955 168.1 8.1e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 954 167.9 9.2e-42
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 951 167.4 1.3e-41
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 950 167.3 1.5e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 947 166.8 2e-41
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 946 166.6 2.2e-41
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 944 166.3 2.8e-41
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 943 166.1 3.1e-41
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 941 165.8 3.9e-41
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 940 165.6 4.4e-41
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 938 165.3 5.5e-41
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 937 165.1 6.2e-41
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 936 164.9 6.9e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 933 164.5 9.7e-41
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 932 164.3 1.1e-40
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 931 164.2 1.3e-40
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 930 164.0 1.4e-40
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 927 163.5 1.9e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 923 162.9 3.2e-40
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 921 162.5 3.8e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 921 162.5 3.8e-40
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 920 162.3 4.2e-40
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 916 161.7 6.7e-40
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 914 161.4 8.2e-40
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 913 161.2 9.2e-40
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 2000 init1: 2000 opt: 2000 Z-score: 1784.9 bits: 338.4 E(32554): 4.3e-93
Smith-Waterman score: 2000; 99.7% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLFSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAFDR
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCADP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFSTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKAMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKAMM
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVISRSC
:::::::
CCDS31 KVISRSC
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1613 init1: 1613 opt: 1616 Z-score: 1446.6 bits: 275.8 E(32554): 3e-74
Smith-Waterman score: 1616; 76.5% identity (93.8% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMYFF
: :::::::: ::::: :.: :::::..::.::.::..:::::..::..::::..:::::
CCDS31 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLFSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAFDR
::::::.:: :::::::::::::.:. :::.:.::::::.::::.::::..:::.:::::
CCDS31 LSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCADP
::: :::::::::::.::.:::. ::.::: .:: :::::::::::..::::::::::
CCDS31 YMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCADP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFSTCG
:::..::. . .:: :::..:::::::::.:..::: .:..:.::::::.::.:::::::
CCDS31 PLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKAMM
:::::: .:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
CCDS31 SHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEAVN
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVISRSC
:.:...
CCDS31 KAITKTYVRQ
310
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1421 init1: 1421 opt: 1427 Z-score: 1280.1 bits: 245.0 E(32554): 5.6e-65
Smith-Waterman score: 1427; 70.5% identity (89.4% similar) in 302 aa overlap (3-304:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMYF
: : :::::::::::::: :.:.: .::..:..:..::.::.:::... :. ::::
CCDS31 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMYF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLFSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAFD
:::::::::. ::::::::::: ..:.::.:.: .:::::..:::::::::.:::.::::
CCDS31 FLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAFD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 RYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCAD
::::: :::::::.::. :: ::: ::.:: ::.: :.:::.: ::: :::::::::
CCDS31 RYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCAD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFSTC
:::::.::. :. :: .:.:.:: :...:: .: ::::.:. :::..::.::::::::::
CCDS31 PPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFSTC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKAM
::::::: :::.::.::::: :..::::::::::::::::::::: .:::::::.::.:.
CCDS31 GSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEAL
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MKVISRSC
.: .:
CCDS31 IKELSMKIYFS
310
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1217 init1: 1217 opt: 1226 Z-score: 1103.0 bits: 212.2 E(32554): 4.1e-55
Smith-Waterman score: 1226; 59.1% identity (88.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMY
: : ::::::::::. . ..: .::..:.::..::. :..::... ::..:::
CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLFSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAF
:::.::::::. .::::::.::.:..:..:::.::::..::..::::: .:...::.::.
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCA
:::.:: .:: :.:.::. .:: :.: ::.::::..:. :: :. : :::..::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFST
::::: .::. : ::...:...::.... :: .:..:::::. ::.:.::::::.:::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKA
:.:::: : .:::::. ::.: :.:.:::..:..::::: . :::::.::::::.:: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MMKVISRSC
....:
CCDS53 IQQMIRGKSFCKIAV
310
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1258 init1: 1214 opt: 1221 Z-score: 1098.5 bits: 211.4 E(32554): 7.2e-55
Smith-Waterman score: 1221; 58.8% identity (88.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMY
: : ::::::::::. . ..: .::..:.::..::. :..::... .:..:::
CCDS53 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLFSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAF
:::.::::::. .::::::.::.:..:..:::.::::..::..::::: .:..:::.::.
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCA
:::.:: .:: :.:.::. .:. :.:.::.::::.... .: :. : :::..::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFST
::::: .::. : ::...:...::.:.. :: .:..:::::. ::.:.::::::.:::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKA
:.:::: : .:::::. ::.: :.:.:::..:..::::: . :::::.:::::: :: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MMKVISRSC
:...:
CCDS53 MQQMIRGKSFHKIAV
310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1230 init1: 913 opt: 1205 Z-score: 1084.6 bits: 208.8 E(32554): 4.3e-54
Smith-Waterman score: 1205; 57.8% identity (86.0% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMY
: . .:::::::::. : : :.:..:::::..:..::.::..:.... .:..:::
CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLFSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAF
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120 130 140 150 160 170
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CCDS53 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
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CCDS53 LKNVLR
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CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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300
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CCDS31 LANVISRKRTSSFL
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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