Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5383, 307 aa
1>>>pF1KE5383 307 - 307 aa - 307 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0184+/-0.00055; mu= 16.7897+/- 0.034
mean_var=61.7084+/-13.129, 0's: 0 Z-trim(105.8): 107 B-trim: 878 in 1/46
Lambda= 0.163268
statistics sampled from 13835 (13942) to 13835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.478), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16
Scan time: 5.660
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 1981 475.9 4.5e-134
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 794 196.3 6.8e-50
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 752 186.4 6.4e-47
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 705 175.3 1.4e-43
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 656 163.8 4.2e-40
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 645 161.2 2.5e-39
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 641 160.2 4.8e-39
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 631 157.9 2.4e-38
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 618 154.8 2e-37
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 610 152.9 7.4e-37
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 601 150.8 3.2e-36
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 588 147.8 2.8e-35
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 578 145.4 1.4e-34
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 572 144.0 3.6e-34
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 572 144.0 3.6e-34
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 572 144.0 3.6e-34
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 567 142.8 8.1e-34
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 524 132.7 9.1e-31
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 485 123.5 5.3e-28
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 470 119.9 6.1e-27
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 444 113.8 4.5e-25
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 387 100.4 4.8e-21
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 384 99.7 7.7e-21
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 333 87.7 3.3e-17
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 293 78.2 2.1e-14
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 231 63.7 5.9e-10
NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 177 51.0 4.1e-06
NP_997055 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S rec ( 371) 160 47.0 7e-05
NP_997056 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S rec ( 377) 160 47.0 7.1e-05
NP_001287864 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S ( 390) 160 47.0 7.3e-05
NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 141 42.5 0.0015
NP_001269115 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 137 41.5 0.0028
NP_001269117 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 137 41.5 0.0028
NP_006630 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene rec ( 337) 137 41.5 0.0028
NP_001269116 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 137 41.5 0.0028
NP_005192 (OMIM: 601834) C-C chemokine receptor ty ( 355) 136 41.3 0.0034
NP_001287862 (OMIM: 608584,608595) neuropeptide S ( 366) 132 40.4 0.0067
>>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa)
initn: 1981 init1: 1981 opt: 1981 Z-score: 2528.0 bits: 475.9 E(85289): 4.5e-134
Smith-Waterman score: 1981; 99.7% identity (99.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIWI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 IITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFLW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYFIKQILLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_076 LKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFIKQILLNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFILYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 GVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFILYF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 IGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RKNLRVT
:::::::
NP_076 RKNLRVT
>>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa)
initn: 738 init1: 362 opt: 794 Z-score: 1016.7 bits: 196.3 E(85289): 6.8e-50
Smith-Waterman score: 794; 41.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (5-295:5-303)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
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NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLISSLLNFAYIAKILNDY------KMKNDTVWDLNMYKSEYF
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NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
...:::.... : . :.. ..::.:: :: :.:: ..:: :: .:::::.:.:..:::
NP_076 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
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NP_076 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT
..
NP_076 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa)
initn: 758 init1: 368 opt: 752 Z-score: 963.4 bits: 186.4 E(85289): 6.4e-47
Smith-Waterman score: 752; 41.2% identity (74.6% similar) in 311 aa overlap (1-302:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
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NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILND------YKMKNDT--VWDLNMYKSEY
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NP_076 WLKLKINKV---MLAILLGSFLISLI-ISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FIKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLIS
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NP_076 TFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVII
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FIILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRV
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NP_076 FLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKM
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 LQQLKCCEKRKNLRVT
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NP_076 LRFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 637 init1: 328 opt: 705 Z-score: 903.6 bits: 175.3 E(85289): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 705; 38.4% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
:. ...:::.....: ..:.::::.:.::: :: :.:.::. .:::.:.:.:: ::
NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILN-DY------KMKNDTVWDLNMYKSEYF
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NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
:.:: .: : .:::. ..:. :::::..:.. .:: :: .::.::.:.:.. ::
NP_076 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
:..:.::.:. . . . . :: . :: .. .:: :::.:::. :.::.:. .:.:
NP_076 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 --QQLKCCEKRKNLRVT
... :
NP_076 TCRKIACMI
>>NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 member (317 aa)
initn: 577 init1: 293 opt: 656 Z-score: 841.0 bits: 163.8 E(85289): 4.2e-40
Smith-Waterman score: 656; 39.5% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-296:4-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW
:...:: ::.. : ..: :::.::.:::::: .:. :.:.. :::.:::::: :.:
NP_076 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
.:. . ...: : ..:. ....... .:.. :. :.:.::.:. ::::::::::: :::
NP_076 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKI-------LNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYF
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NP_076 YLKWRVKKVV---LVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTR--F
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKQILLNLGVIFF--FTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLI
. :.:. :..: ::::: ..::.:.:.: ..:: .: :..:.:: ...: .:
NP_076 SSLIVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 SFIILFILYFIGMAIEI-SCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASL
.:..:. .. ... : . . ..:: :...... :: :: .:::::.::.::::
NP_076 TFFLLYAIFSLSFFISVWTSERLEEN--LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASL
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 RVLQQLKCCEKRKNLRVT
:: :.
NP_076 SVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
300 310
>>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa)
initn: 622 init1: 309 opt: 645 Z-score: 827.1 bits: 161.2 E(85289): 2.5e-39
Smith-Waterman score: 645; 39.2% identity (68.5% similar) in 311 aa overlap (1-303:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW
: .. ::......: ....::: ::::::: . :: :. . :::: :::: : .
NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
.:. :.:. .. ..:.. : . . ..: . :. . :.:: ::::::.:::.: . .::
NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKSRTN-MVLPFMIV--FLLI-SSLLNFAYIAKILNDYKMKNDTVWDLNMYKSEY---F
::. : : :.. ..:. :::: .::. .: :: .: :.. :. :. :
NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
: . ::.: .. :.: : . .::..:: ::.:... . : :::.:::: .:::...::
NP_852 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
..:::..:... . : . :. . : : . .: ::::::::::::.:...:.:
NP_852 LFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLL
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT
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pF1KE5 FILYFIGMAIE-ISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQ
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NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVE--VRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
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NP_795 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDAT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]